Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12675
- Subject:
- NM_001366038.2
- Aligned Length:
- 1292
- Identities:
- 911
- Gaps:
- 340
Alignment
Query 1 ATGCTTGATACCAACTTGATTCTTCTACCTTTGTTCCAATTT-----------ATTGTG----CCTAAAGAATG 59
.|||||..|.|.| |||||.| |||.|| ||| |||.|| || ||..||
Sbjct 1 ----ATGATAAAACCCT--TTCTTTT---TTTTTT----TTTGAGACGCAGTCATTCTGTCACCC---AGTCTG 58
Query 60 GAACAGCAAATATAGACCTGTATGC-AT-TCATCTTGCTGGAA-----------------CAGGAGATCATC-- 112
| |..||| ||| .||| || |||.||..|||||| ||.|.|||..||
Sbjct 59 G-AGTGCA---------CTG-GTGCGATCTCAGCTCACTGGAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCTG 121
Query 113 -----------------------ATTACTGG-AGGCGACGAACA-------CTAA----TGGCCCGTCCTATGA 151
|||||.|| |.|| ||.|.|| |||| || ||||.
Sbjct 122 CCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGGCATGC-ACCACCACACCTGGCTAATTTTTG--------TATGT 186
Query 152 TTA-AAGAAGCCCGAATGGCTT----CTTTATTGTTAG--------AAAAC----------------------- 189
||| .||| ||..||||| |.|..|.||.|| .||||
Sbjct 187 TTAGTAGA-----GATGGGCTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCC 255
Query 190 -CCTT-------------------ATTATGGCTGCAGGAAAC------CCAAG--GACC-----------AAGT 224
|||| |||||.| |||.||..| ||.|| .||| |||
Sbjct 256 ACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAG--GCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTACCTTTTCCTTTTTAAG- 326
Query 225 AAGGTCCAGCTTAAAAAATGTGTCCGACCTTTTTGTGATGGGAGGAGCTCTTGTTTTAGAATCTGCAGCTCTCT 298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 327 AAGGTCCAGCTTAAAAAATGTGTCCGACCTTTTTGTGATGGGAGGAGCTCTTGTTTTAGAATCTGCAGCTCTCT 400
Query 299 TGCACTGGCTAGAGAGGGAAGGTTACGGCCCTTTAGGAATGACTGGAATATCCATGGGAGGACACATGGCTTCC 372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 401 TGCACTGGCTAGAGAGGGAAGGTTACGGCCCTTTAGGAATGACTGGAATATCCATGGGAGGACACATGGCTTCC 474
Query 373 TTAGCGGTATCCAACTGGCCTAAGCCCATGCCATTGATTCCATGCCTGTCTTGGTCCACAGCATCTGGGGTCTT 446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 475 TTAGCGGTATCCAACTGGCCTAAGCCCATGCCATTGATTCCATGCCTGTCTTGGTCCACAGCATCTGGGGTCTT 548
Query 447 CACTACG------------------------------------------------------------------- 453
|||||||
Sbjct 549 CACTACGGGTGTGTTGAGTAAATCAATTAATTGGAGGGAGCTGGAAAAGCAATATTATACCCAGACAGTTTATG 622
Query 454 -----------------------------------ACAGATTCTTTCAAAATGGGACAAGAGTTTGTGAAACAC 492
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 623 AAGAAGAAATTATTCACATGCTTGAATACTGTGGAACAGATTCTTTCAAAATGGGACAAGAGTTTGTGAAACAC 696
Query 493 TTCACTAGCAGTGCAGACAAGCTAACTAACCTTAATCTGGTTTCCAGAACTTTAAATTTAGATATATCAAACCA 566
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 697 TTCACTAGCAGTGCAGACAAGCTAACTAACCTTAATCTGGTTTCCAGAACTTTAAATTTAGATATATCAAACCA 770
Query 567 AGTTGTATCCCAAAAACCTGCTGACTGCCATAATTCTAGCAAAACATCTGTCAGTGCGACATCAGAAGGACTCT 640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 771 AGTTGTATCCCAAAAACCTGCTGACTGCCATAATTCTAGCAAAACATCTGTCAGTGCGACATCAGAAGGACTCT 844
Query 641 TATTGCAAGATACCTCTAAGATGAAGCGCTTCAATCAAACACTTTCAACCAACAAAAGTGGTTATACAAGTCGC 714
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 845 TATTGCAAGATACCTCTAAGATGAAGCGCTTCAATCAAACACTTTCAACCAACAAAAGTGGTTATACAAGTCGC 918
Query 715 AACCCTCAGTCATACCACCTACTTAGTAAAGAACAAAGCAGAAACAGTCTTCGGAAAGAGTCTTTAATATTTAT 788
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 919 AACCCTCAGTCATACCACCTACTTAGTAAAGAACAAAGCAGAAACAGTCTTCGGAAAGAGTCTTTAATATTTAT 992
Query 789 GAAAGGAGTCATGGATGAATGTACTCATGTAGCAAATTTCTCAGTCCCAGTTGATCCAAGCCTCATTATAGTGG 862
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 993 GAAAGGAGTCATGGATGAATGTACTCATGTAGCAAATTTCTCAGTCCCAGTTGATCCAAGCCTCATTATAGTGG 1066
Query 863 TTCAAGCCAAAGAAGATGCCTATATTCCACGAACAGGAGTTCGAAGTTTACAAGAAATTTGGCCTGGTTGTGAA 936
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1067 TTCAAGCCAAAGAAGATGCCTATATTCCACGAACAGGAGTTCGAAGTTTACAAGAAATTTGGCCTGGTTGTGAA 1140
Query 937 ATCCGATACTTAGAAGGGGGTCATATTAGTGCTTATCTTTTTAAACAAGGACTCTTCAGG-------------- 996
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1141 ATCCGATACTTAGAAGGGGGTCATATTAGTGCTTATCTTTTTAAACAAGGACTCTTCAGACAAGCCATCTATGA 1214
Query 997 ---------------------------------- 996
Sbjct 1215 TGCATTTGACCGCTTCCTCCATAAATACGCTAAC 1248