Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12955
- Subject:
- XR_928360.3
- Aligned Length:
- 4465
- Identities:
- 2955
- Gaps:
- 1510
Alignment
Query 1 -----------------------------------------------------------------------ATG 3
|||
Sbjct 1 GATGGGGGGCTGGAGGCTGTGAGGCTTCCAGCGTCGGTACCATGGCGACGCGCGGTGGGGCTGGGGTGGCAATG 74
Query 4 GCGGTTTGGTCCCTCTTATCCGCCCGGGCCGTGACCGCGTTCCTTCTGTTGTTCCTCCCTCGCTTCTTACAGGC 77
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCGGTTTGGTCCCTCTTATCCGCCCGGGCCGTGACCGCGTTCCTTCTGTTGTTCCTCCCTCGCTTCTTACAGGC 148
Query 78 CCAGACCTTCTCTTTCCCTTTCCAGCAGCCGGAGAAGTGCGACAACAACCAGTACTTTGATATCTCCGCCCTCT 151
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCAGACCTTCTCTTTCCCTTTCCAGCAGCCGGAGAAGTGCGACAACAACCAGTACTTTGATATCTCCGCCCTCT 222
Query 152 CGTGTGTTCCTTGTGGAGCTAACCAGAGGCAAGATGCCCGAGGAACTTCATGTGTATGTCTACCAGGATTTCAG 225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CGTGTGTTCCTTGTGGAGCTAACCAGAGGCAAGATGCCCGAGGAACTTCATGTGTATGTCTACCAGGATTTCAG 296
Query 226 ATGATCTCTAATAATGGAGGACCTGCTATTATTTGTAAAAAGTGCCCAGAAAACATGAAAGGTGTTACAGAAGA 299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATGATCTCTAATAATGGAGGACCTGCTATTATTTGTAAAAAGTGCCCAGAAAACATGAAAGGTGTTACAGAAGA 370
Query 300 TGGCTGGAACTGCATTTCTTGCCCTAGTGACTTAACTGCCGAAGGAAAATGTCACTGTCCCATTGGCCATATTT 373
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGGCTGGAACTGCATTTCTTGCCCTAGTGACTTAACTGCCGAAGGAAAATGTCACTGTCCCATTGGCCATATTT 444
Query 374 TAGTGGAAAGAGACATTAATGGAACATTGTTGTCTCAAGCAACTTGTGAGCTCTGTGATGGAAATGAAAACTCT 447
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TAGTGGAAAGAGACATTAATGGAACATTGTTGTCTCAAGCAACTTGTGAGCTCTGTGATGGAAATGAAAACTCT 518
Query 448 TTTATGGTAGTAAATGCTTTAGGAGACAGGTGCGTCCGATGTGAGCCAACATTTGTTAATACCAGCAGGTCCTG 521
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TTTATGGTAGTAAATGCTTTAGGAGACAGGTGCGTCCGATGTGAGCCAACATTTGTTAATACCAGCAGGTCCTG 592
Query 522 TGCATGTTCAGAACCTAACATTTTAACAGGGGGATTATGTTTCAGCAGCACAGGGAATTTTCCTCTACGTAGAA 595
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGCATGTTCAGAACCTAACATTTTAACAGGGGGATTATGTTTCAGCAGCACAGGGAATTTTCCTCTACGTAGAA 666
Query 596 TTTCAGCTGCACGTTATGGAGAAGTTGGCATGTCTTTAACTTCAGAATGGTTTGCAAAGTATTTGCAATCATCA 669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TTTCAGCTGCACGTTATGGAGAAGTTGGCATGTCTTTAACTTCAGAATGGTTTGCAAAGTATTTGCAATCATCA 740
Query 670 GCAGCTGCATGTTGGGTATATGCCAATCTAACATCTTGTCAAGCTCTTGGAAATATGTGTGTGATGAACATGAA 743
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCAGCTGCATGTTGGGTATATGCCAATCTAACATCTTGTCAAGCTCTTGGAAATATGTGTGTGATGAACATGAA 814
