Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12925
- Subject:
- XM_024449256.1
- Aligned Length:
- 1399
- Identities:
- 1043
- Gaps:
- 353
Alignment
Query 1 ATGGAAATGAGATGGTTTTTGTCAAAGATTCAGGATGACTTCAGAGGTGGAAAAATTAACCTAGAAAAAACTCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GAGGTTACTTGAAAAATTAGATATTCGGTGCAGTTATATTCATGTGAAACAGATTTTTAAGACATCTGACTACC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CAGTGGTGCTCTCTTTAGAAAATCACTGCTCCACTGCCCAACAAGAAGTAATGGCAGACAATTTGCAGGCTACT 222
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --------------------------------------------------ATGGCAGACAATTTGCAGGCTACT 24
Query 223 TTTGGAGAGTCCTTGCTTTCTGATATGCTTGATGATTTTCCTGATACTCTACCATCACCAGAGGCACTAAAATT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 TTTGGAGAGTCCTTGCTTTCTGATATGCTTGATGATTTTCCTGATACTCTACCATCACCAGAGGCACTAAAATT 98
Query 297 CAAAATATTAGTTAAAAATAAGAAAATAGGAACCTTAAAGGAAACCCATGAAAGAAAAGGTTCTGATAAGCGT- 369
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 99 CAAAATATTAGTTAAAAATAAGAAAATAGGAACCTTAAAGGAAACCCATGAAAGAAAAGGTTCTGATAAGCGTG 172
Query 370 -------------------------------------------------------------------------- 369
Sbjct 173 GTAAGGTGGAGGAATGGGAAGAAGAAGTGGCAGATGGAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAG 246
Query 370 ------------------------------------------------GGAGACAATCAAGACAAGGAAACAGG 395
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 247 GAGGAGGAGGATAAATTCAAAGAATCAGAAGTATTGGAATCTGTTTTAGGAGACAATCAAGACAAGGAAACAGG 320
Query 396 GGTAAAAAAGTTACCTGGAGTAATGCTTTTCAAGAAAAAGAAGACCAGGAAGCTAAAAATTGCTCTGGCCTTAT 469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 321 GGTAAAAAAGTTACCTGGAGTAATGCTTTTCAAGAAAAAGAAGACCAGGAAGCTAAAAATTGCTCTGGCCTTAT 394
Query 470 CTGATCTTGTCATTTATACGAAAGCTGAGAAATTCAAAAGCTTTCAACATTCAAGATTATATCAGCAATTTAAT 543
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 395 CTGATCTTGTCATTTATACGAAAGCTGAGAAATTCAAAAGCTTTCAACATTCAAGATTATATCAGCAATTTAAT 468
Query 544 GAAAATAATTCTATTGGGGAGACACAAGCCCGAAAACTTTCAAAATTGCGAGTCCATGAGTTTATTTTTCACAC 617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 469 GAAAATAATTCTATTGGGGAGACACAAGCCCGAAAACTTTCAAAATTGCGAGTCCATGAGTTTATTTTTCACAC 542
Query 618 CAGGAAGTTCATTACCAGAATATATCCCAAAGCAACAAGAGCAGACTCTTCTAATTTTAATCCCCAAGAATTTT 691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 543 CAGGAAGTTCATTACCAGAATATATCCCAAAGCAACAAGAGCAGACTCTTCTAATTTTAATCCCCAAGAATTTT 616
Query 692 GGAATATAGGTTGTCAAATGGTGGCTTTAAATTTCCAGACCCCTGGTCTGCCCATGGATCTGCAAAATGGGAAA 765
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 617 GGAATATAGGTTGTCAAATGGTGGCTTTAAATTTCCAGACCCCTGGTCTGCCCATGGATCTGCAAAATGGGAAA 690
Query 766 TTTTTGGATAATGGTGGTTCTGGATATATTTTGAAACCACATTTCTTAAGAGAGAGTAAATCATACTTTAACCC 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 691 TTTTTGGATAATGGTGGTTCTGGATATATTTTGAAACCACATTTCTTAAGAGAGAGTAAATCATACTTTAACCC 764
Query 840 AAGTAACATAAAAGAGGGTATGCCAATTACACTTACAATAAGGCTCATCAGTGGTATCCAGTTGCCTCTTACTC 913
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 765 AAGTAACATAAAAGAGGGTATGCCAATTACACTTACAATAAGGCTCATCAGTGGTATCCAGTTGCCTCTTACTC 838
Query 914 ATTCATCATCTAACAAAGGTGATTCATTAGTAATTATAGAAGTTTTTGGTGTTCCAAATGATCAAATGAAGCAG 987
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 ATTCATCATCTAACAAAGGTGATTCATTAGTAATTATAGAAGTTTTTGGTGTTCCAAATGATCAAATGAAGCAG 912
Query 988 CAGACTCGTGTAATTAAAAAAAATGCTTTTAGTCCAAGATGGAATGAAACATTCACATTTATTATTCATGTCCC 1061
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 913 CAGACTCGTGTAATTAAAAAAAATGCTTTTAGTCCAAGATGGAATGAAACATTCACATTTATTATTCATGTCCC 986
Query 1062 AGAATTGGCATTGATACGTTTTGTTGTTGAAGGTCAAGGTTTAATAGCAGGAAATGAATTTCTTGGGCAATATA 1135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 987 AGAATTGGCATTGATACGTTTTGTTGTTGAAGGTCAAGGTTTAATAGCAGGAAATGAATTTCTTGGGCAATATA 1060
Query 1136 CTTTGCCACTTCTATGCATGAACAAAGGTTATCGTCGTATTCCTCTGTTTTCCAGAATGGGTGAGAGCCTTGAG 1209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1061 CTTTGCCACTTCTATGCATGAACAAAGGTTATCGTCGTATTCCTCTGTTTTCCAGAATGGGTGAGAGCCTTGAG 1134
Query 1210 CCTGCTTCACTGTTTGTTTATGTTTGGTACGTCAGA------------------------------- 1245
||||||||||||||||||||||||||.|.| .||||
Sbjct 1135 CCTGCTTCACTGTTTGTTTATGTTTGTTTC-ACAGAGCATCAACCCGGACACAGCCACTCTGTACCA 1200