Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12925
- Subject:
- XM_017020186.1
- Aligned Length:
- 1276
- Identities:
- 1043
- Gaps:
- 230
Alignment
Query 1 ATGGAAATGAGATGGTTTTTGTCAAAGATTCAGGATGACTTCAGAGGTGGAAAAATTAACCTAGAAAAAACTCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GAGGTTACTTGAAAAATTAGATATTCGGTGCAGTTATATTCATGTGAAACAGATTTTTAAGACATCTGACTACC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CAGTGGTGCTCTCTTTAGAAAATCACTGCTCCACTGCCCAACAAGAAGTAATGGCAGACAATTTGCAGGCTACT 222
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --------------------------------------------------ATGGCAGACAATTTGCAGGCTACT 24
Query 223 TTTGGAGAGTCCTTGCTTTCTGATATGCTTGATGATTTTCCTGATACTCTACCATCACCAGAGGCACTAAAATT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 TTTGGAGAGTCCTTGCTTTCTGATATGCTTGATGATTTTCCTGATACTCTACCATCACCAGAGGCACTAAAATT 98
Query 297 CAAAATATTAGTTAAAAATAAGAAAATAGGAACCTTAAAGGAAACCCATGAAAGAAAAGGTTCTGATAAGCGTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 99 CAAAATATTAGTTAAAAATAAGAAAATAGGAACCTTAAAGGAAACCCATGAAAGAAAAGGTTCTGATAAGCGTG 172
Query 371 GAGACAATCAAGACAAGGAAACAGGGGTAAAAAAGTTACCTGGAGTAATGCTTTTCAAGAAAAAGAAGACCAGG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 173 GAGACAATCAAGACAAGGAAACAGGGGTAAAAAAGTTACCTGGAGTAATGCTTTTCAAGAAAAAGAAGACCAGG 246
Query 445 AAGCTAAAAATTGCTCTGGCCTTATCTGATCTTGTCATTTATACGAAAGCTGAGAAATTCAAAAGCTTTCAACA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 247 AAGCTAAAAATTGCTCTGGCCTTATCTGATCTTGTCATTTATACGAAAGCTGAGAAATTCAAAAGCTTTCAACA 320
Query 519 TTCAAGATTATATCAGCAATTTAATGAAAATAATTCTATTGGGGAGACACAAGCCCGAAAACTTTCAAAATTGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 321 TTCAAGATTATATCAGCAATTTAATGAAAATAATTCTATTGGGGAGACACAAGCCCGAAAACTTTCAAAATTGC 394
Query 593 GAGTCCATGAGTTTATTTTTCACACCAGGAAGTTCATTACCAGAATATATCCCAAAGCAACAAGAGCAGACTCT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 395 GAGTCCATGAGTTTATTTTTCACACCAGGAAGTTCATTACCAGAATATATCCCAAAGCAACAAGAGCAGACTCT 468
Query 667 TCTAATTTTAATCCCCAAGAATTTTGGAATATAGGTTGTCAAATGGTGGCTTTAAATTTCCAGACCCCTGGTCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 469 TCTAATTTTAATCCCCAAGAATTTTGGAATATAGGTTGTCAAATGGTGGCTTTAAATTTCCAGACCCCTGGTCT 542
Query 741 GCCCATGGATCTGCAAAATGGGAAATTTTTGGATAATGGTGGTTCTGGATATATTTTGAAACCACATTTCTTAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 543 GCCCATGGATCTGCAAAATGGGAAATTTTTGGATAATGGTGGTTCTGGATATATTTTGAAACCACATTTCTTAA 616
Query 815 GAGAGAGTAAATCATACTTTAACCCAAGTAACATAAAAGAGGGTATGCCAATTACACTTACAATAAGGCTCATC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 617 GAGAGAGTAAATCATACTTTAACCCAAGTAACATAAAAGAGGGTATGCCAATTACACTTACAATAAGGCTCATC 690
Query 889 AGTGGTATCCAGTTGCCTCTTACTCATTCATCATCTAACAAAGGTGATTCATTAGTAATTATAGAAGTTTTTGG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 691 AGTGGTATCCAGTTGCCTCTTACTCATTCATCATCTAACAAAGGTGATTCATTAGTAATTATAGAAGTTTTTGG 764
Query 963 TGTTCCAAATGATCAAATGAAGCAGCAGACTCGTGTAATTAAAAAAAATGCTTTTAGTCCAAGATGGAATGAAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 765 TGTTCCAAATGATCAAATGAAGCAGCAGACTCGTGTAATTAAAAAAAATGCTTTTAGTCCAAGATGGAATGAAA 838
Query 1037 CATTCACATTTATTATTCATGTCCCAGAATTGGCATTGATACGTTTTGTTGTTGAAGGTCAAGGTTTAATAGCA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 CATTCACATTTATTATTCATGTCCCAGAATTGGCATTGATACGTTTTGTTGTTGAAGGTCAAGGTTTAATAGCA 912
Query 1111 GGAAATGAATTTCTTGGGCAATATACTTTGCCACTTCTATGCATGAACAAAGGTTATCGTCGTATTCCTCTGTT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 913 GGAAATGAATTTCTTGGGCAATATACTTTGCCACTTCTATGCATGAACAAAGGTTATCGTCGTATTCCTCTGTT 986
Query 1185 TTCCAGAATGGGTGAGAGCCTTGAGCCTGCTTCACTGTTTGTTTATGTTTGGTACGTCAGA------------- 1245
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.| .||||
Sbjct 987 TTCCAGAATGGGTGAGAGCCTTGAGCCTGCTTCACTGTTTGTTTATGTTTGTTTC-ACAGAGCATCAACCCGGA 1059
Query 1246 ------------------ 1245
Sbjct 1060 CACAGCCACTCTGTACCA 1077