Query 744 TTCTTACGACTTTGCCACATTTGATGCATGTGGACTATTTCAGTTTATCTTTGAAAATACTGCTGGACTGAGCA 817
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTCTTACGACTTTGCCACATTTGATGCATGTGGACTATTTCAGTTTATCTTTGAAAATACTGCTGGACTGAGCA 888
Query 818 CTGTTCATTCTATTTCATTTTGGAGACAGAATCTTCCTTGGCTGTTTTATGGAGACCAGTTAGGATTAGCACCT 891
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGTTCATTCTATTTCATTTTGGAGACAGAATCTTCCTTGGCTGTTTTATGGAGACCAGTTAGGATTAGCACCT 962
Query 892 CAAGTGCTCAGTTCTACCTCTCTTCCTACAAATTTCAGTTTTAAAGGAGAAAACCAGAATACAAAACTGAAGTT 965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAAGTGCTCAGTTCTACCTCTCTTCCTACAAATTTCAGTTTTAAAGGAGAAAACCAGAATACAAAACTGAAGTT 1036
Query 966 TGTTGCTGCTTCCTATGATATAAGAGGAAATTTTCTCAAGTGGCAAACTTTAGAAGGAGGTGTTTTACAGCTTT 1039
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGTTGCTGCTTCCTATGATATAAGAGGAAATTTTCTCAAGTGGCAAACTTTAGAAGGAGGTGTTTTACAGCTTT 1110
Query 1040 GTCCAGACACAGAGACAAGGCTAAATGCTGCTTATTCATTTGGAACAACCTACCAACAAAATTGTGAGATTCCT 1113
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTCCAGACACAGAGACAAGGCTAAATGCTGCTTATTCATTTGGAACAACCTACCAACAAAATTGTGAGATTCCT 1184
Query 1114 ATCTCTAAGATCTTAATTGACTTTCCCACTCCTATATTTTATGATGTGTACCTTGAATATACTGATGAAAATCA 1187
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ATCTCTAAGATCTTAATTGACTTTCCCACTCCTATATTTTATGATGTGTACCTTGAATATACTGATGAAAATCA 1258
Query 1188 ACATCAATATATTTTGGCTGTGCCTGTGTTAAACCTAAATCTTCAACATAATAAGATATTTGTGAACCAAGACA 1261
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ACATCAATATATTTTGGCTGTGCCTGTGTTAAACCTAAATCTTCAACATAATAAGATATTTGTGAACCAAGACA 1332
Query 1262 GCAACTCTGGAAAGTGGCTTCTAACTCGGCGCATTTTCTTAGTGGATGCAGTAAGTGGACGAGAAAATGACTTA 1335
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GCAACTCTGGAAAGTGGCTTCTAACTCGGCGCATTTTCTTAGTGGATGCAGTAAGTGGACGAGAAAATGACTTA 1406
Query 1336 GGAACTCAGCCAAGAGTAATTCGAGTTGCTACTCAAATATCACTGAGTGTCCACCTTGTACCCAACACAATAAA 1409
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGAACTCAGCCAAGAGTAATTCGAGTTGCTACTCAAATATCACTGAGTGTCCACCTTGTACCCAACACAATAAA 1480
Query 1410 TGGAAACATCTACCCTCCCTTAATCACCATTGCCTACAGTGACATTGATATCAAAGATGCCAACAGCCAGTCTG 1483
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGGAAACATCTACCCTCCCTTAATCACCATTGCCTACAGTGACATTGATATCAAAGATGCCAACAGCCAGTCTG 1554
Query 1484 TGAAGGTTTCTTTCTCAGTCACATATGAAATGGATCATGGAGAAGCACATGTCCAGACAGATATTGCTTTGGGT 1557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TGAAGGTTTCTTTCTCAGTCACATATGAAATGGATCATGGAGAAGCACATGTCCAGACAGATATTGCTTTGGGT 1628
Query 1558 GTATTGGGTGGGCTAGCTGTTTTAGCATCTCTTTTGAAGACAGCAGGATGGAAGAGGCGCATTGGGAGTCCCAT 1631
