Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13061
- Subject:
- XM_011247711.2
- Aligned Length:
- 2010
- Identities:
- 1240
- Gaps:
- 633
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCTGTCTCTGCACCTCCGGTGATCTCTGCAACTTCCAGCAGCGCCGGCGTCCCGGGGGGTTTATTCCGGGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TGAACCCCTGTATTCGTCTCCAGGAGAGCCCCCTCGCCTAACCCCTAACATGATCAACAGTTTCATGGCCAATA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 ACCATAACGGCAGTGTCTTGGGTGGCGGGATTGGTGGTGGCAGCGGTGGCAGCAGCAACACCAACACAAACGAG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TGCCGGATGGTCGACATGCACGGGGTGAAGGTAGCTTCATTCCTGATGGATGGCCAGGAACTGATCTGCCTGCC 296
Query 1 ----------------------------------------------------------ATGC--CAGAGTTTCG 14
|.|| .||||..|||
Sbjct 297 GCAAGTCTTTGACCTTTTCCTCAAGCACCTGGTGGGAGGGTTGCACACAGTGTACACTAAGCTGAAGAGACTCG 370
Query 15 ------CTC---TGTTGCCCAGGCTGCAGTGCA--------------GTGGTGTG------ATC---------T 50
||| ||.||..|| |||.||.||| ||||..|| ||| .
Sbjct 371 ACATATCTCCGGTGGTGTGCA--CTGTAGAGCAAGTTCGAATCCTCCGTGGGCTGGGGGCCATCCAGCCAGGGG 442
Query 51 TGGCTCGCTGCAA-CTTCCGCCTC-CCAGG-------TTCAAGGGATTCTTGTGCCTCAGCCTCCCGAGT---- 111
||..|||.||||| || |.|| ||||| ||.|| |.| |||| ||| ||||.|
Sbjct 443 TGAATCGTTGCAAGCT----CATCACCAGGAAAGACTTTGAA---ACT-TTGT---TCA-----CCGATTGCAC 500
Query 112 -------AGCTGGAA---------------------------TTACAGTTCAAGACCCGGCAGGCCCCCTAAGC 151
||..|||| |.||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 501 CAACGCCAGAAGGAAGAGGCAAATGACAAGGAAACAAGCTGTTAACAGTTCAAGGCCTGGCAGGCCCCCTAAGC 574
Query 152 GTTCTTTGGGAGTGTTGCAGGAAAATGCCCGCCTTCTGACCCATGCAGTCCCAGGCCTCTTATCGCCAGGACTT 225
|||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 575 GTTCTTTGGGAGTATTGCAAGATAATGCCCGACTTCTGCCCCATGCAGTCCCAGGCCTCTTATCACCAGGACTG 648
Query 226 ATCACTCCGACAGGTATAACAGCTGCAGCGATGGCTGAGGCGATGAAACTTCAGAAGATGAAGCTTATGGCTAT 299
||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 649 ATCACTCCAACAGGTATCACAGCTGCAGCGATGGCTGAGGCCATGAAGCTCCAGAAGATGAAGCTTATGGCAAT 722
Query 300 GAACACTCTTCAGGGAAATGGAAGCCAAAATGGGACCGAATCAGAGCCTGATGATCTTAATTCTAACACAGGTG 373
|||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||..|||||||
Sbjct 723 GAATACTCTTCAGGGTAATGGAAGCCAAAATGGGACTGAGTCAGAGCCAGATGACCTTAATTCTACGACAGGTG 796
Query 374 GAAGTGAATCCTCCTGGGATAAAGATAAGATGCAGTCTCCATTTGCTGCACCTGGACCCCAACATGGAATTGCT 447
|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|||||||..|||||||.|||||||||||||||
Sbjct 797 GAAGTGAATCCTCCTGGGATAAAGATAAGATACAATCTCCACTTGCTGCTTCTGGACCTCAACATGGAATTGCT 870
Query 448 CATGCAGCCCTAGCTGGCCAGCCAGGCATTGGGGGTGCTCCAACCCTCAATCCACTGCAGCAGAACCACCTGCT 521
||||||||.||.|||||.|||||||||.||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 871 CATGCAGCACTTGCTGGTCAGCCAGGCCTTGGAGGTGCTCCGACCCTTAATCCACTTCAGCAGAATCACCTGCT 944
Query 522 AACCAATAGACTGGATCTGCCATTTATGATGATGCCTCATCCCCTACTTCCAGTCAGCTTACCTCCTGCATCAG 595
||.||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 945 AAGCAATCGTCTGGATCTCCCATTTATGATGATGCCTCATCCCCTACTTCCAGTCAGCTTACCTCCTGCATCAG 1018
Query 596 TTGCCATGGCAATGAATCAGATGAACCATCTCAATACTATTGCCAACATGGCTGCTGCAGCACAGATTCACAGT 669
