Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12651
• Subject: NM_001193334.1
• Aligned Length: 1372
• Identities: 1288
• Gaps: 71

Alignment

Query    1  ATGGAGATGAGTCCTTGGTTCCAATT--------CAT--GCTGTTTATCCTGCAGCTGGACATTG---------  55
            ||||         ||.||  .|||||        |||  ||     |.|..|.|||||..|||||         
Sbjct    1  ATGG---------CTGGG--GCAATTATAGAAAACATGAGC-----ACCAAGAAGCTGTGCATTGTTGGTGGGA  58

Query   56  -CCT--TCAAGCTAAACAACCAAATCA---------------------------GAGAAAATGCAGAAGTCTCC  99
             .||  ||..|.|      ||||||||                           ||||||||||||||||||||
Sbjct   59  TTCTGCTCGTGTT------CCAAATCATCGCCTTTCTGGTGGGAGGCTTGATTGGAGAAAATGCAGAAGTCTCC  126

Query  100  ATGGACGTTTCCCTGGCTTACCGTGATGACGCATTTGCTGAGTGGACTGAAATGGCCCATGAAAGAGTACCACG  173
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  127  ATGGACGTTTCCCTGGCTTACCGTGATGACGCGTTTGCTGAGTGGACTGAAATGGCCCATGAAAGAGTACCACG  200

Query  174  GAAACTCAAATGCACCTTCACATCTCCCAAGACTCCAGAGCATGAGGGCCGTTACTATGAATGTGATGTCCTTC  247
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  201  GAAACTCAAATGCACCTTCACATCTCCCAAGACTCCAGAGCATGAGGGCCGTTACTATGAATGTGATGTCCTTC  274

Query  248  CTTTCATGGAAATTGGGTCTGTGGCCCATAAGTTTTACCTTTTAAACATCCGGCTGCCTGTGAATGAGAAGAAG  321
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  275  CTTTCATGGAAATTGGGTCTGTGGCCCATAAGTTTTACCTTTTAAACATCCGGCTGCCTGTGAATGAGAAGAAG  348

Query  322  AAAATCAATGTGGGAATTGGGGAGATAAAGGATATCCGGTTGGTGGGGATCCACCAAAATGGAGGCTTCACCAA  395
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  349  AAAATCAATGTGGGAATTGGGGAGATAAAGGATATCCGGTTGGTGGGGATCCACCAAAATGGAGGCTTCACCAA  422

Query  396  GGTGTGGTTTGCCATGAAGACCTTCCTTACGCCCAGCATCTTCATCATTATGGTGTGGTATTGGAGGAGGATCA  469
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  423  GGTGTGGTTTGCCATGAAGACCTTCCTTACGCCCAGCATCTTCATCATTATGGTGTGGTATTGGAGGAGGATCA  496

Query  470  CCATGATGTCCCGACCCCCAGTGCTTCTGGAAAAAGTCATCTTTGCCCTTGGGATTTCCATGACCTTTATCAAT  543
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  497  CCATGATGTCCCGACCCCCAGTGCTTCTGGAAAAAGTCATCTTTGCCCTTGGGATTTCCATGACCTTTATCAAT  570

Query  544  ATCCCAGTGGAATGGTTTTCCATCGGGTTTGACTGGACCTGGATGCTGCTGTTTGGTGACATCCGACAGGGCAT  617
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  571  ATCCCAGTGGAATGGTTTTCCATCGGGTTTGACTGGACCTGGATGCTGCTGTTTGGTGACATCCGACAGGGCAT  644

Query  618  CTTCTATGCGATGCTTCTGTCCTTCTGGATCATCTTCTGTGGCGAGCACATGATGGATCAGCACGAGCGGAACC  691
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  645  CTTCTATGCGATGCTTCTGTCCTTCTGGATCATCTTCTGTGGCGAGCACATGATGGATCAGCACGAGCGGAACC  718

Query  692  ACATCGCAGGGTATTGGAAGCAAGTCGGACCCATTGCCGTTGGCTCCTTCTGCCTCTTCATATTTGACATGTGT  765
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719  ACATCGCAGGGTATTGGAAGCAAGTCGGACCCATTGCCGTTGGCTCCTTCTGCCTCTTCATATTTGACATGTGT  792

Query  766  GAGAGAGGGGTACAACTCACGAATCCCTTCTACAGTATCTGGACTACAGACATTGGAACAGAGCTGGCCATGGC  839
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  793  GAGAGAGGGGTACAACTCACGAATCCCTTCTACAGTATCTGGACTACAGACATTGGAACAGAGCTGGCCATGGC  866

Query  840  CTTCATCATCGTGGCTGGAATCTGCCTCTGCCTCTACTTCCTGTTTCTATGCTTCATGGTATTTCAGGTGTTTC  913
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  CTTCATCATCGTGGCTGGAATCTGCCTCTGCCTCTACTTCCTGTTTCTATGCTTCATGGTATTTCAGGTGTTTC  940

Query  914  GGAACATCAGTGGGAAGCAGTCCAGCCTGCCAGCTATGAGCAAAGTCCGGCGGCTACACTATGAGGGGCTAATT  987
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  941  GGAACATCAGTGGGAAGCAGTCCAGCCTGCCAGCTATGAGCAAAGTCCGGCGGCTACACTATGAGGGGCTAATT  1014

Query  988  TTTAGGTTCAAGTTCCTCATGCTTATCACCTTGGCCTGCGCTGCCATGACTGTCATCTTCTTCATCGTTAGTCA  1061
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015  TTTAGGTTCAAGTTCCTCATGCTTATCACCTTGGCCTGCGCTGCCATGACTGTCATCTTCTTCATCGTTAGTCA  1088

Query 1062  GGTAACGGAAGGCCATTGGAAATGGGGCGGCGTCACAGTCCAAGTGAACAGTGCCTTTTTCACAGGCATCTATG  1135
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089  GGTAACGGAAGGCCATTGGAAATGGGGCGGCGTCACAGTCCAAGTGAACAGTGCCTTTTTCACAGGCATCTATG  1162

Query 1136  GGATGTGGAATCTGTATGTCTTTGCTCTGATGTTCTTGTATGCACCATCCCATAAAAACTATGGAGAAGACCAG  1209
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163  GGATGTGGAATCTGTATGTCTTTGCTCTGATGTTCTTGTATGCACCATCCCATAAAAACTATGGAGAAGACCAG  1236

Query 1210  TCCAATGGCGATCTGGGTGTCCATAGTGGGGAAGAACTCCAGCTCACCACCACTATCACCCATGTGGACGGACC  1283
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237  TCCAATGGCGATCTGGGTGTCCATAGTGGGGAAGAACTCCAGCTCACCACCACTATCACCCATGTGGACGGACC  1310

Query 1284  CACTGAGATCTACAAGTTGACCCGCAAGGAGGCCCAGGAG  1323
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311  CACTGAGATCTACAAGTTGACCCGCAAGGAGGCCCAGGAG  1350