Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12837
- Subject:
- NM_028720.2
- Aligned Length:
- 1659
- Identities:
- 1326
- Gaps:
- 228
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGGCTGTGAGTCTGCGGCTCGGCGACTTGGTGTGGGGGAAACTGGGCCGGTATCCTCCCTGGCCAGGAAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GATTGTTAATCCACCCAAGGACTTAAAGAAACCACGTGGAAAGAAATGCTTCTTTGTGAAGTTTTTTGGAACAG 148
Query 1 -----------------------------------------------------------ATGATAAAAATTAAC 15
||||||||.||||||
Sbjct 149 AAGATCATGCCTGGATCAAAGTGGAACAGCTAAAGCCTTACCATGCTCACAAGGAGGAGATGATAAAGATTAAC 222
Query 16 AAGGGTAAACGATTCCAGCAAGCGGTAGATGCTGTCGAAGAGTTCCTCAGGAGAGCCAAAGGGAAAGACCAGAC 89
|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAGGGTAAACGGTTCCAGCAAGCTGTGGATGCTGTTGAAGAGTTCCTCAGGAGAGCCAAAGGGAAAGACCAGAC 296
Query 90 GTCATCCCACAATTCTTCTGATGACAAGAATCGACGTAATTCCAGTGAGGAGAGAAGTAGGCCAAACTCAGGTG 163
.||||||||||.||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATCATCCCACACTTCTGCTGATGACAAGAATCGGCGTAATTCCAGTGAGGAGAGAAGTAGGCCAAACTCAGGTG 370
Query 164 ATGAGAAGCGCAAACTTAGCCTGTCTGAAGGGAAGGTGAAGAAGAACATGGGAGAAGGAAAGAAGAGGGTGTCT 237
|||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 371 ATGAGAAACGCAAGCTTAGCCTGTCTGAAGGGAAGGTGAAGAAGAACATGGGAGAAGGAAAGAAGAGGGTGACT 444
Query 238 TCAGGCTCTTCAGAGAGAGGCTCCAAATCCCCTCTGAAAAGAGCCCAAGAGCAAAGTCCCCGGAAGCGGGGTCG 311
|||||||||.||||.|||||||||||||.| ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCAGGCTCTGCAGACAGAGGCTCCAAATGC---CTTAAAAGAGCCCAAGAGCAAAGTCCCCGGAAGCGGGGTCG 515
Query 312 GCCCCCAAAGGATGAGAAGGATCTCACCATCCCGGAGTCTAGTACCGTGAAGGGGATGATGGCCGGACCGATGG 385
|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 516 GCCCCCAAAGGATGAGAAGGACCTCACCATCCCTGAGTCTAGCACTGTAAAGGGGATGATGGCTGGACCGATGG 589
Query 386 CCGCGTTTAAATGGCAGCCAACCGCAAGCGAGCCTGTTAAAGATGCAGATCCTCATTTCCATCATTTCCTGCTA 459
|.||.|||||||||||||||||.||.|.||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||.|.
