Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12833
- Subject:
- XM_017005110.1
- Aligned Length:
- 1446
- Identities:
- 1336
- Gaps:
- 102
Alignment
Query 1 ---------------------------------ATGCTTTTCGGAATATTCGCTTGGGGGCTCCTCTTTTTGCT 41
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Sbjct 1 ATGAAACCACACTTGAAGCAATGGAGACAACGAATGCTTTTCGGAATATTCGCTTGGGGGCTCCTCTTTTTGCT 74
Query 42 GATTTTCATCTACTTCACCGACAGCAACCCCGCTGAGCCTGTACCCAGCTCCCTCTCCTTCCTGGAGACCAGGA 115
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Sbjct 75 GATTTTCATCTACTTCACCGACAGCAACCCCGCTGAGCCTGTACCCAGCTCCCTCTCCTTCCTGGAGACCAGGA 148
Query 116 GGCTCCTGCCGGTGCAGGGGAAGCAGCGGGCCATCATGGGCGCCGCACATGAGCCCTCCCCGCCTGGGGGCCTG 189
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Sbjct 149 GGCTCCTGCCGGTGCAGGGGAAGCAGCGGGCCATCATGGGCGCCGCACATGAGCCCTCCCCGCCTGGGGGCCTG 222
Query 190 GACGCACGCCAGGCGCTGCCCCGCGCCCACCCAGCCGGTTCCTTTCATGCGGGGCCTGGAGACCTGCAGAAATG 263
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Sbjct 223 GACGCACGCCAGGCGCTGCCCCGCGCCCACCCAGCCGGTTCCTTTCATGCGGGGCCTGGAGACCTGCAGAAATG 296
Query 264 GGCCCAGTCCCAAGATGGGTTTGAACATAAAGAGTTTTTTTCATCCCAGGTGGGGAGAAAATCTCAAAGTGCTT 337
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Sbjct 297 GGCCCAGTCCCAAGATGGGTTTGAACATAAAGAGTTTTTTTCATCCCAGGTGGGGAGAAAATCTCAAAGTGCTT 370
Query 338 TCTACCCGGAGGATGACGACTACTTTTTTGCTGCTGGTCAGCCAGGGTGGCACAGCCACACTCAGGGGACATTG 411
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Sbjct 371 TCTACCCGGAGGATGACGACTACTTTTTTGCTGCTGGTCAGCCAGGGTGGCACAGCCACACTCAGGGGACATTG 444
Query 412 GGATTCCCTTCCCCCGGGGAGCCAGGCCCACGGGAGGGGGCTTTTCCGGCTGCACAGGTCCAGAGGAGGCGGGT 485
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Sbjct 445 GGATTCCCTTCCCCCGGGGAGCCAGGCCCACGGGAGGGGGCTTTTCCGGCTGCACAGGTCCAGAGGAGGCGGGT 518
Query 486 GAAGAAGAGGCACCGGAGGCAGAGAAGGAGCCACGTGTTGGAGGAGGGCGACGACGGCGACAGGCTGTACTCCT 559
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Sbjct 519 GAAGAAGAGGCACCGGAGGCAGAGAAGGAGCCACGTGTTGGAGGAGGGCGACGACGGCGACAGGCTGTACTCCT 592
Query 560 CCATGTCCAGGGCCTTCCTGTACCGGCTCTGGAAGGGGAACGTCTCTTCCAAAATGCTGAACCCGCGCCTGCAG 633
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Sbjct 593 CCATGTCCAGGGCCTTCCTGTACCGGCTCTGGAAGGGGAACGTCTCTTCCAAAATGCTGAACCCGCGCCTGCAG 666
Query 634 AAGGCGATGAAGGATTACCTGACCGCCAACAAGCACGGGGTGCGCTTCCGCGGGAAGCGGGAGGCCGGGCTGAG 707
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Sbjct 667 AAGGCGATGAAGGATTACCTGACCGCCAACAAGCACGGGGTGCGCTTCCGCGGGAAGCGGGAGGCCGGGCTGAG 740
Query 708 CAGGGCACAGCTGCTGTGCCAGCTGCGGAGCCGCGCGCGCGTGCGGACGCTGGACGGCACCGAGGCGCCCTTTT 781
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Sbjct 741 CAGGGCACAGCTGCTGTGCCAGCTGCGGAGCCGCGCGCGCGTGCGGACGCTGGACGGCACCGAGGCGCCCTTTT 814
Query 782 CTGCGCTGGGCTGGCGGCGCCTGGTGCCCGCCGTGCCCCTGAGCCAGCTGCACCCCCGCGGCCTGCGCAGCTGC 855
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Sbjct 815 CTGCGCTGGGCTGGCGGCGCCTGGTGCCCGCCGTGCCCCTGAGCCAGCTGCACCCCCGCGGCCTGCGCAGCTGC 888
Query 856 GCTGTCGTCATGTCTGCAGGCGCAATCCTCAACTCTTCCTTGGGCGAGGAAATAGATTCTCATGATGCGGTTTT 929
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Sbjct 889 GCTGTCGTCATGTCTGCAGGCGCAATCCTCAACTCTTCCTTGGGCGAGGAAATAGATTCTCATGATGCGGTTTT 962
Query 930 GAGATTTAACTCTGCTCCTACACGTGGTTATGAGAAAGATGTTGGGAATAAAACCACCATACGCATCATTAATT 1003
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Sbjct 963 GAGATTTAACTCTGCTCCTACACGTGGTTATGAGAAAGATGTTGGGAATAAAACCACCATACGCATCATTAATT 1036
Query 1004 CGCAGATTCTGACCAACCCCAGCCATCACTTCATTGACAGTTCACTGTATAAAGACGTCATTTTGGTGGCCTGG 1077
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Sbjct 1037 CGCAGATTCTGACCAACCCCAGCCATCACTTCATTGACAGTTCACTGTATAAAGACGTCATTTTGGTGGCCTGG 1110
Query 1078 GACCCTGCCCCATATTCCGCAAATCTTAACCTGTGGTACAAAAAACCGGATTACAACCTGTTCACTCCATATAT 1151
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Sbjct 1111 GACCCTGCCCCATATTCCGCAAATCTTAACCTGTGGTACAAAAAACCGGATTACAACCTGTTCACTCCATATAT 1184
Query 1152 TCAGCATCGTCAGAGAAACCCAAATCAGCCATTTTACATTCTTCATCCTAAATTTATATGGCAGCTCTGGGATA 1225
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Sbjct 1185 TCAGCATCGTCAGAGAAACCCAAATCAGCCATTTTACATTCTTCATCCTAAATTTATATGGCAGCTCTGGGATA 1258
Query 1226 TTATCCAGGAGAACACTAAAGAGAAGATTCAACCAAACCCACCATCTTCTGGTTTCATTGGCTCA-------TT 1292
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Sbjct 1259 TTATCCAGGAGAACACTAAAGAGAAGATTCAACCAAACCCACCATCTTCTGGTTTCATTGACGGAGTCTCGCTG 1332
Query 1293 TGTAAAAATTGGCCATA-TCAGAGCT----TGCAGTGAGC-CGAGATCACGC-GACTGCA-------------- 1345
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Sbjct 1333 TGT------------TACTCAG-GCTGGAGTGCAGTG-GCACGATCTCA-GCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCA 1391
Query 1346 -------------CTCCAGCCTGGACGACAG-------AG 1365
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Sbjct 1392 GGTTCAAGCAATTCTCCTGCCT------CAGCCTCCCAAG 1425