Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12708
- Subject:
- NM_198390.2
- Aligned Length:
- 2320
- Identities:
- 1854
- Gaps:
- 461
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGATGTGACCAGCAGCTCGGGCGGCGGCGGCGACCCCCGGCAGATCGAGGAGACCAAGCCGCTGCTGGGGGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CGACGTGTCGGCCCCCGAAGGCACGAAGATGGGCGCCGTGCCCTGCCGCCGGGCTCTTCTGCTTTGCAACGGGA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TGAGGTACAAACTGCTGCAGGAGGGCGACATTCAGGTCTGTGTCATCCGGCACCCGCGGACCTTTCTCAGCAAG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 ATCCTCACCTCGAAATTCCTGAGGCGCTGGGAGCCGCACCACCTAACGCTGGCCGACAACAGCCTGGCGTCCGC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 CACGCCAACTGGGTACATGGAAAACTCAGTCTCCTACAGCGCAATTGAAGACGTTCAGCTGCTGTCCTGGGAGA 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 ATGCCCCGAAGTACTGTTTACAGCTCACGATTCCTGGGGGAACTGTCTTACTGCAGGCTGCCAATAGCTACCTG 444
Query 1 --ATGGCAAGTGTTGCC--------------CAGAAAAAGATTTACAAATATAAGAAAGTGCTGAGTAACCCAA 58
| |.|.||||.|.|| .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CGA-GACCAGTGGTTCCATTCTCTGCAATGGAAGAAAAAGATTTACAAATATAAGAAAGTGCTGAGTAACCCAA 517
Query 59 GCCGCTGGGAAGTTGTCTTGAAAGAGATCCGGACCCTGGTGGACATGGCCCTGACATCCCCCCTGCAGGATGAC 132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 GCCGCTGGGAAGTTGTCTTGAAAGAGATCCGGACCCTGGTGGACATGGCCCTGACATCCCCCCTGCAGGATGAC 591
Query 133 TCCATCAACCAGGCCCCACTGGAAATCGTCTCGAAACTGCTCTCAGAGAACACAAACTTGACCACCCAGGAGCA 206
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 TCCATCAACCAGGCCCCACTGGAAATCGTCTCGAAACTGCTCTCAGAGAACACAAACTTGACCACCCAGGAGCA 665
Query 207 TGAAAACATCATTGTGGCAATCGCTCCTTTGCTGGAAAACAACCACCCACCACCAGATCTCTGTGAATTCTTTT 280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 TGAAAACATCATTGTGGCAATCGCTCCTTTGCTGGAAAACAACCACCCACCACCAGATCTCTGTGAATTCTTTT 739
Query 281 GCAAGCACTGCAGAGAGCGGCCCCGGTCCATGGTGGTCATCGAGGTGTTCACCCCCGTGGTGCAGCGAATCCTC 354
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 GCAAGCACTGCAGAGAGCGGCCCCGGTCCATGGTGGTCATCGAGGTGTTCACCCCCGTGGTGCAGCGAATCCTC 813
Query 355 AAGCATAACATGGACTTTGGGAAGTGCCCGCGACTGAGGCTGTTTACTCAGGAGTACATCCTTGCCTTGAACGA 428
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 AAGCATAACATGGACTTTGGGAAGTGCCCGCGACTGAGGCTGTTTACTCAGGAGTACATCCTTGCCTTGAACGA 887
Query 429 GCTCAACGCGGGGATGGAAGTGGTGAAGAAGTTCATTCAGAGCATGCACGGCCCCACAGGGCACTGCCCCCACC 502
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 GCTCAACGCGGGGATGGAAGTGGTGAAGAAGTTCATTCAGAGCATGCACGGCCCCACAGGGCACTGCCCCCACC 961
Query 503 CCCGGGTCCTGCCCAACCTGGTGGCCGTGTGCCTGGCTGCCATCTACTCCTGCTATGAAGAGTTCATCAACAGC 576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 CCCGGGTCCTGCCCAACCTGGTGGCCGTGTGCCTGGCTGCCATCTACTCCTGCTATGAAGAGTTCATCAACAGC 1035
Query 577 CGCGACAATTCCCCAAGCCTGAAGGAAATCCGGAACGGCTGCCAGCAGCCGTGCGACCGGAAGCCCACTTTACC 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 CGCGACAATTCCCCAAGCCTGAAGGAAATCCGGAACGGCTGCCAGCAGCCGTGCGACCGGAAGCCCACTTTACC 1109
Query 651 TCTGCGCCTTCTGCACCCCAGCCCGGACCTGGTGTCTCAGGAAGCCACGCTGTCTGAGGCCCGGCTCAAGTCGG 724
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 TCTGCGCCTTCTGCACCCCAGCCCGGACCTGGTGTCTCAGGAAGCCACGCTGTCTGAGGCCCGGCTCAAGTCGG 1183
Query 725 TGGTCGTGGCCTCCAGTGAGATCCACGTGGAGGTGGAACGCACCAGCACTGCCAAGCCGGCGCTGACGGCCAGC 798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 TGGTCGTGGCCTCCAGTGAGATCCACGTGGAGGTGGAACGCACCAGCACTGCCAAGCCGGCGCTGACGGCCAGC 1257
