Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13005
- Subject:
- XM_017318001.1
- Aligned Length:
- 2397
- Identities:
- 1904
- Gaps:
- 270
Alignment
Query 1 ATGAAAATGGCTGACAGAAGTGGGAAGATTATTCCAGGACAAGTGTATATTGAGGTGGAATATGATTATGAATA 74
|||||.||.||||||||.|||||.|.|.|||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1 ------ATGGCCGAGAGAAGTGGAAAGATCACTGCAGGACAAGCGTATATTGAGGTGGAGTATGATTATGAGTA 68
Query 75 TGAAGCAAAGGACAGAAAGATTGTGATAAAACAAGGGGAGAGGTACATCTTGGTGAAAAAGACCAATGATGACT 148
|||.|||||||||||||||||||||||.|.||||||||||.|.|||.||.|||||||.||||||||||||||||
Sbjct 69 TGACGCAAAGGACAGAAAGATTGTGATCAGACAAGGGGAGCGCTACCTCCTGGTGAAGAAGACCAATGATGACT 142
Query 149 GGTGGCAAGTCAAGCCAGATGAAAACTCCAAAGCGTTTTATGTGCCAGCCCAGTATGTGAAGGAGGTCACGCGC 222
||||||||||||..||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 143 GGTGGCAAGTCAGACCTGATGAGAACTCAAAAGCATTTTATGTGCCAGCACAGTATGTCAAGGAGGTCACTCGC 216
Query 223 AAAGCTCTCATGCCACCTGTTAAGCAGGTAGCTGGTCTGCCAAATAACTCCACGAAAATAATGCAGAGTTTGCA 296
||||||||.|||||||||||.|||||||.|.|.||.||||||||||||||.|.|||.|.|||.||||||.||||
Sbjct 217 AAAGCTCTGATGCCACCTGTGAAGCAGGCAACAGGACTGCCAAATAACTCTATGAAGACAATACAGAGTATGCA 290
Query 297 TCTTCAGAGATCAACAGAAAATGTGAACAAATTGCCTGAGCTTTCAAGTTTCGGAAAGCCATCGTCATCTGTTC 370
|||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 291 TCTCCAGAGATCGACAGAAAATGTGAACAAAATGCCTGAGCTTTCAAGTTTTGGAAAGCCATCGTCATCTGTTC 364
Query 371 AAGGAACAGGTCTTATTCGTGATGCCAATCAGAATTTTGGACCCAGTTATAATCAAGGTCAGACTGTCAACCTA 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||.|||||||..|||.||||||.||||||||
Sbjct 365 AAGGAACAGGTCTTATTCGTGATGCCAATCAGAATTTCGGATCCAATTATAATTCAGGCCAGACTCTCAACCTA 438
Query 445 AGCCTGGACCTGACCCATAATAACGGAAAGTTTAACAATGACTCACATTCTCCTAAAGTTTCCAGCCAGAATAG 518
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439 AGCCTGGACCTGACCCATAATAATGGAAAGTTTAACAGTGACTCACATTCTCCTAAAGTTTCCAGCCAGAATAG 512
Query 519 GACACGCTCATTTGGTCATTTTCCCGGTCCAGAGTTCTTGGATGTAGAGAAAACTAGCTTCTCCCAGGAACAAT 592
||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 513 GACACGCTTATTTGGTCATTTTCCCGGGCCAGAGTTCTTGGACATAGAGAAAACTAGCTTCTCTCAGGAACAGT 586
Query 593 CTTGTGATTCCGCAGGAGAAGGCTCTGAAAGAATACATCAAGATTCTGAATCTGGTGATGAACTTAGCAGCAGC 666
|.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 587 CATGTGACTCAGCTGGAGAAGGCTCCGAAAGAATACAGCAGGATTCCGAGTCTGGAGATGAACTTAGCAGCAGC 660
Query 667 TCCACTGAACAGATAAGGGCAACCACACCTCCAAATCAAGGAAGGCCAGATTCTCCTGTCTATGCTAACCTTCA 740
||||||||.|||||.||
Sbjct 661 TCCACTGAGCAGATGAG--------------------------------------------------------- 677
Query 741 AGAACTGAAAATATCCCAGTCTGCTCTTCCCCCACTTCCTGGGAGCCCGGCAATTCAGATTAATGGAGAATGGG 814
