Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_13006
Subject:
NM_001270696.2
Aligned Length:
841
Identities:
816
Gaps:
25

Alignment

Query   1  MKMADRSGKIIPGQVYIEVEYDYEYEAKDRKIVIKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDENSKAFYVPAQYVKEVTR  74
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Sbjct   1  MKMADRSGKIIPGQVYIEVEYDYEYEAKDRKIVIKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDENSKAFYVPAQYVKEVTR  74

Query  75  KALMPPVKQVAGLPNNSTKIMQSLHLQRSTENVNKLPELSSFGKPSSSVQGTGLIRDANQNFGPSYNQGQTVNL  148
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Sbjct  75  KALMPPVKQVAGLPNNSTKIMQSLHLQRSTENVNKLPELSSFGKPSSSVQGTGLIRDANQNFGPSYNQGQTVNL  148

Query 149  SLDLTHNNGKFNNDSHSPKVSSQNRTRSFGHFPGPEFLDVEKTSFSQEQSCDSAGEGSERIHQDSESGDELSSS  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  SLDLTHNNGKFNNDSHSPKVSSQNRTRSFGHFPGPEFLDVEKTSFSQEQSCDSAGEGSERIHQDSESGDELSSS  222

Query 223  STEQIRATTPPNQGRPDSPVYANLQELKISQSALPPLPGSPAIQINGEWETHKDSSGRCYYYNRGTQERTWKPP  296
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Sbjct 223  STEQIRATTPPNQGRPDSPVYANLQELKISQSALPPLPGSPAIQINGEWETHKDSSGRCYYYNRGTQERTWKPP  296

Query 297  RWTRDASISKGDFQNPGDQELLSSEENYYSTSYSQSDSQCGSPPRGWSEELDERGHTLYTSDYTNEKWLKHVDD  370
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Sbjct 297  RWTRDASISKGDFQNPGDQELLSSEENYYSTSYSQSDSQCGSPPRGWSEELDERGHTLYTSDYTNEKWLKHVDD  370

Query 371  QGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKWRHSTIVLDTNDKESPTASKPCFPE  444
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Sbjct 371  QGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKWRHSTIVLDTNDK------------  432

Query 445  NESSPSSPKHQDTDQEKYGLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVD  518
                        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 433  -------------DQEKYGLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKPEFTVD  493

Query 519  LKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVETDEGIEEEIPDSPGIEK  592
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Sbjct 494  LKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVETDEGIEEEIPDSPGIEK  567

Query 593  HDKEKEQKDPKKLRSFKVSSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQRENGTVPK  666
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Sbjct 568  HDKEKEQKDPKKLRSFKVSSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQRENGTVPK  641

Query 667  FVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPEPLFTFN  740
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Sbjct 642  FVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPEPLFTFN  715

Query 741  HFNDFVNAIKQEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKET  814
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Sbjct 716  HFNDFVNAIKQEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLKPEKET  789

Query 815  GNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR  841
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Sbjct 790  GNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR  816