Sbjct 590 CTGCATTTAAATGGCAGCCAACAGCGACCGAGCCAGTCAAAGATGCAGATCCTCATTTTCATCATTTTCTGTTG 663
Query 460 AGCCAAACAGAGAAGCCAGCTGTCTGTTACCAGGCAATCACGAAGAAGTTGAAAATATGTGAAGAGGAAACTGG 533
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 AGCCAAACAGAGAAGCCAGCTGTCTGTTACCAGGCAATCACAAAGAAGTTGAAAATATGTGAAGAGGAAACTGG 737
Query 534 CTCCACCTCCATCCAGGCAGCTGACAGCACAGCCGTGAATGGCAGCATCACACCCACAGACAAAAAGATAGGAT 607
.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 738 TTCCACCTCCATCCAGGCAGCAGACAGCACAGCTGTGAATGGCAGCATTACACCCACAGACAAAAAGATAGGAT 811
Query 608 TTTTGGGCCTTGGTCTCATGGGAAGTGGAATCGTCTCCAACTTGCTAAAAATGGGTCACACAGTGACTGTCTGG 681
|||||||||||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 812 TTTTGGGCCTTGGCTTAATGGGAAGTGGCATCGTCTCCAACTTGCTAAAAATGGGTCACACAGTGACTGTCTGG 885
Query 682 AACCGCACTGCAGAGAAATGTGATTTGTTCATCCAGGAGGGGGCCCGTCTGGGAAGAACCCCCGCTGAAGTCGT 755
|||||.|||||||||||| |||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 886 AACCGGACTGCAGAGAAA------------------GAGGGGGCCCGCCTAGGAAGAACCCCCGCTGAAGTCGT 941
Query 756 CTCAACCTGCGACATCACTTTCGCCTGCGTGTCGGATCCCAAGGCGGCCAAGGACCTGGTGCTGGGCCCCAGTG 829
.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 942 TTCAACTTGTGACATCACTTTTGCCTGTGTGTCGGATCCAAAGGCAGCCAAGGACCTGGTGCTGGGCCCCAGCG 1015
Query 830 GTGTGCTGCAAGGGATCCGCCCTGGGAAGTGCTACGTGGACATGTCAACAGTGGACGCTGACACCGTCACTGAG 903
|||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||
Sbjct 1016 GTGTGCTGCAAGGAATCCGCCCCGGGAAGTGCTATGTGGACATGTCAACGGTGGATGCGGATACAGTCACCGAG 1089
Query 904 CTGGCCCAGGTGATTGTGTCCAGGGGGGGGCGCTTTCTGGAAGCCCCCGTCTCAGGGAATCAGCAGCTGTCTAA 977
|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1090 CTGGCCCAGGTGATTGTATCCAGAGGGGGACGCTTTCTGGAAGCACCAGTCTCAGGGAATCAGCAACTGTCCAA 1163
Query 978 TGACGGGATGTTGGTGATCTTAGCGGCTGGAGACAGGGGCTTATATGAGGACTGCAGCAGCTGCTTCCAGGCGA 1051
|||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1164 TGATGGGATGTTGGTGATCTTAGCAGCCGGAGACAGGGGCTTGTATGAGGACTGCAGCAGCTGCTTCCAGGCAA 1237
Query 1052 TGGGGAAGACCTCCTTCTTCCTAGGTGAAGTGGGCAATGCAGCCAAGATGATGCTGATCGTGAACATGGTCCAA 1125
||||.||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1238 TGGGAAAGACCTCCTTCTTTTTAGGTGAAGTTGGCAATGCAGCCAAGATGATGCTGATTGTGAACATGGTCCAA 1311
Query 1126 GGGAGCTTCATGGCCACTATTGCCGAGGGGCTGACCCTGGCCCAGGTGACAGGCCAGTCCCAGCAGACACTCTT 1199
|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1312 GGGAGCTTCATGGCCACCATTGCTGAGGGGCTCACGCTGGCCCAAGTGACAGGCCAATCACAGCAGACACTCTT 1385
Query 1200 GGACATCCTCAATCAGGGACAGTTGGCCAGCATCTTCCTGGACCAGAAGTGCCAAAATATCCTGCAAGGAAACT 1273
|||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1386 GGACATCCTTAATCAGGGACAATTGGCCAGCATCTTTCTGGACCAGAAGTGCCAAAATATCCTACAAGGAAACT 1459
Query 1274 TTAAGCCTGATTTCTACCTGAAATACATTCAGAAGGATCTCCGCTTAGCCATTGCGCTGGGTGATGCGGTCAAC 1347
||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||..||||||||||.||||||
Sbjct 1460 TTAAACCTGACTTCTACCTGAAATACATTCAGAAGGATCTCCGCCTGGCCATTGCATTGGGTGATGCAGTCAAC 1533
Query 1348 CATCCGACTCCCATGGCAGCTGCAGCAAATGAGGTGTACAAAAGAGCCAAGGCGCTGGACCAGTCCGACAACGA 1421
||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1534 CACCCCACTCCCATGGCAGCTGCAGCCAATGAGGTATACAAAAGAGCCAAGGCACTGGACCAGTCTGACAATGA 1607
Query 1422 TATGTCCGCCGTGTACCGAGCCTACATACAC 1452
||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1608 TATGTCTGCCGTGTACCGAGCCTACATACAC 1638