Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13173
• Subject: XM_017007733.1
• Aligned Length: 1734
• Identities: 1299
• Gaps: 435

Alignment

Query    1  ATGCCGCCGCCCAGCCCCGACTCAGAGAACGGCTTCTACCCCGGGCTGCCGTCGTCCATGAACCCGGCCTTCTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCCTAGCTTCTCGCCCGTGTCGCCGCACGGCTGCACTGGGCTCAGCGTTCCGCCGCCCGCCATGAATATACCTC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AACAGCAGCCCCCGCCGCCCGCGGCGCCGCAGCAGCCGCAGAGCCGGAGGTCGCCCGTCAGCCCGCAGCTCCAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CAGCAGCACCAGGCGGCGGCCGCCGCCTTCCTGCAGCAGAGGAACTCCTATAACCACCACCAGCCTCTTCTGAA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  ACAGTCTCCCTGGAGCAACCATCAGAGCAGTGGCTGGGGCACTGGAAGTATGTCCTGGGGAGCAATGCATGGCA  370
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------------ATGTCCTGGGGAGCAATGCATGGCA  25

Query  371  GAGATCATCGTAGAACCGGAAACATGGGAATCCCAGGAACTATGAATCAGATATCTCCATTGAAGAAACCGTTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   26  GAGATCATCGTAGAACCGGAAACATGGGAATCCCAGGAACTATGAATCAGATATCTCCATTGAAGAAACCGTTT  99

Query  445  TCTGGTAATGTCATAGCACCACCGAAATTTACTCGCTCAACTCCATCACTGACTCCAAAATCTTGGATTGAAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  100  TCTGGTAATGTCATAGCACCACCGAAATTTACTCGCTCAACTCCATCACTGACTCCAAAATCTTGGATTGAAGA  173

Query  519  TAATGTGTTCAGAACAGACAACAATAGTAATACACTCTTACCCTTACAGGTAAGAAT-----------------  575
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
Sbjct  174  TAATGTGTTCAGAACAGACAACAATAGTAATACACTCTTACCCTTACAGGTAAGAATGGTGAGATCTAGTTTGC  247

Query  576  -------------------------------------------------------------------------G  576
                                                                                     |
Sbjct  248  AGTTGCCAGCTTGGGGCTCAGATTCACTCCAAGATAGTTGGTGCACTGCAGCCGGAACATCCAGAATAGACCAG  321

Query  577  GATCGAAGTAGAATGTATGACAGTTTGAATATGCACTCTTTGGAAAATTCCCTTATCGATATTATGAGAGCAGA  650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  322  GATCGAAGTAGAATGTATGACAGTTTGAATATGCACTCTTTGGAAAATTCCCTTATCGATATTATGAGAGCAGA  395

Query  651  GCATGATCCTCTTAAGGGTCGATTGAGCTATCCACATCCAGGAACTGACAATCTGTTGATGTTAAATGCAAGGA  724
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  396  GCATGATCCTCTTAAGGGTCGATTGAGCTATCCACATCCAGGAACTGACAATCTGTTGATGTTAAATGCAAGGA  469

Query  725  GTTATGGGCGAAGACGAGGTCGTTCTTCCCTCTTTCCAATAGATGATGGCTTGCTTGATGATGGTCACAGTGAT  798
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  470  GTTATGGGCGAAGACGAGGTCGTTCTTCCCTCTTTCCAATAGATGATGGCTTGCTTGATGATGGTCACAGTGAT  543

Query  799  CAAGTTGGAGTTTTAAATTCACCCACCTGTTATTCAGCTCACCAAAATGGAGAGCGAATAGAACGCTTCTCTCG  872
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  544  CAAGTTGGAGTTTTAAATTCACCCACCTGTTATTCAGCTCACCAAAATGGAGAGCGAATAGAACGCTTCTCTCG  617

