Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13005
• Subject: XM_006526315.1
• Aligned Length: 2397
• Identities: 2123
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGAAAATGGCTGACAGAAGTGGGAAGATTATTCCAGGACAAGTGTATATTGAGGTGGAATATGATTATGAATA  74
                  |||||.||.||||||||.|||||.|.|.|||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct    1  ------ATGGCCGAGAGAAGTGGAAAGATCACTGCAGGACAAGCGTATATTGAGGTGGAGTATGATTATGAGTA  68

Query   75  TGAAGCAAAGGACAGAAAGATTGTGATAAAACAAGGGGAGAGGTACATCTTGGTGAAAAAGACCAATGATGACT  148
            |||.|||||||||||||||||||||||.|.||||||||||.|.|||.||.|||||||.||||||||||||||||
Sbjct   69  TGACGCAAAGGACAGAAAGATTGTGATCAGACAAGGGGAGCGCTACCTCCTGGTGAAGAAGACCAATGATGACT  142

Query  149  GGTGGCAAGTCAAGCCAGATGAAAACTCCAAAGCGTTTTATGTGCCAGCCCAGTATGTGAAGGAGGTCACGCGC  222
            ||||||||||||..||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  143  GGTGGCAAGTCAGACCTGATGAGAACTCAAAAGCATTTTATGTGCCAGCACAGTATGTCAAGGAGGTCACTCGC  216

Query  223  AAAGCTCTCATGCCACCTGTTAAGCAGGTAGCTGGTCTGCCAAATAACTCCACGAAAATAATGCAGAGTTTGCA  296
            ||||||||.|||||||||||.|||||||.|.|.||.||||||||||||||.|.|||.|.|||.||||||.||||
Sbjct  217  AAAGCTCTGATGCCACCTGTGAAGCAGGCAACAGGACTGCCAAATAACTCTATGAAGACAATACAGAGTATGCA  290

Query  297  TCTTCAGAGATCAACAGAAAATGTGAACAAATTGCCTGAGCTTTCAAGTTTCGGAAAGCCATCGTCATCTGTTC  370
            |||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  291  TCTCCAGAGATCGACAGAAAATGTGAACAAAATGCCTGAGCTTTCAAGTTTTGGAAAGCCATCGTCATCTGTTC  364

Query  371  AAGGAACAGGTCTTATTCGTGATGCCAATCAGAATTTTGGACCCAGTTATAATCAAGGTCAGACTGTCAACCTA  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||.|||||||..|||.||||||.||||||||
Sbjct  365  AAGGAACAGGTCTTATTCGTGATGCCAATCAGAATTTCGGATCCAATTATAATTCAGGCCAGACTCTCAACCTA  438

Query  445  AGCCTGGACCTGACCCATAATAACGGAAAGTTTAACAATGACTCACATTCTCCTAAAGTTTCCAGCCAGAATAG  518
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  439  AGCCTGGACCTGACCCATAATAATGGAAAGTTTAACAGTGACTCACATTCTCCTAAAGTTTCCAGCCAGAATAG  512

Query  519  GACACGCTCATTTGGTCATTTTCCCGGTCCAGAGTTCTTGGATGTAGAGAAAACTAGCTTCTCCCAGGAACAAT  592
            ||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  513  GACACGCTTATTTGGTCATTTTCCCGGGCCAGAGTTCTTGGACATAGAGAAAACTAGCTTCTCTCAGGAACAGT  586

Query  593  CTTGTGATTCCGCAGGAGAAGGCTCTGAAAGAATACATCAAGATTCTGAATCTGGTGATGAACTTAGCAGCAGC  666
            |.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  587  CATGTGACTCAGCTGGAGAAGGCTCCGAAAGAATACAGCAGGATTCCGAGTCTGGAGATGAACTTAGCAGCAGC  660

Query  667  TCCACTGAACAGATAAGGGCAACCACACCTCCAAATCAAGGAAGGCCAGATTCTCCTGTCTATGCTAACCTTCA  740
            ||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  661  TCCACTGAGCAGATGAGGGCAACCACACCCCCTAATCAAGGAAGGCCAGATTCTCCAGTCTATGCTAACCTACA  734

Query  741  AGAACTGAAAATATCCCAGTCTGCTCTTCCCCCACTTCCTGGGAGCCCGGCAATTCAGATTAATGGAGAATGGG  814
            .||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||..|||||||.|||||||
Sbjct  735  GGAACTGAAAATATCACAGTCTGCTCTTCCTCCTCTTCCTGGGAGCCCAGCAATTCAAGTTAATGGGGAATGGG  808