Sbjct 678 -------------------------------------------------------------------------- 677
Query 815 AAACTCATAAAGACAGCTCAGGGCGTTGCTATTACTATAACAGAGGGACACAGGAAAGAACTTGGAAACCTCCT 888
Sbjct 678 -------------------------------------------------------------------------- 677
Query 889 CGTTGGACTCGGGATGCAAGCATCAGCAAAGGAGATTTCCAAAATCCAGGGGATCAAGAGTGGCTCAAGCATGT 962
|||||||||||||||
Sbjct 678 -----------------------------------------------------------GTGGCTCAAGCATGT 692
Query 963 TGATGATCAAGGTAGACAATATTACTACAGTGCAGACGGATCTCGGTCAGAATGGGAATTGCCAAAGTATAATG 1036
||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 693 TGATGATCAAGGTAGACAGTATTACTACAGCGCAGATGGATCTCGGTCAGAGTGGGAATTGCCAAAGTATAATG 766
Query 1037 CTTCATCCCAGCAGCAAAGAGAAATAATTAAAAGTAGGAGCCTGGACAGGCGGCTGCAAGAACCAATAGTATTA 1110
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 767 CTTCATCTCAGCAGCAAAGAGAAATAATTAAAAGTAGGAGCTTGGACAGGCGGCTGCAAGAACCAATAGTGTTA 840
Query 1111 ACAAAGTGGAGACATAGCACCATTGTATTGGACACTAATGATAAGGAATCTCCAACTGCCTCAAAACCCTGCTT 1184
||.||.||||||||||||||||||||.||||||.|.||.||.|||||.|||||||||.||.||||||.||||||
Sbjct 841 ACTAAATGGAGACATAGCACCATTGTGTTGGACTCCAACGACAAGGATTCTCCAACTACCACAAAACTCTGCTT 914
Query 1185 TCCTGAAAATGAGTCTTCTCCCTCCTCACCAAAGCACCAAGATACAGCCAGCAGTCCAAAGGATCAAGAGAAAT 1258
.|||||||||||.|||.||||..|.|||.|||||||.||||||.|||||.||||||..||||.|||.|||||||
Sbjct 915 ACCTGAAAATGAATCTCCTCCTACTTCATCAAAGCATCAAGATCCAGCCGGCAGTCTGAAGGGTCAGGAGAAAT 988
Query 1259 ATGGATTATTAAATGTAACAAAAATTGCTGAAAATGGGAAAAAGGTTCGAAAGAACTGGTTGTCTTCTTGGGCG 1332
|||||.|.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 989 ATGGACTGTTAAATGTAACAAAAATTACTGAAAATGGGAAAAAAGTTCGAAAGAACTGGTTGTCTTCTTGGGCA 1062
Query 1333 GTGTTGCAGGGTTCATCTTTACTTTTTACCAAAACTCAAGGAAGTAGCACAAGTTGGTTTGGCAGTAATCAGTC 1406
|||.||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1063 GTGCTGCAGGGTTCGTCTTTACTTTTTACGAAAACTCAAGGAAGTAGTACAAGCTGGTTTGGGAGTAATCAGTC 1136
Query 1407 CAAACCAGAGTTCACAGTGGACCTCAAGGGGGCAACAATTGAGATGGCTTCAAAGGATAAATCCAGCAAAAAGA 1480
|||||||||.||||||||||||||.|||||||||...|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 1137 CAAACCAGAATTCACAGTGGACCTGAAGGGGGCAGTGATTGAAATGGCATCAAAGGACAAATCGAGCAAGAAGA 1210
Query 1481 ATGTATTTGAGCTGAAAACTCGTCAAGGAACAGAACTGCTAATTCAGTCTGACAATGACACTGTTATTAATGAT 1554
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||||||
Sbjct 1211 ATGTATTTGAGCTGAAAACTCGACAAGGAACAGAACTGCTAATTCAGTCTGATAATGATGCTGTTATTAATGAT 1284
Query 1555 TGGTTTAAAGTTCTTAGTAGTACAATCAATAATCAGGCAGTAGAAACTGATGAAGGAATTGAAGAGGAGATACC 1628
|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||.||.|||..|.|||||||.|..|||||||||.|.|||
