Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13162
• Subject: XM_011246022.1
• Aligned Length: 2276
• Identities: 1729
• Gaps: 244

Alignment

Query    1  AT------------GCCTCTG------------TTCCTCCTGCTCTTACTTGTCCTG------CTGCTGCTGCT  44
            ||            |||.|||            ..||.||.|        .||||.|      |.||.|| ||.
Sbjct    1  ATGGCGAGCCGGGCGCCGCTGAGAGCCGCGCGCAGCCCCCAG--------GGTCCCGGAGGCCCGGCCGC-GCC  65

Query   45  CG------------AGGACGCTGGAGCCCAGCAAGGTGATGGATG-TGGACACACTGTACTAGGCCCTGAGAGT  105
            ||            .||.||| |..|||||||     |..||.|| ||..|.|.|..|.|| ||||        
Sbjct   66  CGCCGCCACCGGCCGGGCCGC-GCTGCCCAGC-----GCCGGCTGCTGTCCCCTCCCTCCT-GGCC--------  124

Query  106  GGAAC-CCTTACATCCATAAACTACCCACAGACCTATCCCAACAGCACTGTTTGTGAATGGGAGATCCGTGTAA  178
            |.||| |||               ||..|||.|||    |.||.||                   |||      
Sbjct  125  GCAACTCCT---------------CCTCCAGGCCT----CGACTGC-------------------TCC------  154

Query  179  AGATGGGAGAGAGAGTTCGCATCAAATTTGGTGACTTTGACATTGAAGATTCTGATTCTTGTCACTTTAATTAC  252
                                                             |||||.|.||..|       |.|.|
Sbjct  155  -------------------------------------------------TTCTGCTGCTCCT-------ACTGC  172

Query  253  TTGAGAATTTATAATGGA-ATTGGA-GTCAGCAGAACTGAAATAGGCAAATACTGTGGTCTGGGGTTGCAAATG  324
            |..|           ||| ..|||| |.|||||          |||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  173  TCCA-----------GGACGCTGGAGGCCAGCA----------AGGCAAATACTGTGGTCTGGGTTTACAAATG  225

Query  325  AACCATTCAATTGAATCAAAAGGCAATGAAATCACATTGCTGTTCATGAGTGGAATCCATGTTTCTGGACGCGG  398
            ||.||.||||||||.||.|||||||.||||.|||||.||||||||||||||||||.|||||.|.||||.||.||
Sbjct  226  AATCAGTCAATTGAGTCCAAAGGCAGTGAAGTCACAGTGCTGTTCATGAGTGGAACCCATGCTGCTGGGCGAGG  299

Query  399  ATTTTTGGCCTCATACTCTGTTATAGATAAACAAGATCTAATTACTTGTTTGGACACTGCATCCAATTTTTTGG  472
            |||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||.||||.|||||||||||.||||.|||.||||||||||
Sbjct  300  ATTTTTGGCTTCATACTCAGTTATAGATAAAGAAGATTTAATCACTTGTTTGGATACTGTATCTAATTTTTTGG  373

Query  473  AACCTGAGTTCAGTAAGTACTGCCCAGCTGGTTGTCTGCTTCCTTTTGCTGAGATATCTGGAACAATTCCTCAT  546
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  374  AACCAGAGTTCAGTAAGTACTGCCCAGCTGGCTGTCTTTTGCCTTTTGCTGAAATATCTGGAACAATTCCTCAT  447

Query  547  GGATATAGAGATTCCTCGCCATTGTGCATGGCTGGTGTGCATGCAGGAGTAGTGTCAAACACGTTGGGCGGCCA  620
            |||||.||||||||.||.||||||||.||||||||..|.|||||||||||||||||||||..|.||||.|||||
Sbjct  448  GGATACAGAGATTCTTCACCATTGTGTATGGCTGGAATCCATGCAGGAGTAGTGTCAAACGTGCTGGGTGGCCA  521

Query  621  AATCAGTGTTGTAATTAGTAAAGGTATCCCCTATTATGAAAGTTCTTTGGCTAACAACGTCACATCTGTGGTGG  694
            ||||||..||||.|||||.|||||.|.|||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||...|||||
Sbjct  522  AATCAGCATTGTGATTAGCAAAGGGACCCCATATTATGAAAGCTCTTTGGCCAACAATGTCACTTCCACGGTGG  595