Query 799 GCAGGCAACGACAGCGAGCCCAACCTCATCGACTGCCTCATGGTCAGCCCCGCCTGCAGCACCATGAGCATCGA 872
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 GCAGGCAACGACAGCGAGCCCAACCTCATCGACTGCCTCATGGTCAGCCCCGCCTGCAGCACCATGAGCATCGA 1331
Query 873 GCTGGGCCCCCAGGCCGACCGCACGCTCGGCTGCTACGTGGAAATCCTCAAGCTGCTGTCAGACTATGATGACT 946
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 GCTGGGCCCCCAGGCCGACCGCACGCTCGGCTGCTACGTGGAAATCCTCAAGCTGCTGTCAGACTATGATGACT 1405
Query 947 GGAGACCGTCTCTGGCCAGTTTGCTTCAACCCATTCCATTCCCCAAAGAAGCTCTCGCACATGAGAAGTTCACC 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 GGAGACCGTCTCTGGCCAGTTTGCTTCAACCCATTCCATTCCCCAAAGAAGCTCTCGCACATGAGAAGTTCACC 1479
Query 1021 AAGGAACTGAAGTACGTGATTCAGAGGTTCGCCGAAGACCCCAGGCAAGAGGTCCACTCATGCCTGCTGAGCGT 1094
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 AAGGAACTGAAGTACGTGATTCAGAGGTTCGCCGAAGACCCCAGGCAAGAGGTCCACTCATGCCTGCTGAGCGT 1553
Query 1095 GCGGGCCGGCAAAGATGGCTGGTTCCAGCTCTACAGCCCCGGAGGGGTGGCCTGCGACGATGACGGGGAGCTGT 1168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 GCGGGCCGGCAAAGATGGCTGGTTCCAGCTCTACAGCCCCGGAGGGGTGGCCTGCGACGATGACGGGGAGCTGT 1627
Query 1169 TCGCCAGCATGGTGCACATCCTCATGGGCTCCTGTTACAAGACCAAAAAATTCCTGCTCTCCCTGGCAGAAAAC 1242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 TCGCCAGCATGGTGCACATCCTCATGGGCTCCTGTTACAAGACCAAAAAATTCCTGCTCTCCCTGGCAGAAAAC 1701
Query 1243 AAGCTGGGTCCCTGCATGCTCCTGGCACTGAGGGGGAACCAGACCATGGTGGAGATCCTGTGCTTGATGCTGGA 1316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702 AAGCTGGGTCCCTGCATGCTCCTGGCACTGAGGGGGAACCAGACCATGGTGGAGATCCTGTGCTTGATGCTGGA 1775
Query 1317 ATACAACATCATCGACAACAACGACACCCAACTGCAGATCATCTCAACCCTGGAGAGCACAGACGTGGGGAAGC 1390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776 ATACAACATCATCGACAACAACGACACCCAACTGCAGATCATCTCAACCCTGGAGAGCACAGACGTGGGGAAGC 1849
Query 1391 GCATGTACGAGCAGCTGTGTGACCGGCAGCGGGAGCTGAAGGAGCTGCAAAGGAAAGGCGGGCCCACCAGGCTA 1464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850 GCATGTACGAGCAGCTGTGTGACCGGCAGCGGGAGCTGAAGGAGCTGCAAAGGAAAGGCGGGCCCACCAGGCTA 1923
Query 1465 ACACTGCCCTCCAAGTCCACAGACGCTGACTTGGCTCGTTTGCTGAGCTCCGGCTCCTTCGGAAACCTGGAGAA 1538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924 ACACTGCCCTCCAAGTCCACAGACGCTGACTTGGCTCGTTTGCTGAGCTCCGGCTCCTTCGGAAACCTGGAGAA 1997
Query 1539 CCTCAGTTTGGCCTTCACCAATGTAACCAGTGCCTGCGCCGAGCACCTCATCAAACTGCCTTCGCTCAAGCAGC 1612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1998 CCTCAGTTTGGCCTTCACCAATGTAACCAGTGCCTGCGCCGAGCACCTCATCAAACTGCCTTCGCTCAAGCAGC 2071
Query 1613 TGAACCTGTGGTCCACTCAGTTTGGAGACGCTGGCCTTCGGCTCCTGTCGGAACACCTCACCATGCTCCAGGTG 1686
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2072 TGAACCTGTGGTCCACTCAGTTTGGAGACGCTGGCCTTCGGCTCCTGTCGGAACACCTCACCATGCTCCAGGTG 2145
Query 1687 CTGAACCTGTGCGAGACCCCGGTCACAGACGCTGGCCTGCTGGCCCTGAGCTCCATGAAGAGTCTCTGCAGTTT 1760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2146 CTGAACCTGTGCGAGACCCCGGTCACAGACGCTGGCCTGCTGGCCCTGAGCTCCATGAAGAGTCTCTGCAGTTT 2219
Query 1761 AAACATGAACAGCACCAAGCTCTCAGCTGACACCTACGAAGATCTGAAGGCCAAGCTTCCCAATTTGAAGGAAG 1834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 AAACATGAACAGCACCAAGCTCTCAGCTGACACCTACGAAGATCTGAAGGCCAAGCTTCCCAATTTGAAGGAAG 2293
Query 1835 TGGACGTCCGCTACACCGAAGCCTGG 1860
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2294 TGGACGTCCGCTACACCGAAGCCTGG 2319