Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13007
• Subject: NM_018718.3
• Aligned Length: 1119
• Identities: 903
• Gaps: 216

Alignment

Query    1  ATGTCCCTCCGGAGGCACATTGGGAACCCTGAGTATCTGATGAAAAGGATACCACAGAACCCAAGATACCAGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCCCTCCGGAGGCACATTGGGAACCCTGAGTATCTGATGAAAAGGATACCACAGAACCCAAGATACCAGCA  74

Query   75  TATCAAATCAAGACTGGACACTGGTAACAGTATGACTAAATATACTGAGAAGCTCGAAGAGATTAAGAAAAATT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TATCAAATCAAGACTGGACACTGGTAACAGTATGACTAAATATACTGAGAAGCTCGAAGAGATTAAGAAAAATT  148

Query  149  ATAGATACAAAAAAGATGAGCTTTTCAAGAGACTAAAAGTTACAACTTTTGCCCAGCTGATCATCCAAGTTGCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATAGATACAAAAAAGATGAGCTTTTCAAGAGACTAAAAGTTACAACTTTTGCCCAGCTGATCATCCAAGTTGCT  222

Query  223  TCCCTCTCTGATCAAACACTGGAAGTGACAGCTGAGGAGATTCAAAGGCTGGAAGACAATGATTCTGCAGCTTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCCTCTCTGATCAAACACTGGAAGTGACAGCTGAGGAGATTCAAAGGCTGGAAGACAATGATTCTGCAGCTTC  296

Query  297  AGACCCTGATGCTGAAACCACTGCCAGGACCAATGGGAAAGGAAATCCAGGTGAGCAGTCGCCGAGCCCTGAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGACCCTGATGCTGAAACCACTGCCAGGACCAATGGGAAAGGAAATCCAGGTGAGCAGTCGCCGAGCCCTGAGC  370

Query  371  AGTTCATAAACAACGCAGGAGCAGGGGACTCCAGCCGCTCAACTCTTCAGAGTGTCATCAGTGGTGTTGGGGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGTTCATAAACAACGCAGGAGCAGGGGACTCCAGCCGCTCAACTCTTCAGAGTGTCATCAGTGGTGTTGGGGAA  444

Query  445  CTGGATCTAGACAAAGGGCCAGTGAAGAAAGCAGAGCCCCATACCAAAGACAAACCTTATCCTGACTGCCCCTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGATCTAGACAAAGGGCCAGTGAAGAAAGCAGAGCCCCATACCAAAGACAAACCTTATCCTGACTGCCCCTT  518

Query  519  CCTGCTGCTAGATGTGCGTGATAGAGATTCTTACCAGCAGTGCCACATTGTTGGAGCTTACAGTTACCCAATTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTGCTGCTAGATGTGCGTGATAGAGATTCTTACCAGCAGTGCCACATTGTTGGAGCTTACAGTTACCCAATTG  592

Query  593  CAACTCTGTCTAGAACAATGAACCCTTATTCAAATGATATTCTTGAATATAAAAATGCCCATGGCAAGATCATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAACTCTGTCTAGAACAATGAACCCTTATTCAAATGATATTCTTGAATATAAAAATGCCCATGGCAAGATCATC  666

Query  667  ATTCTGTATGACGATGATGAAAGGCTGGCCAGTCAGGCGGCCACCACCATGTGCGAGCGTGGATTTGAAAACCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTCTGTATGACGATGATGAAAGGCTGGCCAGTCAGGCGGCCACCACCATGTGCGAGCGTGGATTTGAAAACCT  740

Query  741  CTTCATGCTTTCCGGAG---------------------------------------------------------  757
            |||||||||||||||||                                                         
Sbjct  741  CTTCATGCTTTCCGGAGGTCTAAAAGTCTTAGCTCAGAAATTCCCGGAAGGACTGATTACTGGTTCCCTGCCAG  814

Query  758  --------------------------------------------------------------------------  757
                                                                                      
Sbjct  815  CATCTTGCCAGCAGGCCCTTCCTCCTGGGTCTGCCCGGAAACGATCCAGCCCCAAAGGGCCACCCCTACCAGCT  888

Query  758  --------------------------------------------------------------------------  757
                                                                                      
Sbjct  889  GAGAATAAATGGAGATTTACCCCAGAAGACTTAAAAAAGATAGAATATTATCTGGAAGAGGAGCAAGGGCCTGC  962

Query  758  -----------GCCGACTGAACCAAGCTAACTCCTCCGGAAGAGAGTCCAAGGTGCCTGGTGCCCGAAGCGCTC  820
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGATCATCCTAGCCGACTGAACCAAGCTAACTCCTCCGGAAGAGAGTCCAAGGTGCCTGGTGCCCGAAGCGCTC  1036

Query  821  AGAATCTGCCAGGTGGCGGCCCCGCCAGCCACTCAAACCCCCGCTCCCTCAGCAGTGGTCACCTGCAAGGCAAA  894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAATCTGCCAGGTGGCGGCCCCGCCAGCCACTCAAACCCCCGCTCCCTCAGCAGTGGTCACCTGCAAGGCAAA  1110

Query  895  CCCTGGAAG  903
            |||||||||
Sbjct 1111  CCCTGGAAG  1119