Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13005
- Subject:
- XM_017318002.1
- Aligned Length:
- 2397
- Identities:
- 2111
- Gaps:
- 24
Alignment
Query 1 ATGAAAATGGCTGACAGAAGTGGGAAGATTATTCCAGGACAAGTGTATATTGAGGTGGAATATGATTATGAATA 74
|||||.||.||||||||.|||||.|.|.|||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1 ------ATGGCCGAGAGAAGTGGAAAGATCACTGCAGGACAAGCGTATATTGAGGTGGAGTATGATTATGAGTA 68
Query 75 TGAAGCAAAGGACAGAAAGATTGTGATAAAACAAGGGGAGAGGTACATCTTGGTGAAAAAGACCAATGATGACT 148
|||.|||||||||||||||||||||||.|.||||||||||.|.|||.||.|||||||.||||||||||||||||
Sbjct 69 TGACGCAAAGGACAGAAAGATTGTGATCAGACAAGGGGAGCGCTACCTCCTGGTGAAGAAGACCAATGATGACT 142
Query 149 GGTGGCAAGTCAAGCCAGATGAAAACTCCAAAGCGTTTTATGTGCCAGCCCAGTATGTGAAGGAGGTCACGCGC 222
||||||||||||..||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 143 GGTGGCAAGTCAGACCTGATGAGAACTCAAAAGCATTTTATGTGCCAGCACAGTATGTCAAGGAGGTCACTCGC 216
Query 223 AAAGCTCTCATGCCACCTGTTAAGCAGGTAGCTGGTCTGCCAAATAACTCCACGAAAATAATGCAGAGTTTGCA 296
||||||||.|||||||||||.|||||||.|.|.||.||||||||||||||.|.|||.|.|||.||||||.||||
Sbjct 217 AAAGCTCTGATGCCACCTGTGAAGCAGGCAACAGGACTGCCAAATAACTCTATGAAGACAATACAGAGTATGCA 290
Query 297 TCTTCAGAGATCAACAGAAAATGTGAACAAATTGCCTGAGCTTTCAAGTTTCGGAAAGCCATCGTCATCTGTTC 370
|||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 291 TCTCCAGAGATCGACAGAAAATGTGAACAAAATGCCTGAGCTTTCAAGTTTTGGAAAGCCATCGTCATCTGTTC 364
Query 371 AAGGAACAGGTCTTATTCGTGATGCCAATCAGAATTTTGGACCCAGTTATAATCAAGGTCAGACTGTCAACCTA 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||.|||||||..|||.||||||.||||||||
Sbjct 365 AAGGAACAGGTCTTATTCGTGATGCCAATCAGAATTTCGGATCCAATTATAATTCAGGCCAGACTCTCAACCTA 438
Query 445 AGCCTGGACCTGACCCATAATAACGGAAAGTTTAACAATGACTCACATTCTCCTAAAGTTTCCAGCCAGAATAG 518
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439 AGCCTGGACCTGACCCATAATAATGGAAAGTTTAACAGTGACTCACATTCTCCTAAAGTTTCCAGCCAGAATAG 512
Query 519 GACACGCTCATTTGGTCATTTTCCCGGTCCAGAGTTCTTGGATGTAGAGAAAACTAGCTTCTCCCAGGAACAAT 592
||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 513 GACACGCTTATTTGGTCATTTTCCCGGGCCAGAGTTCTTGGACATAGAGAAAACTAGCTTCTCTCAGGAACAGT 586
Query 593 CTTGTGATTCCGCAGGAGAAGGCTCTGAAAGAATACATCAAGATTCTGAATCTGGTGATGAACTTAGCAGCAGC 666
|.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 587 CATGTGACTCAGCTGGAGAAGGCTCCGAAAGAATACAGCAGGATTCCGAGTCTGGAGATGAACTTAGCAGCAGC 660
Query 667 TCCACTGAACAGATAAGGGCAACCACACCTCCAAATCAAGGAAGGCCAGATTCTCCTGTCTATGCTAACCTTCA 740
||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 661 TCCACTGAGCAGATGAGGGCAACCACACCCCCTAATCAAGGAAGGCCAGATTCTCCAGTCTATGCTAACCTACA 734
Query 741 AGAACTGAAAATATCCCAGTCTGCTCTTCCCCCACTTCCTGGGAGCCCGGCAATTCAGATTAATGGAGAATGGG 814
.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||..|||||||.|||||||