Query  873  AAAAGTTTTTGTTGGTGGTCTTCCTCCAGATATTGATGAAGATGAAATAACTGCTAGCTTCAGAAGATTTGGGC  946
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  618  AAAAGTTTTTGTTGGTGGTCTTCCTCCAGATATTGATGAAGATGAAATAACTGCTAGCTTCAGAAGATTTGGGC  691

Query  947  CTTTGGTAGTAGATTGGCCTCATAAAGCAGAAAGCAAGTCCTATTTTCCACCAAAAGGCTATGCATTTCTTCTC  1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  692  CTTTGGTAGTAGATTGGCCTCATAAAGCAGAAAGCAAGTCCTATTTTCCACCAAAAGGCTATGCATTTCTTCTC  765

Query 1021  TTTCAAGAAGAGAGCTCAGTTCAGGCACTCATTGATGCTTGTATTGAAGAAGATGGAAAACTCTATCTGTGTGT  1094
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  766  TTTCAAGAAGAGAGCTCAGTTCAGGCACTCATTGATGCTTGTATTGAAGAAGATGGAAAACTCTATCTGTGTGT  839

Query 1095  TTCTAGCCCTACTATCAAGGACAAACCAGTTCAAATACGTCCTTGGAATTTAAGTGATAGTGATTTTGTAATGG  1168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  840  TTCTAGCCCTACTATCAAGGACAAACCAGTTCAAATACGTCCTTGGAATTTAAGTGATAGTGATTTTGTAATGG  913

Query 1169  ATGGTTCTCAGCCTTTGGATCCCCGAAAAACAATTTTTGTTGGAGGTGTTCCTAGGCCATTAAGGGCTGTGGAA  1242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  914  ATGGTTCTCAGCCTTTGGATCCCCGAAAAACAATTTTTGTTGGAGGTGTTCCTAGGCCATTAAGGGCTGTGGAA  987

Query 1243  CTTGCTATGATCATGGACCGGCTGTATGGTGGAGTTTGTTATGCAGGAATTGATACAGATCCTGAGCTAAAATA  1316
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  988  CTTGCTATGATCATGGACCGGCTGTATGGTGGAGTTTGTTATGCAGGAATTGATACAGATCCTGAGCTAAAATA  1061

Query 1317  CCCAAAAGGTGCTGGGCGAGTTGCTTTCTCCAATCAGCAGAGCTATATTGCTGCCATTAGTGCTCGGTTTGTTC  1390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062  CCCAAAAGGTGCTGGGCGAGTTGCTTTCTCCAATCAGCAGAGCTATATTGCTGCCATTAGTGCTCGGTTTGTTC  1135

Query 1391  AGCTTCAGCATGGTGATATTGATAAACGTGTGGAGGTAAAGCCATATGTGCTAGATGACCAGATGTGTGATGAA  1464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1136  AGCTTCAGCATGGTGATATTGATAAACGTGTGGAGGTAAAGCCATATGTGCTAGATGACCAGATGTGTGATGAA  1209

Query 1465  TGCCAGGGCGCACGCTGTGGTGGAAAATTTGCTCCCTTTTTTTGTGCCAATGTCACTTGCCTGCAGTATTACTG  1538
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210  TGCCAGGGCGCACGCTGTGGTGGAAAATTTGCTCCCTTTTTTTGTGCCAATGTCACTTGCCTGCAGTATTACTG  1283

Query 1539  TGAGTTTTGTTGGGCAAATATCCACTCTCGTGCTGGACGTGAGTTCCATAAGCCATTGGTAAAGGAAGGTGCTG  1612
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284  TGAGTTTTGTTGGGCAAATATCCACTCTCGTGCTGGACGTGAGTTCCATAAGCCATTGGTAAAGGAAGGTGCTG  1357

Query 1613  ATCGCCCACGTCAGATCCACTTCCGCTGGAAC  1644
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1358  ATCGCCCACGTCAGATCCACTTCCGCTGGAAC  1389