Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12925
• Subject: XM_017020182.1
• Aligned Length: 1437
• Identities: 1193
• Gaps: 216

Alignment

Query    1  ATG-----------GAAATGAGATG--GTT-TTTGTCAAAGATTCAGGATGACTTCAGAGGTGGA----AAAAT  56
            |||           ||||  .||||  ||| ||||   .||||      |||||.|.|.|.||||    |||||
Sbjct    1  ATGGGTGCCCTTGTGAAA--GGATGCCGTTGTTTG---GAGAT------TGACTGCTGGGATGGAGCACAAAAT  63

Query   57  TAACC-----TAGA--------AAAAACTCAGAGG-----TTAC--TTGAAAAATTAGATATTCGGTGCAGTTA  110
            .||||     ||.|        |.|.|||||.|.|     || |  ||.||||.|  |.|||.|    .||.||
Sbjct   64  GAACCTGTTGTATATCATGGCTACACACTCACAAGCAAACTT-CTGTTTAAAACT--GTTATCC----AAGCTA  130

Query  111  TATTCATGTGAAACAGATTTTTAAGACATCTGACTACCCAGTGGTGCTCTCTTTAGAAAATCACTGCTCCACTG  184
            ||..||.|| |..||    ||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  131  TACACAAGT-ATGCA----TTCATGACATCTGACTACCCAGTGGTGCTCTCTTTAGAAAATCACTGCTCCACTG  199

Query  185  CCCAACAAGAAGTAATGGCAGACAATTTGCAGGCTACTTTTGGAGAGTCCTTGCTTTCTGATATGCTTGATGAT  258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  200  CCCAACAAGAAGTAATGGCAGACAATTTGCAGGCTACTTTTGGAGAGTCCTTGCTTTCTGATATGCTTGATGAT  273

Query  259  TTTCCTGATACTCTACCATCACCAGAGGCACTAAAATTCAAAATATTAGTTAAAAATAAGAAAATAGGAACCTT  332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  274  TTTCCTGATACTCTACCATCACCAGAGGCACTAAAATTCAAAATATTAGTTAAAAATAAGAAAATAGGAACCTT  347

Query  333  AAAGGAAACCCATGAAAGAAAAGGTTCTGATAAGCGT-------------------------------------  369
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                     
Sbjct  348  AAAGGAAACCCATGAAAGAAAAGGTTCTGATAAGCGTGGTAAGGTGGAGGAATGGGAAGAAGAAGTGGCAGATG  421

Query  370  --------------------------------------------------------------------------  369
                                                                                      
Sbjct  422  GAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGATAAATTCAAAGAATCAGAAGTATTG  495

Query  370  ------------GGAGACAATCAAGACAAGGAAACAGGGGTAAAAAAGTTACCTGGAGTAATGCTTTTCAAGAA  431
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  496  GAATCTGTTTTAGGAGACAATCAAGACAAGGAAACAGGGGTAAAAAAGTTACCTGGAGTAATGCTTTTCAAGAA  569

Query  432  AAAGAAGACCAGGAAGCTAAAAATTGCTCTGGCCTTATCTGATCTTGTCATTTATACGAAAGCTGAGAAATTCA  505
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  570  AAAGAAGACCAGGAAGCTAAAAATTGCTCTGGCCTTATCTGATCTTGTCATTTATACGAAAGCTGAGAAATTCA  643

Query  506  AAAGCTTTCAACATTCAAGATTATATCAGCAATTTAATGAAAATAATTCTATTGGGGAGACACAAGCCCGAAAA  579
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  644  AAAGCTTTCAACATTCAAGATTATATCAGCAATTTAATGAAAATAATTCTATTGGGGAGACACAAGCCCGAAAA  717

Query  580  CTTTCAAAATTGCGAGTCCATGAGTTTATTTTTCACACCAGGAAGTTCATTACCAGAATATATCCCAAAGCAAC  653
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  718  CTTTCAAAATTGCGAGTCCATGAGTTTATTTTTCACACCAGGAAGTTCATTACCAGAATATATCCCAAAGCAAC  791

Query  654  AAGAGCAGACTCTTCTAATTTTAATCCCCAAGAATTTTGGAATATAGGTTGTCAAATGGTGGCTTTAAATTTCC  727
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  792  AAGAGCAGACTCTTCTAATTTTAATCCCCAAGAATTTTGGAATATAGGTTGTCAAATGGTGGCTTTAAATTTCC  865

Query  728  AGACCCCTGGTCTGCCCATGGATCTGCAAAATGGGAAATTTTTGGATAATGGTGGTTCTGGATATATTTTGAAA  801
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  866  AGACCCCTGGTCTGCCCATGGATCTGCAAAATGGGAAATTTTTGGATAATGGTGGTTCTGGATATATTTTGAAA  939

Query  802  CCACATTTCTTAAGAGAGAGTAAATCATACTTTAACCCAAGTAACATAAAAGAGGGTATGCCAATTACACTTAC  875
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  940  CCACATTTCTTAAGAGAGAGTAAATCATACTTTAACCCAAGTAACATAAAAGAGGGTATGCCAATTACACTTAC  1013

Query  876  AATAAGGCTCATCAGTGGTATCCAGTTGCCTCTTACTCATTCATCATCTAACAAAGGTGATTCATTAGTAATTA  949
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1014  AATAAGGCTCATCAGTGGTATCCAGTTGCCTCTTACTCATTCATCATCTAACAAAGGTGATTCATTAGTAATTA  1087

Query  950  TAGAAGTTTTTGGTGTTCCAAATGATCAAATGAAGCAGCAGACTCGTGTAATTAAAAAAAATGCTTTTAGTCCA  1023
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1088  TAGAAGTTTTTGGTGTTCCAAATGATCAAATGAAGCAGCAGACTCGTGTAATTAAAAAAAATGCTTTTAGTCCA  1161

Query 1024  AGATGGAATGAAACATTCACATTTATTATTCATGTCCCAGAATTGGCATTGATACGTTTTGTTGTTGAAGGTCA  1097
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1162  AGATGGAATGAAACATTCACATTTATTATTCATGTCCCAGAATTGGCATTGATACGTTTTGTTGTTGAAGGTCA  1235

Query 1098  AGGTTTAATAGCAGGAAATGAATTTCTTGGGCAATATACTTTGCCACTTCTATGCATGAACAAAGGTTATCGTC  1171
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1236  AGGTTTAATAGCAGGAAATGAATTTCTTGGGCAATATACTTTGCCACTTCTATGCATGAACAAAGGTTATCGTC  1309

Query 1172  GTATTCCTCTGTTTTCCAGAATGGGTGAGAGCCTTGAGCCTGCTTCACTGTTTGTTTATGTTTGGTACGTCAGA  1245
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.| .||||
Sbjct 1310  GTATTCCTCTGTTTTCCAGAATGGGTGAGAGCCTTGAGCCTGCTTCACTGTTTGTTTATGTTTGTTTC-ACAGA  1382

Query 1246  -------------------------------  1245
                                           
Sbjct 1383  GCATCAACCCGGACACAGCCACTCTGTACCA  1413