Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12925
• Subject: XM_017020181.1
• Aligned Length: 1687
• Identities: 1193
• Gaps: 464

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGTAAAGCTATTGCTTTTGAGATCATTCAGAAATACGAGCCTATCGAAGAAGTTAGGAAAGCACACCAAAT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GTCATTAGAAGGTTTTACAAGATACATGGATTCACGTGAATGTCTACTGTTTAAAAATGAATGTAGAAAAGTTT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  ATCAAGATATGACTCATCCATTAAATGATTATTTTATTTCATCTTCACATAACACATATTTGGTATCTGATCAA  222

Query    1  ----------------------------ATGGAAATG-----------AGATG--GTT-TTTGTCAAAGATTCA  32
                                        |||.||.||           .||||  ||| ||||   .||||   
Sbjct  223  TTATTGGGACCAAGTGACCTTTGGGGATATGTAAGTGCCCTTGTGAAAGGATGCCGTTGTTTG---GAGAT---  290

Query   33  GGATGACTTCAGAGGTGGA----AAAATTAACC-----TAGA--------AAAAACTCAGAGG-----TTAC--  82
               |||||.|.|.|.||||    |||||.||||     ||.|        |.|.|||||.|.|     || |  
Sbjct  291  ---TGACTGCTGGGATGGAGCACAAAATGAACCTGTTGTATATCATGGCTACACACTCACAAGCAAACTT-CTG  360

Query   83  TTGAAAAATTAGATATTCGGTGCAGTTATATTCATGTGAAACAGATTTTTAAGACATCTGACTACCCAGTGGTG  156
            ||.||||.|  |.|||.|    .||.||||..||.|| |..||    ||.|.||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  TTTAAAACT--GTTATCC----AAGCTATACACAAGT-ATGCA----TTCATGACATCTGACTACCCAGTGGTG  423

Query  157  CTCTCTTTAGAAAATCACTGCTCCACTGCCCAACAAGAAGTAATGGCAGACAATTTGCAGGCTACTTTTGGAGA  230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  424  CTCTCTTTAGAAAATCACTGCTCCACTGCCCAACAAGAAGTAATGGCAGACAATTTGCAGGCTACTTTTGGAGA  497

Query  231  GTCCTTGCTTTCTGATATGCTTGATGATTTTCCTGATACTCTACCATCACCAGAGGCACTAAAATTCAAAATAT  304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  498  GTCCTTGCTTTCTGATATGCTTGATGATTTTCCTGATACTCTACCATCACCAGAGGCACTAAAATTCAAAATAT  571

Query  305  TAGTTAAAAATAAGAAAATAGGAACCTTAAAGGAAACCCATGAAAGAAAAGGTTCTGATAAGCGT---------  369
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct  572  TAGTTAAAAATAAGAAAATAGGAACCTTAAAGGAAACCCATGAAAGAAAAGGTTCTGATAAGCGTGGTAAGGTG  645

Query  370  --------------------------------------------------------------------------  369
                                                                                      
Sbjct  646  GAGGAATGGGAAGAAGAAGTGGCAGATGGAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGA  719

Query  370  ----------------------------------------GGAGACAATCAAGACAAGGAAACAGGGGTAAAAA  403
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720  GGATAAATTCAAAGAATCAGAAGTATTGGAATCTGTTTTAGGAGACAATCAAGACAAGGAAACAGGGGTAAAAA  793

Query  404  AGTTACCTGGAGTAATGCTTTTCAAGAAAAAGAAGACCAGGAAGCTAAAAATTGCTCTGGCCTTATCTGATCTT  477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  794  AGTTACCTGGAGTAATGCTTTTCAAGAAAAAGAAGACCAGGAAGCTAAAAATTGCTCTGGCCTTATCTGATCTT  867

Query  478  GTCATTTATACGAAAGCTGAGAAATTCAAAAGCTTTCAACATTCAAGATTATATCAGCAATTTAATGAAAATAA  551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  868  GTCATTTATACGAAAGCTGAGAAATTCAAAAGCTTTCAACATTCAAGATTATATCAGCAATTTAATGAAAATAA  941

Query  552  TTCTATTGGGGAGACACAAGCCCGAAAACTTTCAAAATTGCGAGTCCATGAGTTTATTTTTCACACCAGGAAGT  625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  942  TTCTATTGGGGAGACACAAGCCCGAAAACTTTCAAAATTGCGAGTCCATGAGTTTATTTTTCACACCAGGAAGT  1015

Query  626  TCATTACCAGAATATATCCCAAAGCAACAAGAGCAGACTCTTCTAATTTTAATCCCCAAGAATTTTGGAATATA  699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1016  TCATTACCAGAATATATCCCAAAGCAACAAGAGCAGACTCTTCTAATTTTAATCCCCAAGAATTTTGGAATATA  1089

Query  700  GGTTGTCAAATGGTGGCTTTAAATTTCCAGACCCCTGGTCTGCCCATGGATCTGCAAAATGGGAAATTTTTGGA  773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090  GGTTGTCAAATGGTGGCTTTAAATTTCCAGACCCCTGGTCTGCCCATGGATCTGCAAAATGGGAAATTTTTGGA  1163

Query  774  TAATGGTGGTTCTGGATATATTTTGAAACCACATTTCTTAAGAGAGAGTAAATCATACTTTAACCCAAGTAACA  847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164  TAATGGTGGTTCTGGATATATTTTGAAACCACATTTCTTAAGAGAGAGTAAATCATACTTTAACCCAAGTAACA  1237

Query  848  TAAAAGAGGGTATGCCAATTACACTTACAATAAGGCTCATCAGTGGTATCCAGTTGCCTCTTACTCATTCATCA  921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1238  TAAAAGAGGGTATGCCAATTACACTTACAATAAGGCTCATCAGTGGTATCCAGTTGCCTCTTACTCATTCATCA  1311

Query  922  TCTAACAAAGGTGATTCATTAGTAATTATAGAAGTTTTTGGTGTTCCAAATGATCAAATGAAGCAGCAGACTCG  995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312  TCTAACAAAGGTGATTCATTAGTAATTATAGAAGTTTTTGGTGTTCCAAATGATCAAATGAAGCAGCAGACTCG  1385

Query  996  TGTAATTAAAAAAAATGCTTTTAGTCCAAGATGGAATGAAACATTCACATTTATTATTCATGTCCCAGAATTGG  1069
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1386  TGTAATTAAAAAAAATGCTTTTAGTCCAAGATGGAATGAAACATTCACATTTATTATTCATGTCCCAGAATTGG  1459

Query 1070  CATTGATACGTTTTGTTGTTGAAGGTCAAGGTTTAATAGCAGGAAATGAATTTCTTGGGCAATATACTTTGCCA  1143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1460  CATTGATACGTTTTGTTGTTGAAGGTCAAGGTTTAATAGCAGGAAATGAATTTCTTGGGCAATATACTTTGCCA  1533

Query 1144  CTTCTATGCATGAACAAAGGTTATCGTCGTATTCCTCTGTTTTCCAGAATGGGTGAGAGCCTTGAGCCTGCTTC  1217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1534  CTTCTATGCATGAACAAAGGTTATCGTCGTATTCCTCTGTTTTCCAGAATGGGTGAGAGCCTTGAGCCTGCTTC  1607

Query 1218  ACTGTTTGTTTATGTTTGGTACGTCAGA-------------------------------  1245
            ||||||||||||||||||.|.| .||||                               
Sbjct 1608  ACTGTTTGTTTATGTTTGTTTC-ACAGAGCATCAACCCGGACACAGCCACTCTGTACCA  1665