Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12676
- Subject:
- NM_001319305.2
- Aligned Length:
- 1146
- Identities:
- 962
- Gaps:
- 183
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCTTGATACCAACTTGATTCTTCTACCTTTGTTCCAATTTATTGTGCCTAAAGAATGGAACAGCAAATATAG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------ATGGCCCGTCCTA 13
|||||||||||||
Sbjct 75 ACCTGTATGCATTCATCTTGCTGGAACAGGAGATCATCATTACTGGAGGCGACGAACACTAATGGCCCGTCCTA 148
Query 14 TGATTAAAGAAGCCCGAATGGCTTCTTTATTGTTAGAAAACCCTTATTATGGCTGCAGGAAACCCAAGGACCAA 87
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGATTAAAGAAGCCCGAATGGCTTCTTTATTGTTAGAAAACCCTTATTATGGCTGCAGGAAACCCAAGGACCAA 222
Query 88 GTAAGGTCCAGCTTAAAAAATGTGTCCGACCTTTTTGTGATGGGAGGAGCTCTTGTTTTAGAATCTGCAGCTCT 161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTAAGGTCCAGCTTAAAAAATGTGTCCGACCTTTTTGTGATGGGAGGAGCTCTTGTTTTAGAATCTGCAGCTCT 296
Query 162 CTTGCACTGGCTAGAGAGGGAAGGTTACGGCCCTTTAGGAATGACTGGAATATCCATGGGAGGACACATGGCTT 235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTTGCACTGGCTAGAGAGGGAAGGTTACGGCCCTTTAGGAATGACTGGAATATCCATGGGAGGACACATGGCTT 370
Query 236 CCTTAGCGGTATCCAACTGGCCTAAGCCCATGCCATTGATTCCATGCCTGTCTTGGTCCACAGCATCTGGGGTC 309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCTTAGCGGTATCCAACTGGCCTAAGCCCATGCCATTGATTCCATGCCTGTCTTGGTCCACAGCATCTGGGGTC 444
Query 310 TTCACTACGGGTGTGTTGAGTAAATCAATTAATTGGAGGGAGCTGGAAAAGCAATATTATACCCAGACAGTTTA 383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTCACTACGGGTGTGTTGAGTAAATCAATTAATTGGAGGGAGCTGGAAAAGCAATATTATACCCAGACAGTTTA 518
Query 384 TGAAGAAGAAATTATTCACATGCTTGAATACTGTGGAACAGATTCTTTCAAAATGGGACAAGAGTTTGTGAAAC 457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGAAGAAGAAATTATTCACATGCTTGAATACTGTGGAACAGATTCTTTCAAAATGGGACAAGAGTTTGTGAAAC 592
Query 458 ACTTCACTAGCAGTGCAGACAAGCTAACTAACCTTAATCTGGTTTCCAGAACTTTAAATTTAGATATATCAAAC 531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACTTCACTAGCAGTGCAGACAAGCTAACTAACCTTAATCTGGTTTCCAGAACTTTAAATTTAGATATATCAAAC 666
Query 532 CAAGTTGTATCCCAAAAACCTGCTGACTGCCATAATTCTAGCAAAACATCTGTCAGTGCGACATCAGAAGGACT 605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAAGTTGTATCCCAAAAACCTGCTGACTGCCATAATTCTAGCAAAACATCTGTCAGTGCGACATCAGAAGGACT 740
Query 606 CTTATTGCAAGATACCTCTAAGATGAAGCGCTTCAATCAAACACTTTCAACCAACAAAAGTGGTTATACAAGTC 679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTTATTGCAAGATACCTCTAAGATGAAGCGCTTCAATCAAACACTTTCAACCAACAAAAGTGGTTATACAAGTC 814
Query 680 GCAACCCTCAGTCATACCACCTACTTAGTAAAGAACAAAGCAGAAACAGTCTTCGGAAAGAGTCTTTAATATTT 753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCAACCCTCAGTCATACCACCTACTTAGTAAAGAACAAAGCAGAAACAGTCTTCGGAAAGAGTCTTTAATATTT 888
Query 754 ATGAAAGGAGTCATGGATGAATGTACTCATGTAGCAAATTTCTCAGTCCCAGTTGATCCAAGCCTCATTATAGT 827
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATGAAAGGAGTCATGGATGAATGTACTCATGTAGCAAATTTCTCAGTCCCAGTTGATCCAAGCCTCATTATAGT 962
Query 828 GGTTCAAGCCAAAGAAGATGCCTATATTCCACGAACAGGAGTTCGAAGTTTACAAGAAATTTGGCCTGGTTGTG 901
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGTTCAAGCCAAAGAAGATGCCTATATTCCACGAACAGGAGTTCGAAGTTTACAAGAAATTTGGCCTGGTTGTG 1036
Query 902 AAATCCGATACTTAGAAGGGGGTCATATTAGTGCTTATCTTTTTAAACAAGGACTCTTCAGG------------ 963
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037 AAATCCGATACTTAGAAGGGGGTCATATTAGTGCTTATCTTTTTAAACAAGGACTCTTCAGACAAGCCATCTAT 1110
Query 964 ------------------------------------ 963
Sbjct 1111 GATGCATTTGACCGCTTCCTCCATAAATACGCTAAC 1146