Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12651
• Subject: XM_011542192.3
• Aligned Length: 1533
• Identities: 1262
• Gaps: 243

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTCGGTGAAATGTGTGGATGCCCGTAAGAACCATCACAAGACAAAATGGTTCGTGCCTTGGGGACCCAATCA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TTGTGACAAGATCCGAGACATTGAAGAGGCAATTCCAAGGGAAATTGAAGCCAATGACATCGTGTTTTCTGTTC  148

Query    1  -----------------ATGGAGATGAGTCCTTGGTTCCAATTCATGCTGTTTATCCTGCAGCTGGACATTGCC  57
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACATTCCCCTCCCCCACATGGAGATGAGTCCTTGGTTCCAATTCATGCTGTTTATCCTGCAGCTGGACATTGCC  222

Query   58  TTCAAGCTAAACAACCAAATCAGAGAAAATGCAGAAGTCTCCATGGACGTTTCCCTGGCTTACCGTGATGACGC  131
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCAAGCTAAACAACCAAATCAGAGAAAATGCAGAAGTCTCCATGGACGTTTCCCTGGCTTACCGTGATGACGC  296

Query  132  ATTTGCTGAGTGGACTGAAATGGCCCATGAAAGAGTACCACGGAAACTCAAATGCACCTTCACATCTCCCAAGA  205
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTTTGCTGAGTGGACTGAAATGGCCCATGAAAGAGTACCACGGAAACTCAAATGCACCTTCACATCTCCCAAGA  370

Query  206  CTCCAGAGCATGAGGGCCGTTACTATGAATGTGATGTCCTTCCTTTCATGGAAATTGGGTCTGTGGCCCATAAG  279
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCCAGAGCATGAGGGCCGTTACTATGAATGTGATGTCCTTCCTTTCATGGAAATTGGGTCTGTGGCCCATAAG  444

Query  280  TTTTACCTTTTAAACATCCGGCTGCCTGTGAATGAGAAGAAGAAAATCAATGTGGGAATTGGGGAGATAAAGGA  353
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTTACCTTTTAAACATCCGGCTGCCTGTGAATGAGAAGAAGAAAATCAATGTGGGAATTGGGGAGATAAAGGA  518

Query  354  TATCCGGTTGGTGGGGATCCACCAAAATGGAGGCTTCACCAAGGTGTGGTTTGCCATGAAGACCTTCCTTACGC  427
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TATCCGGTTGGTGGGGATCCACCAAAATGGAGGCTTCACCAAGGTGTGGTTTGCCATGAAGACCTTCCTTACGC  592

Query  428  CCAGCATCTTCATCATTATGGTGTGGTATTGGAGGAGGATCACCATGATGTCCCGACCCCCAGTGCTTCTGGAA  501
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAGCATCTTCATCATTATGGTGTGGTATTGGAGGAGGATCACCATGATGTCCCGACCCCCAGTGCTTCTGGAA  666

Query  502  AAAGTCATCTTTGCCCTTGGGATTTCCATGACCTTTATCAATATCCCAGTGGAATGGTTTTCCATCGGGTTTGA  575
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAGTCATCTTTGCCCTTGGGATTTCCATGACCTTTATCAATATCCCAGTGGAATGGTTTTCCATCGGGTTTGA  740

Query  576  CTGGACCTGGATGCTGCTGTTTGGTGACATCCGACAGGGCATCTTCTATGCGATGCTTCTGTCCTTCTGGATCA  649
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGGACCTGGATGCTGCTGTTTGGTGACATCCGACAGGGCATCTTCTATGCGATGCTTCTGTCCTTCTGGATCA  814

Query  650  TCTTCTGTGGCGAGCACATGATGGATCAGCACGAGCGGAACCACATCGCAGGGTATTGGAAGCAAGTCGGACCC  723
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTTCTGTGGCGAGCACATGATGGATCAGCACGAGCGGAACCACATCGCAGGGTATTGGAAGCAAGTCGGACCC  888

Query  724  ATTGCCGTTGGCTCCTTCTGCCTCTTCATATTTGACATGTGTGAGAGAGGGGTACAACTCACGAATCCCTTCTA  797
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTGCCGTTGGCTCCTTCTGCCTCTTCATATTTGACATGTGTGAGAGAGGGGTACAACTCACGAATCCCTTCTA  962

Query  798  CAGTATCTGGACTACAGACATTGGAACAGAGCTGGCCATGGCCTTCATCATCGTGGCTGGAATCTGCCTCTGCC  871
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGTATCTGGACTACAGACATTGGAACAGAGCTGGCCATGGCCTTCATCATCGTGGCTGGAATCTGCCTCTGCC  1036

Query  872  TCTACTTCCTGTTTCTATGCTTCATGGTATTTCAGGTGTTTCGGAACATCAGTGGGAAGCAGTCCAGCCTGCCA  945
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCTACTTCCTGTTTCTATGCTTCATGGTATTTCAGGTGTTTCGGAACATCAGTGGGAAGCAGTCCAGCCTGCCA  1110

Query  946  GCTATGAGCAAAGTCCGGCGGCTACACTATGAGGGGCTAATTTTTAGGTTCAAGTTCCTCATGCTTATCACCTT  1019
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCTATGAGCAAAGTCCGGCGGCTACACTATGAGGGGCTAATTTTTAGGTTCAAGTTCCTCATGCTTATCACCTT  1184

Query 1020  GGCCTGCGCTGCCATGACTGTCATCTTCTTCATCGTTAGTCAGGTAACGGAAGGCCATTGGAAATGGGGCGGCG  1093
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCCTGCGCTGCCATGACTGTCATCTTCTTCATCGTTAGTCAGGTAACGGAAGGCCATTGGAAATGGGGCGGCG  1258

Query 1094  TCACAGTCCAAGTGAACAGTGCCTTTTTCACAGGCATCTATGGGATGTGGAATCTGTATGTCTTTGCTCTGATG  1167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCACAGTCCAAGTGAACAGTGCCTTTTTCACAGGCATCTATGGGATGTGGAATCTGTATGTCTTTGCTCTGATG  1332

Query 1168  TTCTTGTATGCACCATCCCATAAAAACTATGGAGAAGACCAGTCCAATGG----------CGATCT-------G  1224
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |.||.|       |
Sbjct 1333  TTCTTGTATGCACCATCCCATAAAAACTATGGAGAAGACCAGTCCAATGGAATGCAACTCCCATGTAAATCGAG  1406

Query 1225  GG-----TGTCCATAGTGGG--------------GAAGAACTCCAGCTCACCACCACTA---------TCACCC  1270
            ||     |||.|.|.||..|              .|||||.|   |.|||.|.|..|.|         |||.|.
Sbjct 1407  GGAAGATTGTGCTTTGTTTGTTTCGGAACTTTATCAAGAATT---GTTCAGCGCTTCGAAATATTCCTTCATCA  1477

Query 1271  ATGTGGACGGACCCACTGAGATCTACAAGTTGACCCGCAAGGAGGCCCAGGAG  1323
            |||...|||.|.|..|||..||.                              
Sbjct 1478  ATGACAACGCAGCTTCTGGTATT------------------------------  1500