Sbjct 735 GGAACTGAAAATATCACAGTCTGCTCTTCCTCCTCTTCCTGGGAGCCCAGCAATTCAAGTTAATGGGGAATGGG 808
Query 815 AAACTCATAAAGACAGCTCAGGGCGTTGCTATTACTATAACAGAGGGACACAGGAAAGAACTTGGAAACCTCCT 888
|.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||.|....||.|||||..||||.||||||||.|||
Sbjct 809 AGACTCACAAAGACAGTTCAGGCCGTTGTTACTACTATAACCGCACAACCCAGGAGCGAACCTGGAAACCACCT 882
Query 889 CGTTGGACTCGGGATGCAAGCATCAGCAAAGGAGATTTCCAAAATCCAGGGGATCAAGAGTGGCTCAAGCATGT 962
||.|||.||||.||||..||||..||| .|||||||.||.|..|||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 883 CGATGGGCTCGAGATGTGAGCACAAGC---CGAGATTTTCAGAGCCCAGGAGAGCAAGAGTGGCTCAAGCATGT 953
Query 963 TGATGATCAAGGTAGACAATATTACTACAGTGCAGACGGATCTCGGTCAGAATGGGAATTGCCAAAGTATAATG 1036
||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 954 TGATGATCAAGGTAGACAGTATTACTACAGCGCAGATGGATCTCGGTCAGAGTGGGAATTGCCAAAGTATAATG 1027
Query 1037 CTTCATCCCAGCAGCAAAGAGAAATAATTAAAAGTAGGAGCCTGGACAGGCGGCTGCAAGAACCAATAGTATTA 1110
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1028 CTTCATCTCAGCAGCAAAGAGAAATAATTAAAAGTAGGAGCTTGGACAGGCGGCTGCAAGAACCAATAGTGTTA 1101
Query 1111 ACAAAGTGGAGACATAGCACCATTGTATTGGACACTAATGATAAGGAATCTCCAACTGCCTCAAAACCCTGCTT 1184
||.||.||||||||||||||||||||.||||||.|.||.||.|||||.|||||||||.||.||||||.||||||
Sbjct 1102 ACTAAATGGAGACATAGCACCATTGTGTTGGACTCCAACGACAAGGATTCTCCAACTACCACAAAACTCTGCTT 1175
Query 1185 TCCTGAAAATGAGTCTTCTCCCTCCTCACCAAAGCACCAAGATACAGCCAGCAGTCCAAAGGATCAAGAGAAAT 1258
.|||||||||||.|||.||||..|.|||.|||||||.||||||.|| |.|||.|||||||
Sbjct 1176 ACCTGAAAATGAATCTCCTCCTACTTCATCAAAGCATCAAGATCCA---------------GGTCAGGAGAAAT 1234
Query 1259 ATGGATTATTAAATGTAACAAAAATTGCTGAAAATGGGAAAAAGGTTCGAAAGAACTGGTTGTCTTCTTGGGCG 1332
|||||.|.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1235 ATGGACTGTTAAATGTAACAAAAATTACTGAAAATGGGAAAAAAGTTCGAAAGAACTGGTTGTCTTCTTGGGCA 1308
Query 1333 GTGTTGCAGGGTTCATCTTTACTTTTTACCAAAACTCAAGGAAGTAGCACAAGTTGGTTTGGCAGTAATCAGTC 1406
|||.||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1309 GTGCTGCAGGGTTCGTCTTTACTTTTTACGAAAACTCAAGGAAGTAGTACAAGCTGGTTTGGGAGTAATCAGTC 1382
Query 1407 CAAACCAGAGTTCACAGTGGACCTCAAGGGGGCAACAATTGAGATGGCTTCAAAGGATAAATCCAGCAAAAAGA 1480
|||||||||.||||||||||||||.|||||||||...|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 1383 CAAACCAGAATTCACAGTGGACCTGAAGGGGGCAGTGATTGAAATGGCATCAAAGGACAAATCGAGCAAGAAGA 1456
Query 1481 ATGTATTTGAGCTGAAAACTCGTCAAGGAACAGAACTGCTAATTCAGTCTGACAATGACACTGTTATTAATGAT 1554
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||||||
Sbjct 1457 ATGTATTTGAGCTGAAAACTCGACAAGGAACAGAACTGCTAATTCAGTCTGATAATGATGCTGTTATTAATGAT 1530
Query 1555 TGGTTTAAAGTTCTTAGTAGTACAATCAATAATCAGGCAGTAGAAACTGATGAAGGAATTGAAGAGGAGATACC 1628