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1019 TTGCCATGGCAATGAATCAGATGAATCATCTCAATACTATTGCCAACATGGCTGCTGCAGCCCAGATTCACAGT 1092
Query 670 CCACTCTCCAGAGCTGGTACCTCTGTTATAAAGGAGCGGATCCCAGAGAGTCCTTCTCCTGCTCCTTCTCTAGA 743
||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1093 CCACTCTCCAGAGCTGGTGCCTCTGTTATAAAGGAACGGATCCCAGAGAGTCCTTCTCCTGCTCCCTCTCTGGA 1166
Query 744 AGAGAATCATCGTCCTGGGAGCCAGACCTCTTCCCACACCAGCAGCAGTGTGTCCAGCTCTCCCTCTCAGATGG 817
|||||.||||||||||||||||||||||||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1167 AGAGAGTCATCGTCCTGGGAGCCAGACCTCCTCCCACCCAAGCAGCAGTGTGTCCAGCTCTCCCTCGCAGATGG 1240
Query 818 ATCATCATTTGGAAAGAATGG----------------------------------------------------- 838
|||||||||..||.|||||||
Sbjct 1241 ATCATCATTCAGAGAGAATGGTTATGATGCCCAACAATCGAGAAGAGCTTATTGTTGACCAAGATAATGGACAA 1314
Query 839 -------------------------------------------------------------------------- 838
Sbjct 1315 AGCATAAAAAAATTCCAGAGGGATAATAAAGATATCCAATTGTCCCAGCACCATTTGTTGAACACTTTTCTTCA 1388
Query 839 -----------------------------------------------AAGAGGTACCAGTTCAAATTCCAATAA 865
||||.|||||||.||||||.|||.|.|
Sbjct 1389 CTGGATTGAGTTGGCACCATTATCAAAAAAATCACTTCACCATCAAAAAGAAGTACCAGCTCAAATCCCAGTCA 1462
Query 866 TGAAGTCACCCTTGGACAAGATACAGCTGACTCCTGGGCAGGCATTGCCCGCTGGATTCCCTGGACCATTCATT 939
||||||||||||||||.|||||.|||.||.|||||||.||||||||||...|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1463 TGAAGTCACCCTTGGATAAGATCCAGTTGGCTCCTGGACAGGCATTGCATCCTGGATTCCCTGGACCATTCATT 1536
Query 940 TTTGCTGATAGTCTGTCCTCCGTGGAGACTCTGTTGACCAACATTCAGGGTCTGCTGAAAGTTGCTTTGGATAA 1013
|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1537 TTTGCAGATAGTCTATCTTCTGTGGAGACTCTGTTGACCAACATTCAGGGTCTACTGAAAGTGGCTTTGGATAA 1610
Query 1014 TGCTCGCATCCAGGAGAAGCAGATTCAACAAGAAAAGAAGGAGCTGCGACTGGAGCTCTATAGAGAGAGAGAAA 1087
||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.|.|||||||..|||||.|||||||
Sbjct 1611 TGCTCGTATCCAGGAGAAGCAGATTCAGCAGGAAAAGAAGGAACTGCGAATAGAGCTCTTCAGAGAAAGAGAAA 1684
Query 1088 TTAGAGAAAACCTTGAAAGACAACTTGCAGTTGAGCTTCAAAGCAGAACTACTATGCAAAAGCGCCTGAAGAAG 1161
|||||||||||||.||..||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1685 TTAGAGAAAACCTGGAGCGACAACTTGCAGTTGAGCTTCAAAGCAGAAGTACAATGCAAAAGCGTCTGAAAAAA 1758
Query 1162 GAGAAAAAAACCAAGAGAAAATTGCAGGAAGCCTTGGAATTTGAATCAAAGCGCCGGGAGCAAGTGGAGCAGGC 1235
||||||||..|.|||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1759 GAGAAAAAGGCTAAGAGAAAACTTCAGGAAGCCTTGGAATTTGAATCAAAGCGCCGCGAGCAAGTGGAGCAAGC 1832
Query 1236 ACTTAAGCAAGCCACCACTAGTGACAGTGGCCTGAGGATGTTAAAAGATACTGGAATTCCAGATATTGAAATAG 1309
||||||.|||||.||..||.||||||||||.|||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1833 ACTTAAACAAGCTACATCTGGTGACAGTGGACTGAGAATGTTAAAAGATTCTGGAATTCCAGATATTGAAATAG 1906
Query 1310 AAAACAATGGGACTCCTCATGATAGTGCTGCTATGCAAGGAGGTAACTATTACTGTTTAGAAATGGCACAACAG 1383
||||||.|||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||
Sbjct 1907 AAAACAGTGGAACGCCGCATGACAGTGCTGCTATGCAAGGAGGTAACTATTACTGTTTAGCAATGGCACAGCAG 1980
Query 1384 TTGTATTCAGCC 1395
||||.|||||||
Sbjct 1981 TTGTGTTCAGCC 1992