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GTATTGGGTGGGCTAGCTGTTTTAGCATCTCTTTTGAAGACAGCAGGATGGAAGAGGCGCATTGGGAGTCCCAT 1702
Query 1632 GATTGATTTACAGACAGTTGTGAAATTCTTGGTGTACTATGCTGGTGATCTGGCCAATGTTTTCTTTATCATCA 1705
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GATTGATTTACAGACAGTTGTGAAATTCTTGGTGTACTATGCTGGTGATCTGGCCAATGTTTTCTTTATCATCA 1776
Query 1706 CAGTGGGAACAGGTCTTTACTGGCTTATTTTCTTCAAAGCACAGAAGTCTGTGTCTGTTTTGCTGCCAATGCCA 1779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CAGTGGGAACAGGTCTTTACTGGCTTATTTTCTTCAAAGCACAGAAGTCTGTGTCTGTTTTGCTGCCAATGCCA 1850
Query 1780 ATTCAGGAAGAACGTTTTGTCACTTATGTTGGATGTGCCTTTGCTCTGAAGGCACTACAATTTTTGCATAAGCT 1853
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ATTCAGGAAGAACGTTTTGTCACTTATGTTGGATGTGCCTTTGCTCTGAAGGCACTACAATTTTTGCATAAGCT 1924
Query 1854 CATATCCCAGATTACAATAGATGTATTCTTTATTGATTGGGAGCGACCTAAAGGAAAGGTTCTTAAAGCTGTTG 1927
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CATATCCCAGATTACAATAGATGTATTCTTTATTGATTGGGAGCGACCTAAAGGAAAGGTTCTTAAAGCTGTTG 1998
Query 1928 AAGGTGAGGGTGGTGTACGAAGTGCCACTGTTCCTGTAAGCATATGGAGAACATATTTTGTAGCAAATGAATGG 2001
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AAGGTGAGGGTGGTGTACGAAGTGCCACTGTTCCTGTAAGCATATGGAGAACATATTTTGTAGCAAATGAATGG 2072
Query 2002 AATGAAATTCAGACTGTGAGAAAAATTAATTCACTCTTTCAAGTACTTACTGTCCTCTTCTTTTTGGAGGTTGT 2075
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AATGAAATTCAGACTGTGAGAAAAATTAATTCACTCTTTCAAGTACTTACTGTCCTCTTCTTTTTGGAGGTTGT 2146
Query 2076 GGGATTCAAGAACTTAGCATTAATGGACTCATCTTCTAGTCTTTCTAGAAACCCACCTAGCTACATAGCTCCTT 2149
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GGGATTCAAGAACTTAGCATTAATGGACTCATCTTCTAGTCTTTCTAGAAACCCACCTAGCTACATAGCTCCTT 2220
Query 2150 ATAGCTGCATTTTGAGATATGCAGTGTCTGCTGCTCTTTGGCTAGCCATTGGAATTATACAGGTCGTGTTCTTT 2223
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 ATAGCTGCATTTTGAGATATGCAGTGTCTGCTGCTCTTTGGCTAGCCATTGGAATTATACAGGTCGTGTTCTTT 2294
Query 2224 GCTGTCTTTTATGAGAGATTTATAGAAGATAAAATTCGACAGTTCGTTGATTTATGCTCTATGAGTAATATATC 2297
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GCTGTCTTTTATGAGAGATTTATAGAAGATAAAATTCGACAGTTCGTTGATTTATGCTCTATGAGTAATATATC 2368
Query 2298 AGTGTTTCTGTTATCCCACAAATGTTTTGGATATTACATTCATGGTAGATCAGTACATGGGCATGCAGATACTA 2371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 AGTGTTTCTGTTATCCCACAAATGTTTTGGATATTACATTCATGGTAGATCAGTACATGGGCATGCAGATACTA 2442
Query 2372 ATATGGAAGAAATGAATATGAACCTTAAAAGAGAAGCGGAAAATTTGTGTAGCCAGAGAGGTTTGGTACCCAAC 2445
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 ATATGGAAGAAATGAATATGAACCTTAAAAGAGAAGCGGAAAATTTGTGTAGCCAGAGAGGTTTGGTACCCAAC 2516
