Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12925
• Subject: XM_017020185.2
• Aligned Length: 1399
• Identities: 1043
• Gaps: 353

Alignment

Query    1  ATGGAAATGAGATGGTTTTTGTCAAAGATTCAGGATGACTTCAGAGGTGGAAAAATTAACCTAGAAAAAACTCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAGGTTACTTGAAAAATTAGATATTCGGTGCAGTTATATTCATGTGAAACAGATTTTTAAGACATCTGACTACC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CAGTGGTGCTCTCTTTAGAAAATCACTGCTCCACTGCCCAACAAGAAGTAATGGCAGACAATTTGCAGGCTACT  222
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------------------------ATGGCAGACAATTTGCAGGCTACT  24

Query  223  TTTGGAGAGTCCTTGCTTTCTGATATGCTTGATGATTTTCCTGATACTCTACCATCACCAGAGGCACTAAAATT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   25  TTTGGAGAGTCCTTGCTTTCTGATATGCTTGATGATTTTCCTGATACTCTACCATCACCAGAGGCACTAAAATT  98

Query  297  CAAAATATTAGTTAAAAATAAGAAAATAGGAACCTTAAAGGAAACCCATGAAAGAAAAGGTTCTGATAAGCGT-  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct   99  CAAAATATTAGTTAAAAATAAGAAAATAGGAACCTTAAAGGAAACCCATGAAAGAAAAGGTTCTGATAAGCGTG  172

Query  370  --------------------------------------------------------------------------  369
                                                                                      
Sbjct  173  GTAAGGTGGAGGAATGGGAAGAAGAAGTGGCAGATGGAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAG  246

Query  370  ------------------------------------------------GGAGACAATCAAGACAAGGAAACAGG  395
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  247  GAGGAGGAGGATAAATTCAAAGAATCAGAAGTATTGGAATCTGTTTTAGGAGACAATCAAGACAAGGAAACAGG  320

Query  396  GGTAAAAAAGTTACCTGGAGTAATGCTTTTCAAGAAAAAGAAGACCAGGAAGCTAAAAATTGCTCTGGCCTTAT  469
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  321  GGTAAAAAAGTTACCTGGAGTAATGCTTTTCAAGAAAAAGAAGACCAGGAAGCTAAAAATTGCTCTGGCCTTAT  394

Query  470  CTGATCTTGTCATTTATACGAAAGCTGAGAAATTCAAAAGCTTTCAACATTCAAGATTATATCAGCAATTTAAT  543
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  395  CTGATCTTGTCATTTATACGAAAGCTGAGAAATTCAAAAGCTTTCAACATTCAAGATTATATCAGCAATTTAAT  468

Query  544  GAAAATAATTCTATTGGGGAGACACAAGCCCGAAAACTTTCAAAATTGCGAGTCCATGAGTTTATTTTTCACAC  617
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  469  GAAAATAATTCTATTGGGGAGACACAAGCCCGAAAACTTTCAAAATTGCGAGTCCATGAGTTTATTTTTCACAC  542

Query  618  CAGGAAGTTCATTACCAGAATATATCCCAAAGCAACAAGAGCAGACTCTTCTAATTTTAATCCCCAAGAATTTT  691
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  543  CAGGAAGTTCATTACCAGAATATATCCCAAAGCAACAAGAGCAGACTCTTCTAATTTTAATCCCCAAGAATTTT  616

Query  692  GGAATATAGGTTGTCAAATGGTGGCTTTAAATTTCCAGACCCCTGGTCTGCCCATGGATCTGCAAAATGGGAAA  765
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  617  GGAATATAGGTTGTCAAATGGTGGCTTTAAATTTCCAGACCCCTGGTCTGCCCATGGATCTGCAAAATGGGAAA  690

Query  766  TTTTTGGATAATGGTGGTTCTGGATATATTTTGAAACCACATTTCTTAAGAGAGAGTAAATCATACTTTAACCC  839
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  691  TTTTTGGATAATGGTGGTTCTGGATATATTTTGAAACCACATTTCTTAAGAGAGAGTAAATCATACTTTAACCC  764

Query  840  AAGTAACATAAAAGAGGGTATGCCAATTACACTTACAATAAGGCTCATCAGTGGTATCCAGTTGCCTCTTACTC  913
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  765  AAGTAACATAAAAGAGGGTATGCCAATTACACTTACAATAAGGCTCATCAGTGGTATCCAGTTGCCTCTTACTC  838

Query  914  ATTCATCATCTAACAAAGGTGATTCATTAGTAATTATAGAAGTTTTTGGTGTTCCAAATGATCAAATGAAGCAG  987
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  839  ATTCATCATCTAACAAAGGTGATTCATTAGTAATTATAGAAGTTTTTGGTGTTCCAAATGATCAAATGAAGCAG  912

Query  988  CAGACTCGTGTAATTAAAAAAAATGCTTTTAGTCCAAGATGGAATGAAACATTCACATTTATTATTCATGTCCC  1061
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  913  CAGACTCGTGTAATTAAAAAAAATGCTTTTAGTCCAAGATGGAATGAAACATTCACATTTATTATTCATGTCCC  986

Query 1062  AGAATTGGCATTGATACGTTTTGTTGTTGAAGGTCAAGGTTTAATAGCAGGAAATGAATTTCTTGGGCAATATA  1135
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  987  AGAATTGGCATTGATACGTTTTGTTGTTGAAGGTCAAGGTTTAATAGCAGGAAATGAATTTCTTGGGCAATATA  1060

Query 1136  CTTTGCCACTTCTATGCATGAACAAAGGTTATCGTCGTATTCCTCTGTTTTCCAGAATGGGTGAGAGCCTTGAG  1209
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1061  CTTTGCCACTTCTATGCATGAACAAAGGTTATCGTCGTATTCCTCTGTTTTCCAGAATGGGTGAGAGCCTTGAG  1134

Query 1210  CCTGCTTCACTGTTTGTTTATGTTTGGTACGTCAGA-------------------------------  1245
            ||||||||||||||||||||||||||.|.| .||||                               
Sbjct 1135  CCTGCTTCACTGTTTGTTTATGTTTGTTTC-ACAGAGCATCAACCCGGACACAGCCACTCTGTACCA  1200