|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||.||.|||..|.|||||||.|..|||||||||.|.|||
Sbjct 1531 TGGTTTAAAGTTCTTAGTAGTACTATCAATAACCAGGTAGCAGAGGCCGATGAAGCAGCTGAAGAGGAAACACC 1604
Query 1629 GGATTCACCAGGAATAGAAAAGCATGATAAAGAAAAGGAACAAAAGGATCCCAAAAAGCTTCGTTCCTTTAAAG 1702
.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|..|||||.|||||.||..|.||||
Sbjct 1605 AGATTCACCAGGGGTAGAAAAGCATGATAAAGAAAAGGACCAGAAGGAGCTTAAAAAACTTCGCTCAATGAAAG 1678
Query 1703 TATCTAGCATAGATTCTTCAGAACAGAAAAAAACCAAGAAAAACTTAAAGAAGTTTCTTACACGACGCCCCACT 1776
.|||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1679 GATCCAGCATGGATTCTTCAGAGCAGAAGAAAACTAAGAAAAACTTAAAGAAGTTTCTTACCCGGCGCCCCACT 1752
Query 1777 TTGCAAGCTGTTCGTGAAAAAGGTTATATTAAAGATCAGGTATTTGGATCCAATCTCGCTAATCTGTGTCAGAG 1850
|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1753 TTGCAAGCTGTTCGTGAGAAAGGTTATATCAAAGATCAAGTATTTGGATCTAATCTTGCTAATCTGTGTCAGAG 1826
Query 1851 AGAGAATGGCACAGTACCAAAGTTTGTGAAGTTATGTATTGAACATGTTGAAGAACATGGTTTGGATATTGATG 1924
.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||.||||||
Sbjct 1827 GGAGAATGGGACAGTGCCAAAGTTTGTGAAGTTATGCATTGAGCATGTCGAAGAGCATGGTTTAGATGTTGATG 1900
Query 1925 GGATATACAGAGTAAGTGGCAACCTCGCAGTGATCCAGAAACTAAGGTTTGCAGTCAATCATGATGAGAAATTG 1998
|.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1901 GTATTTACAGAGTGAGTGGCAACCTTGCCGTGATCCAGAAGCTGAGGTTCGCAGTCAATCATGATGAGAAGTTG 1974
Query 1999 GACTTGAATGACAGTAAATGGGAAGATATTCATGTCATTACTGGAGCCCTCAAAATGTTTTTTCGAGAATTACC 2072
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1975 GACTTGAATGACAGTAAATGGGAAGACATTCATGTCATCACGGGAGCACTCAAAATGTTTTTTCGAGAACTACC 2048
Query 2073 AGAACCTCTTTTTACATTTAATCATTTTAATGATTTTGTTAATGCAATTAAGCAAGAACCAAGACAGCGAGTCG 2146
|||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||.
Sbjct 2049 AGAACCTCTTTTTACGTTTAATCATTTCAATGATTTTGTTAATGCAATTAAACAAGAACCGAGACAGCGTGTCA 2122
Query 2147 CTGCTGTTAAGGACCTAATCAGACAGTTGCCAAAGCCAAACCAAGACACAATGCAGATTCTTTTCCGACATCTC 2220
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||..||||||||
Sbjct 2123 CTGCAGTTAAGGACCTAATCAGACAGTTGCCAAAGCCAAATCAAGATACAATGCAGATTCTGTTTAGACATCTC 2196
Query 2221 AGAAGAGTTATAGAAAATGGAGAGAAAAATCGAATGACCTATCAGAGTATAGCAATTGTTTTTGGTCCCACTCT 2294
|.|||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 2197 AAAAGGGTTATAGAAAATGGAGAAAAAAACCGAATGACCTATCAGAGCATAGCGATTGTTTTTGGCCCCACCCT 2270
Query 2295 ATTAAAACCAGAAAAAGAGACTGGTAATATAGCAGTTCATACTGTGTACCAGAATCAGATTGTAGAATTAATTC 2368
..||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|.||||
Sbjct 2271 TCTAAAGCCAGAAAGAGAGACTGGTAATATAGCAGTTCATACTGTGTACCAGAACCAGATTGTAGAGCTGATTC 2344
Query 2369 TTCTGGAACTGAGTTCCATCTTCGGACGT 2397
|.||||||.|.||..|..||||.||||||
Sbjct 2345 TCCTGGAATTAAGCACTGTCTTTGGACGT 2373