Sbjct 1285 TGGTTTAAAGTTCTTAGTAGTACTATCAATAACCAGGTAGCAGAGGCCGATGAAGCAGCTGAAGAGGAAACACC 1358
Query 1629 GGATTCACCAGGAATAGAAAAGCATGATAAAGAAAAGGAACAAAAGGATCCCAAAAAGCTTCGTTCCTTTAAAG 1702
.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|..|||||.|||||.||..|.||||
Sbjct 1359 AGATTCACCAGGGGTAGAAAAGCATGATAAAGAAAAGGACCAGAAGGAGCTTAAAAAACTTCGCTCAATGAAAG 1432
Query 1703 TATCTAGCATAGATTCTTCAGAACAGAAAAAAACCAAGAAAAACTTAAAGAAGTTTCTTACACGACGCCCCACT 1776
.|||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1433 GATCCAGCATGGATTCTTCAGAGCAGAAGAAAACTAAGAAAAACTTAAAGAAGTTTCTTACCCGGCGCCCCACT 1506
Query 1777 TTGCAAGCTGTTCGTGAAAAAGGTTATATTAAAGATCAGGTATTTGGATCCAATCTCGCTAATCTGTGTCAGAG 1850
|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1507 TTGCAAGCTGTTCGTGAGAAAGGTTATATCAAAGATCAAGTATTTGGATCTAATCTTGCTAATCTGTGTCAGAG 1580
Query 1851 AGAGAATGGCACAGTACCAAAGTTTGTGAAGTTATGTATTGAACATGTTGAAGAACATGGTTTGGATATTGATG 1924
.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||.||||||
Sbjct 1581 GGAGAATGGGACAGTGCCAAAGTTTGTGAAGTTATGCATTGAGCATGTCGAAGAGCATGGTTTAGATGTTGATG 1654
Query 1925 GGATATACAGAGTAAGTGGCAACCTCGCAGTGATCCAGAAACTAAGGTTTGCAGTCAATCATGATGAGAAATTG 1998
|.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1655 GTATTTACAGAGTGAGTGGCAACCTTGCCGTGATCCAGAAGCTGAGGTTCGCAGTCAATCATGATGAGAAGTTG 1728
Query 1999 GACTTGAATGACAGTAAATGGGAAGATATTCATGTCATTACTGGAGCCCTCAAAATGTTTTTTCGAGAATTACC 2072
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1729 GACTTGAATGACAGTAAATGGGAAGACATTCATGTCATCACGGGAGCACTCAAAATGTTTTTTCGAGAACTACC 1802
Query 2073 AGAACCTCTTTTTACATTTAATCATTTTAATGATTTTGTTAATGCAATTAAGCAAGAACCAAGACAGCGAGTCG 2146
|||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||.
Sbjct 1803 AGAACCTCTTTTTACGTTTAATCATTTCAATGATTTTGTTAATGCAATTAAACAAGAACCGAGACAGCGTGTCA 1876
Query 2147 CTGCTGTTAAGGACCTAATCAGACAGTTGCCAAAGCCAAACCAAGACACAATGCAGATTCTTTTCCGACATCTC 2220
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||..||||||||
Sbjct 1877 CTGCAGTTAAGGACCTAATCAGACAGTTGCCAAAGCCAAATCAAGATACAATGCAGATTCTGTTTAGACATCTC 1950
Query 2221 AGAAGAGTTATAGAAAATGGAGAGAAAAATCGAATGACCTATCAGAGTATAGCAATTGTTTTTGGTCCCACTCT 2294
|.|||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1951 AAAAGGGTTATAGAAAATGGAGAAAAAAACCGAATGACCTATCAGAGCATAGCGATTGTTTTTGGCCCCACCCT 2024
Query 2295 ATTAAAACCAGAAAAAGAGACTGGTAATATAGCAGTTCATACTGTGTACCAGAATCAGATTGTAGAATTAATTC 2368
..||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|.||||
Sbjct 2025 TCTAAAGCCAGAAAGAGAGACTGGTAATATAGCAGTTCATACTGTGTACCAGAACCAGATTGTAGAGCTGATTC 2098
Query 2369 TTCTGGAACTGAGTTCCATCTTCGGACGT 2397
|.||||||.|.||..|..||||.||||||
Sbjct 2099 TCCTGGAATTAAGCACTGTCTTTGGACGT 2127