Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13007
- Subject:
- XM_011516709.3
- Aligned Length:
- 1119
- Identities:
- 798
- Gaps:
- 321
Alignment
Query 1 ATGTCCCTCCGGAGGCACATTGGGAACCCTGAGTATCTGATGAAAAGGATACCACAGAACCCAAGATACCAGCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TATCAAATCAAGACTGGACACTGGTAACAGTATGACTAAATATACTGAGAAGCTCGAAGAGATTAAGAAAAATT 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------------------------------ATGACTAAATATACTGAGAAGCTCGAAGAGATTAAGAAAAATT 43
Query 149 ATAGATACAAAAAAGATGAGCTTTTCAAGAGACTAAAAGTTACAACTTTTGCCCAGCTGATCATCCAAGTTGCT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 44 ATAGATACAAAAAAGATGAGCTTTTCAAGAGACTAAAAGTTACAACTTTTGCCCAGCTGATCATCCAAGTTGCT 117
Query 223 TCCCTCTCTGATCAAACACTGGAAGTGACAGCTGAGGAGATTCAAAGGCTGGAAGACAATGATTCTGCAGCTTC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 118 TCCCTCTCTGATCAAACACTGGAAGTGACAGCTGAGGAGATTCAAAGGCTGGAAGACAATGATTCTGCAGCTTC 191
Query 297 AGACCCTGATGCTGAAACCACTGCCAGGACCAATGGGAAAGGAAATCCAGGTGAGCAGTCGCCGAGCCCTGAGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 192 AGACCCTGATGCTGAAACCACTGCCAGGACCAATGGGAAAGGAAATCCAGGTGAGCAGTCGCCGAGCCCTGAGC 265
Query 371 AGTTCATAAACAACGCAGGAGCAGGGGACTCCAGCCGCTCAACTCTTCAGAGTGTCATCAGTGGTGTTGGGGAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 266 AGTTCATAAACAACGCAGGAGCAGGGGACTCCAGCCGCTCAACTCTTCAGAGTGTCATCAGTGGTGTTGGGGAA 339
Query 445 CTGGATCTAGACAAAGGGCCAGTGAAGAAAGCAGAGCCCCATACCAAAGACAAACCTTATCCTGACTGCCCCTT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 340 CTGGATCTAGACAAAGGGCCAGTGAAGAAAGCAGAGCCCCATACCAAAGACAAACCTTATCCTGACTGCCCCTT 413
Query 519 CCTGCTGCTAGATGTGCGTGATAGAGATTCTTACCAGCAGTGCCACATTGTTGGAGCTTACAGTTACCCAATTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 414 CCTGCTGCTAGATGTGCGTGATAGAGATTCTTACCAGCAGTGCCACATTGTTGGAGCTTACAGTTACCCAATTG 487
Query 593 CAACTCTGTCTAGAACAATGAACCCTTATTCAAATGATATTCTTGAATATAAAAATGCCCATGGCAAGATCATC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 488 CAACTCTGTCTAGAACAATGAACCCTTATTCAAATGATATTCTTGAATATAAAAATGCCCATGGCAAGATCATC 561
Query 667 ATTCTGTATGACGATGATGAAAGGCTGGCCAGTCAGGCGGCCACCACCATGTGCGAGCGTGGATTTGAAAACCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 562 ATTCTGTATGACGATGATGAAAGGCTGGCCAGTCAGGCGGCCACCACCATGTGCGAGCGTGGATTTGAAAACCT 635
Query 741 CTTCATGCTTTCCGGAG--------------------------------------------------------- 757
|||||||||||||||||
Sbjct 636 CTTCATGCTTTCCGGAGGTCTAAAAGTCTTAGCTCAGAAATTCCCGGAAGGACTGATTACTGGTTCCCTGCCAG 709
Query 758 -------------------------------------------------------------------------- 757
Sbjct 710 CATCTTGCCAGCAGGCCCTTCCTCCTGGGTCTGCCCGGAAACGATCCAGCCCCAAAGGGCCACCCCTACCAGCT 783
Query 758 -------------------------------------------------------------------------- 757
Sbjct 784 GAGAATAAATGGAGATTTACCCCAGAAGACTTAAAAAAGATAGAATATTATCTGGAAGAGGAGCAAGGGCCTGC 857
Query 758 -----------GCCGACTGAACCAAGCTAACTCCTCCGGAAGAGAGTCCAAGGTGCCTGGTGCCCGAAGCGCTC 820
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 858 AGATCATCCTAGCCGACTGAACCAAGCTAACTCCTCCGGAAGAGAGTCCAAGGTGCCTGGTGCCCGAAGCGCTC 931
Query 821 AGAATCTGCCAGGTGGCGGCCCCGCCAGCCACTCAAACCCCCGCTCCCTCAGCAGTGGTCACCTGCAAGGCAAA 894
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 932 AGAATCTGCCAGGTGGCGGCCCCGCCAGCCACTCAAACCCCCGCTCCCTCAGCAGTGGTCACCTGCAAGGCAAA 1005
Query 895 CCCTGGAAG 903
|||||||||
Sbjct 1006 CCCTGGAAG 1014