Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12925
• Subject: NM_001330774.2
• Aligned Length: 1533
• Identities: 1197
• Gaps: 309

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGTAAAGCTATTGCTTTTGAGATCATTCAGAAATACGAGCCTATCGAAGAAGTTAGGAAAGCACACCAAAT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GTCATTAGAAGGTTTTACAAGATACATGGATTCACGTGAATGTCTACTGTTTAAAAATGAATGTAGAAAAGTTT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  ATCAAGATATGACTCATCCATTAAATGATTATTTTATTTCATCTTCACATAACACATATTTGGTATCTGATCAA  222

Query    1  ----------------------------ATGGAAATG-----------AGATG--GTT-TTTGTCAAAGATTCA  32
                                        |||.||.||           .||||  ||| ||||   .||||   
Sbjct  223  TTATTGGGACCAAGTGACCTTTGGGGATATGTAAGTGCCCTTGTGAAAGGATGCCGTTGTTTG---GAGAT---  290

Query   33  GGATGACTTCAGAGGTGGA----AAAATTAACC-----TAGA--------AAAAACTCAGAGG-----TTAC--  82
               |||||.|.|.|.||||    |||||.||||     ||.|        |.|.|||||.|.|     || |  
Sbjct  291  ---TGACTGCTGGGATGGAGCACAAAATGAACCTGTTGTATATCATGGCTACACACTCACAAGCAAACTT-CTG  360

Query   83  TTGAAAAATTAGATATTCGGTGCAGTTATATTCATGTGAAACAGATTTTTAAGACATCTGACTACCCAGTGGTG  156
            ||.||||.|  |.|||.|    .||.||||..||.|| |..||    ||.|.||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  TTTAAAACT--GTTATCC----AAGCTATACACAAGT-ATGCA----TTCATGACATCTGACTACCCAGTGGTG  423

Query  157  CTCTCTTTAGAAAATCACTGCTCCACTGCCCAACAAGAAGTAATGGCAGACAATTTGCAGGCTACTTTTGGAGA  230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  424  CTCTCTTTAGAAAATCACTGCTCCACTGCCCAACAAGAAGTAATGGCAGACAATTTGCAGGCTACTTTTGGAGA  497

Query  231  GTCCTTGCTTTCTGATATGCTTGATGATTTTCCTGATACTCTACCATCACCAGAGGCACTAAAATTCAAAATAT  304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  498  GTCCTTGCTTTCTGATATGCTTGATGATTTTCCTGATACTCTACCATCACCAGAGGCACTAAAATTCAAAATAT  571

Query  305  TAGTTAAAAATAAGAAAATAGGAACCTTAAAGGAAACCCATGAAAGAAAAGGTTCTGATAAGCGTGGAGACAAT  378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  572  TAGTTAAAAATAAGAAAATAGGAACCTTAAAGGAAACCCATGAAAGAAAAGGTTCTGATAAGCGTGGAGACAAT  645

Query  379  CAAGACAAGGAAACAGGGGTAAAAAAGTTACCTGGAGTAATGCTTTTCAAGAAAAAGAAGACCAGGAAGCTAAA  452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  646  CAAGACAAGGAAACAGGGGTAAAAAAGTTACCTGGAGTAATGCTTTTCAAGAAAAAGAAGACCAGGAAGCTAAA  719

Query  453  AATTGCTCTGGCCTTATCTGATCTTGTCATTTATACGAAAGCTGAGAAATTCAAAAGCTTTCAACATTCAAGAT  526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720  AATTGCTCTGGCCTTATCTGATCTTGTCATTTATACGAAAGCTGAGAAATTCAAAAGCTTTCAACATTCAAGAT  793

Query  527  TATATCAGCAATTTAATGAAAATAATTCTATTGGGGAGACACAAGCCCGAAAACTTTCAAAATTGCGAGTCCAT  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  794  TATATCAGCAATTTAATGAAAATAATTCTATTGGGGAGACACAAGCCCGAAAACTTTCAAAATTGCGAGTCCAT  867

Query  601  GAGTTTATTTTTCACACCAGGAAGTTCATTACCAGAATATATCCCAAAGCAACAAGAGCAGACTCTTCTAATTT  674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  868  GAGTTTATTTTTCACACCAGGAAGTTCATTACCAGAATATATCCCAAAGCAACAAGAGCAGACTCTTCTAATTT  941

Query  675  TAATCCCCAAGAATTTTGGAATATAGGTTGTCAAATGGTGGCTTTAAATTTCCAGACCCCTGGTCTGCCCATGG  748
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  942  TAATCCCCAAGAATTTTGGAATATAGGTTGTCAAATGGTGGCTTTAAATTTCCAGACCCCTGGTCTGCCCATGG  1015

Query  749  ATCTGCAAAATGGGAAATTTTTGGATAATGGTGGTTCTGGATATATTTTGAAACCACATTTCTTAAGAGAGAGT  822
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1016  ATCTGCAAAATGGGAAATTTTTGGATAATGGTGGTTCTGGATATATTTTGAAACCACATTTCTTAAGAGAGAGT  1089

Query  823  AAATCATACTTTAACCCAAGTAACATAAAAGAGGGTATGCCAATTACACTTACAATAAGGCTCATCAGTGGTAT  896
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090  AAATCATACTTTAACCCAAGTAACATAAAAGAGGGTATGCCAATTACACTTACAATAAGGCTCATCAGTGGTAT  1163

Query  897  CCAGTTGCCTCTTACTCATTCATCATCTAACAAAGGTGATTCATTAGTAATTATAGAAGTTTTTGGTGTTCCAA  970
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164  CCAGTTGCCTCTTACTCATTCATCATCTAACAAAGGTGATTCATTAGTAATTATAGAAGTTTTTGGTGTTCCAA  1237

Query  971  ATGATCAAATGAAGCAGCAGACTCGTGTAATTAAAAAAAATGCTTTTAGTCCAAGATGGAATGAAACATTCACA  1044
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1238  ATGATCAAATGAAGCAGCAGACTCGTGTAATTAAAAAAAATGCTTTTAGTCCAAGATGGAATGAAACATTCACA  1311

Query 1045  TTTATTATTCATGTCCCAGAATTGGCATTGATACGTTTTGTTGTTGAAGGTCAAGGTTTAATAGCAGGAAATGA  1118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312  TTTATTATTCATGTCCCAGAATTGGCATTGATACGTTTTGTTGTTGAAGGTCAAGGTTTAATAGCAGGAAATGA  1385

Query 1119  ATTTCTTGGGCAATATACTTTGCCACTTCTATGCATGAACAAAGGTTATCGTCGTATTCCTCTGTTTTCCAGAA  1192
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1386  ATTTCTTGGGCAATATACTTTGCCACTTCTATGCATGAACAAAGGTTATCGTCGTATTCCTCTGTTTTCCAGAA  1459

Query 1193  TGGGTGAGAGCCTTGAGCCTGCTTCACTGTTTGTTTATGTTTGGTACGTCAGA  1245
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1460  TGGGTGAGAGCCTTGAGCCTGCTTCACTGTTTGTTTATGTTTGGTACGTCAGA  1512