Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_13005
Subject:
NM_029277.2
Aligned Length:
846
Identities:
710
Gaps:
80

Alignment

Query   1  MKMADRSGKIIPGQVYIEVEYDYEYEAKDRKIVIKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDENSKAFYVPAQYVKEVTR  74
             ||.|||||..||.||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct   1  --MAERSGKITAGQAYIEVEYDYEYDAKDRKIVIRQGERYLLVKKTNDDWWQVRPDENSKAFYVPAQYVKEVTR  72

Query  75  KALMPPVKQVAGLPNNSTKIMQSLHLQRSTENVNKLPELSSFGKPSSSVQGTGLIRDANQNFGPSYNQGQTVNL  148
           |||||||||..||||||.|..||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||..||.|||.||
Sbjct  73  KALMPPVKQATGLPNNSMKTIQSMHLQRSTENVNKMPELSSFGKPSSSVQGTGLIRDANQNFGSNYNSGQTLNL  146

Query 149  SLDLTHNNGKFNNDSHSPKVSSQNRTRSFGHFPGPEFLDVEKTSFSQEQSCDSAGEGSERIHQDSESGDELSSS  222
           ||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 147  SLDLTHNNGKFNSDSHSPKVSSQNRTRLFGHFPGPEFLDIEKTSFSQEQSCDSAGEGSERIQQDSESGDELSSS  220

Query 223  STEQIRATTPPNQGRPDSPVYANLQELKISQSALPPLPGSPAIQINGEWETHKDSSGRCYYYNRGTQERTWKPP  296
           ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 221  STEQMRATTPPNQGRPDSPVYANLQELKISQSALPPLPGSPAIQVNGEWETHKDSSGRCYYYNRTTQERTWKPP  294

Query 297  RWTRDASISKGDFQNPGDQE-----------------------------------------------WLKHVDD  323
           ||.||.|.|. |||.||.||                                               |||||||
Sbjct 295  RWARDVSTSR-DFQSPGEQEPLSSEENYHSSCFSQSDSQCGSPPRGWSEELDERGHTLYTSDYTKEKWLKHVDD  367

Query 324  QGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKWRHSTIVLDTNDKESPTASKPCFPE  397
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||             
Sbjct 368  QGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKWRHSTIVLDSND-------------  428

Query 398  NESSPSSPKHQDTASSPKDQEKYGLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKP  471
                            |.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 429  -----------------KGQEKYGLLNVTKITENGKKVRKNWLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKP  485

Query 472  EFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVETDEGIEEEIPDS  545
           |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||..|.||..|||.|||
Sbjct 486  EFTVDLKGAVIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDNDAVINDWFKVLSSTINNQVAEADEAAEEETPDS  559

Query 546  PGIEKHDKEKEQKDPKKLRSFKVSSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQREN  619
           ||.|||||||.||..|||||.|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 560  PGVEKHDKEKDQKELKKLRSMKGSSMDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQREN  633

Query 620  GTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPEP  693
           ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 634  GTVPKFVKLCIEHVEEHGLDVDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPEP  707

Query 694  LFTFNHFNDFVNAIKQEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLK  767
           ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 708  LFTFNHFNDFVNAIKQEPRQRVTAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRHLKRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLK  781

Query 768  PEKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR  799
           ||.||||||||||||||||||||||||..|||
Sbjct 782  PERETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSTVFGR  813