Query  695  GACACTTATCTACAAGTCTTTTTACATTTAAGACAAGTGGATGTTATGGAACACTGGGGATGGAGTCTGGTGTG  768
            ||.||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  596  GATACTTATCTGCAAGTCTGTTTACATTTAAGACAAGTGGTTGCTATGGGACTCTGGGGATGGAGTCTGGTGTG  669

Query  769  ATCGCGGATCCTCAAATAACAGCATCATCTGTGCTGGAGTGGACTGACCACACAGGGCAAGAGAACAGTTGGAA  842
            ||.||.|||||.||.|||||||||||.||||..|||||||||||||||||||..|||||.||||||||.||||.
Sbjct  670  ATTGCCGATCCCCAGATAACAGCATCGTCTGCACTGGAGTGGACTGACCACATGGGGCAGGAGAACAGCTGGAC  743

Query  843  ACCCAAAAAAGCCAGGCTGAAAAAACCTGGACCGCCTTGGGCTGCTTTTGCCACTGATGAATACCAGTGGTTAC  916
            |.|..|.||.||||||||||.||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||..|.||||||.|.|
Sbjct  744  AGCGGAGAAGGCCAGGCTGAGAAAACCCGGGCCTCCCTGGGCTGCTTTTGCCACTGATGAGCATCAGTGGCTGC  817

Query  917  AAATAGATTTGAATAAGGAAAAGAAAATAACAGGCATTATAACCACTGGATCCACCATGGTGGAGCACAATTAC  990
            |.|||||..|.||.|||||.|||||.||||||||.||..||||||||||.||.||||||.|.||.||||.||||
Sbjct  818  AGATAGACCTTAACAAGGAGAAGAAGATAACAGGTATCGTAACCACTGGGTCTACCATGATAGAACACAGTTAC  891

Query  991  TATGTGTCTGCCTACAGAATCCTGTACAGTGATGATGGGCAGAAATGGACTGTGTACAGAGAGCCTGGTGTGGA  1064
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  892  TATGTGTCTGCCTACAGAGTCCTGTACAGTGACGATGGGCAGAGATGGACTGTGTACAGAGAACCTGGTGTGGA  965

Query 1065  GCAAGATAAGATATTTCAAGGAAACAAAGATTATCACCAGGATGTGCGTAATAACTTTTTGCCACCAATTATTG  1138
            .||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  966  CCAGGACAAGATATTTCAAGGAAACAAAGATTATCACAAGGATGTTCGTAATAACTTTTTGCCACCAATTATTG  1039

Query 1139  CACGTTTTATTAGAGTGAATCCTACCCAATGGCAGCAGAAAATTGCCATGAAAATGGAGCTGCTCGGATGTCAG  1212
            |||||||.|||||||||||.|||..|||.|||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||
Sbjct 1040  CACGTTTCATTAGAGTGAACCCTGTCCAGTGGCAACAGAAAATTGCCATGAAAGTGGAACTGCTCGGATGTCAG  1113

Query 1213  TTTATTCCTAAAGGTCGTCCTCCAAAACTTACTCAACCTCCACCTCCTCGGAACAGCAATGACCTCAAAAACAC  1286
            ||||.||..||||||||.|.||||||.||||      |||||||||||||||||.|||||.||||||.|||.||
Sbjct 1114  TTTACTCTCAAAGGTCGCCTTCCAAAGCTTA------CTCCACCTCCTCGGAACGGCAATAACCTCAGAAATAC  1181

Query 1287  TACAGCCCCTCCAAAAATAGCCAAAGGTCGTGCCCCAAAATTTACGCAACCACTACAACCTCGCAGTAGCAATG  1360
            ||||||.|.|||.|||.|||..||||||||||||||.||||||||.|||...||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 1182  TACAGCTCGTCCCAAACTAGGTAAAGGTCGTGCCCCTAAATTTACTCAAGTGCTCCAACCTCGAAGTAGGAATG  1255

Query 1361  AATTTCCTGCACAGACAGAACAAACAACTGCCAGTCCTGATATCAGAAATACTACCGTAACTCCAAATGTAACC  1434
            ||.||||||..|||.|.|...|.||||||.|||.|||||||||.|.|||.||.||.||||||||.|.|||||||
Sbjct 1256  AACTTCCTGTGCAGCCGGCGGAGACAACTACCACTCCTGATATAAAAAACACGACTGTAACTCCCAGTGTAACC  1329