Query  815  AAACTCATAAAGACAGCTCAGGGCGTTGCTATTACTATAACAGAGGGACACAGGAAAGAACTTGGAAACCTCCT  888
            |.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||.|....||.|||||..||||.||||||||.|||
Sbjct  809  AGACTCACAAAGACAGTTCAGGCCGTTGTTACTACTATAACCGCACAACCCAGGAGCGAACCTGGAAACCACCT  882

Query  889  CGTTGGACTCGGGATGCAAGCATCAGCAAAGGAGATTTCCAAAATCCAGGGGATCAAGAGTGGCTCAAGCATGT  962
            ||.|||.||||.||||..||||..|||   .|||||||.||.|..|||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  883  CGATGGGCTCGAGATGTGAGCACAAGC---CGAGATTTTCAGAGCCCAGGAGAGCAAGAGTGGCTCAAGCATGT  953

Query  963  TGATGATCAAGGTAGACAATATTACTACAGTGCAGACGGATCTCGGTCAGAATGGGAATTGCCAAAGTATAATG  1036
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  954  TGATGATCAAGGTAGACAGTATTACTACAGCGCAGATGGATCTCGGTCAGAGTGGGAATTGCCAAAGTATAATG  1027

Query 1037  CTTCATCCCAGCAGCAAAGAGAAATAATTAAAAGTAGGAGCCTGGACAGGCGGCTGCAAGAACCAATAGTATTA  1110
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1028  CTTCATCTCAGCAGCAAAGAGAAATAATTAAAAGTAGGAGCTTGGACAGGCGGCTGCAAGAACCAATAGTGTTA  1101

Query 1111  ACAAAGTGGAGACATAGCACCATTGTATTGGACACTAATGATAAGGAATCTCCAACTGCCTCAAAACCCTGCTT  1184
            ||.||.||||||||||||||||||||.||||||.|.||.||.|||||.|||||||||.||.||||||.||||||
Sbjct 1102  ACTAAATGGAGACATAGCACCATTGTGTTGGACTCCAACGACAAGGATTCTCCAACTACCACAAAACTCTGCTT  1175

Query 1185  TCCTGAAAATGAGTCTTCTCCCTCCTCACCAAAGCACCAAGATACAGCCAGCAGTCCAAAGGATCAAGAGAAAT  1258
            .|||||||||||.|||.||||..|.|||.|||||||.||||||.|||||.||||||..||||.|||.|||||||
Sbjct 1176  ACCTGAAAATGAATCTCCTCCTACTTCATCAAAGCATCAAGATCCAGCCGGCAGTCTGAAGGGTCAGGAGAAAT  1249

Query 1259  ATGGATTATTAAATGTAACAAAAATTGCTGAAAATGGGAAAAAGGTTCGAAAGAACTGGTTGTCTTCTTGGGCG  1332
            |||||.|.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1250  ATGGACTGTTAAATGTAACAAAAATTACTGAAAATGGGAAAAAAGTTCGAAAGAACTGGTTGTCTTCTTGGGCA  1323

Query 1333  GTGTTGCAGGGTTCATCTTTACTTTTTACCAAAACTCAAGGAAGTAGCACAAGTTGGTTTGGCAGTAATCAGTC  1406
            |||.||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1324  GTGCTGCAGGGTTCGTCTTTACTTTTTACGAAAACTCAAGGAAGTAGTACAAGCTGGTTTGGGAGTAATCAGTC  1397

Query 1407  CAAACCAGAGTTCACAGTGGACCTCAAGGGGGCAACAATTGAGATGGCTTCAAAGGATAAATCCAGCAAAAAGA  1480
            |||||||||.||||||||||||||.|||||||||...|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 1398  CAAACCAGAATTCACAGTGGACCTGAAGGGGGCAGTGATTGAAATGGCATCAAAGGACAAATCGAGCAAGAAGA  1471

Query 1481  ATGTATTTGAGCTGAAAACTCGTCAAGGAACAGAACTGCTAATTCAGTCTGACAATGACACTGTTATTAATGAT  1554
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||||||
Sbjct 1472  ATGTATTTGAGCTGAAAACTCGACAAGGAACAGAACTGCTAATTCAGTCTGATAATGATGCTGTTATTAATGAT  1545