Query 2446 ACAGATGGTCAGACTTTTGAGATTGCAATTTCTAACCAGATGAGACAACATTATGACAGAATTCATGAGACACT 2519
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 ACAGATGGTCAGACTTTTGAGATTGCAATTTCTAACCAGATGAGACAACATTATGACAGAATTCATGAGACACT 2590
Query 2520 AATAAGGAAAAATGGTCCTGCTAGACTACTGAGTTCATCAGCAAGTACTTTTGAGCAGAGTATAAAAGCATATC 2593
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 AATAAGGAAAAATGGTCCTGCTAGACTACTGAGTTCATCAGCAAGTACTTTTGAGCAGAGTATAAAAGCATATC 2664
Query 2594 ATATGATGAATAAATTTCTTGGCTCCTTCATTGACCATGTTCATAAGGAAATGGATTACTTTATAAAAGATAAG 2667
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 ATATGATGAATAAATTTCTTGGCTCCTTCATTGACCATGTTCATAAGGAAATGGATTACTTTATAAAAGATAAG 2738
Query 2668 TTGCTTCTTGAAAGAATTCTTGGAATGGAATTCATGGAACCAATGGAAAAAAGCATCTTTTACAATGATGAAGG 2741
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TTGCTTCTTGAAAGAATTCTTGGAATGGAATTCATGGAACCAATGGAAAAAAGCATCTTTTACAATGATGAAGG 2812
Query 2742 TTATTCTTTCAGCAGTGTCCTGTATTATGGAAATGAAGCTACTCTTCTTATTTTTGATCTGCTGTTCTTCTGTG 2815
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 TTATTCTTTCAGCAGTGTCCTGTATTATGGAAATGAAGCTACTCTTCTTATTTTTGATCTGCTGTTCTTCTGTG 2886
Query 2816 TTGTGGATTTGGCTTGCCAAAATTTTATTTTAGCATCCTTCCTTACATATCTACAACAAGAGATTTTTAGATAT 2889
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 TTGTGGATTTGGCTTGCCAAAATTTTATTTTAGCATCCTTCCTTACATATCTACAACAAGAGATTTTTAGATAT 2960
Query 2890 ATCCGTAATACAGTAGGACAAAAGAATTTGGCATCCAAAACATTGGTGGATCAAAGATTTTTGATT-------- 2955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 ATCCGTAATACAGTAGGACAAAAGAATTTGGCATCCAAAACATTGGTGGATCAAAGATTTTTGATTTAACTTCC 3034
Query 2956 -------------------------------------------------------------------------- 2955
Sbjct 3035 TGAATAAATAACTTAAAGACTCAGTATAATCATGGCCAAAAAAAAGTCATGATATCAGAAACTCCAGTAAGCAC 3108
Query 2956 -------------------------------------------------------------------------- 2955
Sbjct 3109 CCAGGCTCTGCCCTGGCTCCTGGTGCTCCTGCCTCCTGACTGGTGCTTTCCCCCATGGCTGTGCATGGTGTGCC 3182
Query 2956 -------------------------------------------------------------------------- 2955
Sbjct 3183 GTGCCATCTGTTTCTAGGACCTACAGGAAGACTCAAGTTTGTATTTGACCAAACCCATGGCTGACAGCAGATGG 3256
Query 2956 -------------------------------------------------------------------------- 2955
Sbjct 3257 CAGTGGAGTGCACAGTAACCTTTTCAGGACCAGGCTGGGGCCCTTCTGACTGTAGCTCAAAGTGAAAGCCATTC 3330
Query 2956 -------------------------------------------------------------------------- 2955
Sbjct 3331 GCCAATCTTCCAACCTTTTGAGAATACCCTGTCATGTAATATCCAAGTGAACTGGTGAGTATCTAGTCCCCAAC 3404
Query 2956 -------------------------------------------------------------------------- 2955