Query 1435  AAAGATGTAGCGCTGGCTGCAGTTCTTGTCCCTGTGCTGGTCATGGTCCTCACTACTCTCATTCTCATATTAGT  1508
            ||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||.||||||.||.|||||.|||||..||||
Sbjct 1330  AAAGATGTCGCACTGGCTGCCGTTCTGGTCCCTGTGCTGGTCATGGCCCTCACCACACTCATCCTCATTCTAGT  1403

Query 1509  GTGTGCTTGGCACTGGAGAAACAGAAAGAAAAAAACTGAAGGCACCTATGACTTACCTTACTGGGACCGGGCAG  1582
            ||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.|||||..|||||||.|||||  
Sbjct 1404  GTGTGCTTGGCACTGGAGAAACAGGAAGAAGAAAACTGAAGGCGCCTATGATTTACCCCACTGGGATCGGGC--  1475

Query 1583  GTTTTTATTTAATGGTCTCTTTGGCTTGCCGTCACAATGAAGGTTGGTGGAAAGGAATGAAGCAGTTTCTTCCT  1656
                                                    |||||||||||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct 1476  ----------------------------------------AGGTTGGTGGAAAGGAATGAAGCAGCTTCTCCCT  1509

Query 1657  GCAAAAGCAGTGGACCATGAGGAAACCCCAGTTCGCTATAGCAGCAGTGAAGTTAATCACCTGAGTCCAAGAGA  1730
            ||.||..|.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||..||||||||.|.||||||||||.|.||.||
Sbjct 1510  GCCAAGTCGGTGGACCACGAGGAGACGCCAGTGCGCTACAGCACTAGTGAAGTCAGTCACCTGAGTGCCAGGGA  1583

Query 1731  AGTCACCACAGTGCTGCAGGCTGACTCTGCAGAGTATGCTCAGCCACTGGTAGGAGGAATTGTTGGTACACTTC  1804
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1584  AGTCACCACAGTGCTGCAGGCCGACTCTGCAGAATATGCACAGCCCCTCGTGGGAGGAATTGTTGGCACACTCC  1657

Query 1805  ATCAAAGATCTACCTTTAAACCAGAAGAAGGAAAAGAAGCAGGCTATGCAGACCTAGATCCTTACAACTCACCA  1878
            ||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1658  ATCAGAGATCCACCTTTAAACCTGAGGAAGGGAAGGAAGCAGGCTATGCAGACCTCGATCCTTACAACTCTCCA  1731

Query 1879  GGGCAGGAAGTTTATCATGCCTATGCTGAACCACTCCCAATTACGGGGCCTGAGTATGCAACCCCAATCATCAT  1952
            ..|||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||..|.||||||||||||||.||||||||.|||.||||
Sbjct 1732  ATGCAGGAAGTGTACCACGCCTATGCTGAACCACTGCCCGTAACGGGGCCTGAGTACGCAACCCCGATCGTCAT  1805

Query 1953  GGACATGTCAGGGCACCCCACAACTTCAGTTGGTCAGCCCTCCACATCCACTTTCAAGGCTACGGGGAACCAAC  2026
            ||||||||||||||||||||||.|.||||||||||.|||||||||||||||.|||||..||.|.||||.|||.|
Sbjct 1806  GGACATGTCAGGGCACCCCACAGCCTCAGTTGGTCTGCCCTCCACATCCACCTTCAAAACTGCAGGGACCCAGC  1879

Query 2027  CTCCCCCACTAGTGGGAACTTACAATACACTTCTCTCCAGGACTGACAGCTGCTCCTCAGCCCAGGCCCAGTAT  2100
            |||.|.|..||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||.||||||
Sbjct 1880  CTCACGCTTTAGTGGGAACTTACAACACTCTTCTCTCCAGGACTGACAGCTGTTCCTCAGGCCAGGCTCAGTAT  1953

Query 2101  GATACCCCGAAAGCTGGGAAGCCAGGT-CTACCTGCCCCAGACGAATTGGTGTACCAGGTGCCACAGAGCACAC  2173
            ||.|||||.||||.|||||||.|||.| |||    |||||||.|||.||||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1954  GACACCCCAAAAGGTGGGAAGTCAGCTGCTA----CCCCAGAGGAACTGGTATACCAGGTGCCCCAGAGCACCC  2023

Query 2174  AAGAAGTATCAGGAGCAGGAAGGGATGGGGAATGTGATGTTTTTAAAGAAATCCTT  2229
            |.||..|||||||||||||||||||||.|.|.|.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 2024  AGGAGCTATCAGGAGCAGGAAGGGATGAGAAGTTTGATGCTTTTAAAGAAATCCTT  2079