Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12761
- Subject:
- XM_006714335.1
- Aligned Length:
- 1500
- Identities:
- 955
- Gaps:
- 543
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGATTCCGATGTTCACTGTAACATTGGAAGACTCTGGAACTCTGTGGAAAAGTCTTCACAGCTCCTCTGAATC 74
Query 1 ----ATGACCACCCTGCCCCCACTGCCCATGACACGCCCGAAGCTTACAGCCTTAGCCAGACAGAAGCTGCCTT 70
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGAAATGACCACCCTGCCCCCACTGCCCATGACACGCCCGAAGCTTACAGCCTTAGCCAGACAGAAGCTGCCTT 148
Query 71 GCTCCTCCAGAAAAATTCCAAGGTCTCAATTGATCAAAGAAAAAGATGACATAGATCATTATCTAGAGGTAAAT 144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCTCCTCCAGAAAAATTCCAAGGTCTCAATTGATCAAAGAAAAAGATGACATAGATCATTATCTAGAGGTAAAT 222
Query 145 TTCAAAGGATTATCAAAAGAGGAAGTTGCTGCTTATAGGAACTCCTACAAGAAGAATATCTGTGTGGACATGCT 218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTCAAAGGATTATCAAAAGAGGAAGTTGCTGCTTATAGGAACTCCTACAAGAAGAATATCTGTGTGGACATGCT 296
Query 219 GCGAGATGGTTATCATAAGTCCTTCACCGAGCTCTTCGCTCTGATGGAGCGGTGGGATGCCCTGAGGGAGGCTG 292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCGAGATGGTTATCATAAGTCCTTCACCGAGCTCTTCGCTCTGATGGAGCGGTGGGATGCCCTGAGGGAGGCTG 370
Query 293 CGAGAGTCAGGTCCCTCTTCTGGCTGCAGAAGCCCCTGGAGGAGCAGCCTGATAAACTGGATTACCTGTACCAT 366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CGAGAGTCAGGTCCCTCTTCTGGCTGCAGAAGCCCCTGGAGGAGCAGCCTGATAAACTGGATTACCTGTACCAT 444
Query 367 TACCTGACCAGGGCTGAGGACGCTGAGAGGAAAGAATCCTTCGAAGATGTATATAATAACTTGTATGCTCTGGC 440
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TACCTGACCAGGGCTGAGGACGCTGAGAGGAAAGAATCCTTCGAAGATGTACATAATAACTTGTATGCTCTGGC 518
Query 441 CTGTTACTTCAATAATTCTGAAGACAAGTGGGTAAGGAACCACTTCTATGAACGATGTTTTAAGATTGCTCAGC 514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTGTTACTTCAATAATTCTGAAGACAAGTGGGTAAGGAACCACTTCTATGAACGATGTTTTAAGATTGCTCAGC 592
Query 515 TGATCAAAATTGACTGTGGGAAGAAAGAAGCCGAGGCACACATGCATATGGGTCTTCTCTACGAGGAAGATGGT 588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGATCAAAATTGACTGTGGGAAGAAAGAAGCCGAGGCACACATGCATATGGGTCTTCTCTACGAGGAAGATGGT 666
Query 589 CAGCTTCTGGAAGCTGCTGAGCATTATGAAGCATTCCATCAATTGACACAGGGGCGGATATGGAAGGATGAGAC 662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAGCTTCTGGAAGCTGCTGAGCATTATGAAGCATTCCATCAATTGACACAGGGGCGGATATGGAAGGATGAGAC 740
Query 663 AGGCCGCTCTCTCAACTTGTTGGCCTGTGAGAGTCTCCTGAGGACTTACAGATTACTCTCAGACAAAATGCTAG 736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGGCCGCTCTCTCAACTTGTTGGCCTGTGAGAGTCTCCTGAGGACTTACAGATTACTCTCAGACAAAATGCTAG 814
Query 737 AAAATAAAGAATACAAACAGGCCATCAAAATTCTAATAAAAGCTTCTGAAATAGCCAAAGAAGGAAGTGACAAA 810
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAAATAAAGAATACAAACAGGCCATCAAAATTCTAATAAAAGCTTCTGAAATAGCCAAAGAAGGAAGTGACAAA 888
Query 811 AAGATGGAAGCGGAAACCTCTTACTACTTGGGCTTAGCACACTTAGCTGCTGAGGAATATGAAACAGCATTAAC 884
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGATGGAAGCGGAAGCCTCTTACTACTTGGGCTTAGCACACTTAGCTGCTGAGGAATATGAAACAGCATTAAC 962
Query 885 AGTCCTTGACACTTACTGT-AAATCTCCACAGACCTGGATGATGATCTCAGTCTGGGGAGAGGCTATGAAGCCA 957
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGTCCTTGACACTTACTGTAAAATCTCCACAGACCTGGATGATGATCTCAGTCTGGGGAGAGGCTATGAAGCCA 1036
Query 958 -------------------------------------------------------------------------- 957
Sbjct 1037 TAGCCAAGGTCCTGCAGAGCCAAGGAGAGATGACAGAAGCAATTAAATACTTGAAAAAATTTGTGAAAATTGCA 1110
Query 958 -------------------------------------------------------------------------- 957
Sbjct 1111 AGAAACAATTTTCAAAGCCTAGATTTGGTGAGAGCAAGTACAATGCTTGGGGACATCTACAATGAAAAAGGATA 1184
Query 958 -------------------------------------------------------------------------- 957
Sbjct 1185 CTACAACAAAGCTTCTGAATGCTTTCAGCAAGCTTTTGACACAACAGTAGAGCTAATGAGCATGCCTCTGATGG 1258
Query 958 -------------------------------------------------------------------------- 957
Sbjct 1259 ATGAGACAAAAGTTCACTATGGAATAGCAAAAGCTCATCAGATGATGCTTACAGTGAACAACTATATAGAGTCT 1332
Query 958 -------------------------------------------------------------------------- 957
Sbjct 1333 GCAGATCTCACCAGCCTCAACTACCTGCTGTCATGGAAGGAGAGCAGAGGTAACATTGAACCTGATCCAGTTAC 1406
Query 958 -------------------------------------------------------------------------- 957
Sbjct 1407 TGAGTTTAGAGGATCCACAGTGGAAGCTGTATCTCAAAACTCAGAACGTTTGGAAGAACTCAGTAGGTTTCCAG 1480
Query 958 -------------------- 957
Sbjct 1481 GTGATCAAAAAAATGAAACT 1500