Query 1555  TGGTTTAAAGTTCTTAGTAGTACAATCAATAATCAGGCAGTAGAAACTGATGAAGGAATTGAAGAGGAGATACC  1628
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.||||.||.|||..|.|||||||.|..|||||||||.|.|||
Sbjct 1546  TGGTTTAAAGTTCTTAGTAGTACTATCAATAACCAGGTAGCAGAGGCCGATGAAGCAGCTGAAGAGGAAACACC  1619

Query 1629  GGATTCACCAGGAATAGAAAAGCATGATAAAGAAAAGGAACAAAAGGATCCCAAAAAGCTTCGTTCCTTTAAAG  1702
            .|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|..|||||.|||||.||..|.||||
Sbjct 1620  AGATTCACCAGGGGTAGAAAAGCATGATAAAGAAAAGGACCAGAAGGAGCTTAAAAAACTTCGCTCAATGAAAG  1693

Query 1703  TATCTAGCATAGATTCTTCAGAACAGAAAAAAACCAAGAAAAACTTAAAGAAGTTTCTTACACGACGCCCCACT  1776
            .|||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1694  GATCCAGCATGGATTCTTCAGAGCAGAAGAAAACTAAGAAAAACTTAAAGAAGTTTCTTACCCGGCGCCCCACT  1767

Query 1777  TTGCAAGCTGTTCGTGAAAAAGGTTATATTAAAGATCAGGTATTTGGATCCAATCTCGCTAATCTGTGTCAGAG  1850
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1768  TTGCAAGCTGTTCGTGAGAAAGGTTATATCAAAGATCAAGTATTTGGATCTAATCTTGCTAATCTGTGTCAGAG  1841

Query 1851  AGAGAATGGCACAGTACCAAAGTTTGTGAAGTTATGTATTGAACATGTTGAAGAACATGGTTTGGATATTGATG  1924
            .||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||.||||||
Sbjct 1842  GGAGAATGGGACAGTGCCAAAGTTTGTGAAGTTATGCATTGAGCATGTCGAAGAGCATGGTTTAGATGTTGATG  1915

Query 1925  GGATATACAGAGTAAGTGGCAACCTCGCAGTGATCCAGAAACTAAGGTTTGCAGTCAATCATGATGAGAAATTG  1998
            |.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1916  GTATTTACAGAGTGAGTGGCAACCTTGCCGTGATCCAGAAGCTGAGGTTCGCAGTCAATCATGATGAGAAGTTG  1989

Query 1999  GACTTGAATGACAGTAAATGGGAAGATATTCATGTCATTACTGGAGCCCTCAAAATGTTTTTTCGAGAATTACC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1990  GACTTGAATGACAGTAAATGGGAAGACATTCATGTCATCACGGGAGCACTCAAAATGTTTTTTCGAGAACTACC  2063

Query 2073  AGAACCTCTTTTTACATTTAATCATTTTAATGATTTTGTTAATGCAATTAAGCAAGAACCAAGACAGCGAGTCG  2146
            |||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||.
Sbjct 2064  AGAACCTCTTTTTACGTTTAATCATTTCAATGATTTTGTTAATGCAATTAAACAAGAACCGAGACAGCGTGTCA  2137

Query 2147  CTGCTGTTAAGGACCTAATCAGACAGTTGCCAAAGCCAAACCAAGACACAATGCAGATTCTTTTCCGACATCTC  2220
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||..||||||||
Sbjct 2138  CTGCAGTTAAGGACCTAATCAGACAGTTGCCAAAGCCAAATCAAGATACAATGCAGATTCTGTTTAGACATCTC  2211

Query 2221  AGAAGAGTTATAGAAAATGGAGAGAAAAATCGAATGACCTATCAGAGTATAGCAATTGTTTTTGGTCCCACTCT  2294
            |.|||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 2212  AAAAGGGTTATAGAAAATGGAGAAAAAAACCGAATGACCTATCAGAGCATAGCGATTGTTTTTGGCCCCACCCT  2285

Query 2295  ATTAAAACCAGAAAAAGAGACTGGTAATATAGCAGTTCATACTGTGTACCAGAATCAGATTGTAGAATTAATTC  2368
            ..||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|.||||
Sbjct 2286  TCTAAAGCCAGAAAGAGAGACTGGTAATATAGCAGTTCATACTGTGTACCAGAACCAGATTGTAGAGCTGATTC  2359

Query 2369  TTCTGGAACTGAGTTCCATCTTCGGACGT  2397
            |.||||||.|.||..|..||||.||||||
Sbjct 2360  TCCTGGAATTAAGCACTGTCTTTGGACGT  2388