Sbjct 3405 CCAAATATTATGAAAAGCCCTGCCTCCTTCCAGGTTTCTGAGGATTCCTGGGAAGGTGTGCATGAGTGCATGCA 3478
Query 2956 -------------------------------------------------------------------------- 2955
Sbjct 3479 TGTGCTTGTGTGTGTGTGCATGTGTGTGTGTGTGTTTGTGCTTGTGTGCCTGTGTGTGTGGTGGACGTCACAGC 3552
Query 2956 -------------------------------------------------------------------------- 2955
Sbjct 3553 AGAGGAGCTGAATGTGCAGAAGGCATGGTGGCTTCTGTTCGTCAAGTCACCTCCCCCTCTGAATGGTTCTGCTG 3626
Query 2956 -------------------------------------------------------------------------- 2955
Sbjct 3627 AATTCCTGTTTCTCTTGCCCTGCAGCTATTGTTCTTCTACCACTTCACCTTTCCTTCATTTTCCAAAGCACCAT 3700
Query 2956 -------------------------------------------------------------------------- 2955
Sbjct 3701 TAACATTAGACAACTGCAAGTTTTAACCTTTGCTGAAAGTCGGGAGTAATGGAGAGGGGCACTGCTTGGAAAAC 3774
Query 2956 -------------------------------------------------------------------------- 2955
Sbjct 3775 AACTTCAAGCTGGACATCAGGTCTTGCCATCCTCCAAGTCCTTCAGCCAACTCTCCAGCACAGGAAATTTACAT 3848
Query 2956 -------------------------------------------------------------------------- 2955
Sbjct 3849 TACTGTCTTTCCTTTTAGGCCCTGGCCTGCTGCTGTGCTCCTAGGGCCAACTTTCCTCTCTACCCTCATTCCTC 3922
Query 2956 -------------------------------------------------------------------------- 2955
Sbjct 3923 TGTATCATCTTCTTGGAGTCCCCAGGGTTCCTGTACCTTTCTCCTTCACCAGCAGTGACTCAAAAACTCTCTAT 3996
Query 2956 -------------------------------------------------------------------------- 2955
Sbjct 3997 ACAGAAGGAGGAGCTCAGTGAGAACAGCCTGATTGGAAACTGGGGCTAGAGGTCTTATCTCAAAGTCTGCTTTG 4070
Query 2956 -------------------------------------------------------------------------- 2955
Sbjct 4071 CTTTGAAGCACACTGTTTTTACTTAGATTGTATGCTACTTGGATTGGGTAGGGGTACCCATGGAGGCTACAGGA 4144
Query 2956 -------------------------------------------------------------------------- 2955
Sbjct 4145 AAGAGCTTAAGCCACTTCCATTGATACAACCACCCCTTATTTTAGCATTGCAACTCCACCATCTCTCTACTTTA 4218
Query 2956 -------------------------------------------------------------------------- 2955
Sbjct 4219 CCTACAGAACAATTTCCTTATCTGCCAGAACCTCCTCTTTCCAGAATATGCCTTGGAGAGATCACCTTCTATAA 4292
Query 2956 -------------------------------------------------------------------------- 2955
Sbjct 4293 TCAAAAGACCCCTCTAGGTATTTTTCAAGCAAAAGAGCAGACTTGTTTCTTCCACCTTCCAGAATGTGAAAGCA 4366
Query 2956 -------------------------------------------------------------------------- 2955
Sbjct 4367 ACTTCAGACATTTCTTTTTAGAATAGCAATTGGGCCGGGCAGGGTGGCTTACACCTGTAATCCCAGCATTTTGG 4440
Query 2956 ------------------------- 2955
Sbjct 4441 GAGGCCAAGGCAGGCGGATCACTTG 4465
