Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13215
• Subject: NM_153810.5
• Aligned Length: 1110
• Identities: 903
• Gaps: 204

Alignment

Query    1  ATGGAGGAAAGCATGGAAGAGGAGGAGGGGGGCAGCTACGAGGCGATGATGGACGACCAGAACCACAACAACTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGAAAGCATGGAAGAGGAGGAGGGGGGCAGCTACGAGGCGATGATGGACGACCAGAACCACAACAACTG  74

Query   75  GGAGGCTGCGGTGGACGGCTTCCGGCAGCCCCTGCCACCTCCGCCGCCCCCCTCGTCGATCCCGGCCCCTGCCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGGCTGCGGTGGACGGCTTCCGGCAGCCCCTGCCACCTCCGCCGCCCCCCTCGTCGATCCCGGCCCCTGCCC  148

Query  149  GAGAGCCTCCGGGGGGGCAGCTGCTGGCGGTGCCCGCGGTCTCCGTGGACAGGAAAGGCCCCAAGGAGGGGCTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAGAGCCTCCGGGGGGGCAGCTGCTGGCGGTGCCCGCGGTCTCCGTGGACAGGAAAGGCCCCAAGGAGGGGCTC  222

Query  223  CCGATGGGGCCGCAGCCACCGCCGGAGGCTAATGGGGTGATCATGATGTTGAAGAGCTGCGACGCGGCCGCCGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCGATGGGGCCGCAGCCACCGCCGGAGGCTAATGGGGTGATCATGATGTTGAAGAGCTGCGACGCGGCCGCCGC  296

Query  297  CGTGGCCAAGGCGGCCCCCGCCCCCACCGCCAGCTCCACCATCAACATCAACACCTCCACCTCCAAGTTCTTAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGTGGCCAAGGCGGCCCCCGCCCCCACCGCCAGCTCCACCATCAACATCAACACCTCCACCTCCAAGTTCTTAA  370

Query  371  TGAATGTTATAACTATTGAAGATTATAAGAGCACATACTGGCCAAAATTGGATGGTGCCATAGATCAACTTTTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGAATGTTATAACTATTGAAGATTATAAGAGCACATACTGGCCAAAATTGGATGGTGCCATAGATCAACTTTTA  444

Query  445  ACTCAGAGTCCTGGTGACTATATCCCCATATCCTATGAACAGATATACAGTTGTGTGTATAAATGTGTATGCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACTCAGAGTCCTGGTGACTATATCCCCATATCCTATGAACAGATATACAGTTGTGTGTATAAATGTGTATGCCA  518

Query  519  GCAGCACTCGGAACAGATGTATAGTGATCTGATTAAAAAGATAACTAATCACTTAGAGAGAGTCTCAAAGGAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCAGCACTCGGAACAGATGTATAGTGATCTGATTAAAAAGATAACTAATCACTTAGAGAGAGTCTCAAAGGAGC  592

Query  593  TGCAGGCCAGCCCTCCAGATCTCTATATTGAAAGATTTAATATAGCTCTTGGACAATATATGGGAGCATTGCAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCAGGCCAGCCCTCCAGATCTCTATATTGAAAGATTTAATATAGCTCTTGGACAATATATGGGAGCATTGCAG  666

Query  667  AGCATTGTGCCTCTTTTCATATATATGAATAAGTTTTACATCGAAACCAAGCTTAACAGAGACTTAAAAGATGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGCATTGTGCCTCTTTTCATATATATGAATAAGTTTTACATCGAAACCAAGCTTAACAGAGACTTAAAAGATGA  740

Query  741  CCTTATAAAGCTGTTTACGGAACATGTTGCAGAAAAGCACATTTACAGCCTAATGCCTTTACTTTTAGAAGCCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTTATAAAGCTGTTTACGGAACATGTTGCAGAAAAGCACATTTACAGCCTAATGCCTTTACTTTTAGAAGCCC  814

Query  815  AGTCAACACCATTTCAGGTCACACCTTCAACTATGGCAAATATTGTGAAAGGCCTGTATACCCTCAGACCAG--  886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct  815  AGTCAACACCATTTCAGGTCACACCTTCAACTATGGCAAATATTGTGAAAGGCCTGTATACCCTCAGACCAGAG  888

Query  887  -------------------------TTTCTCAGAATTTTA------------------CAGCAGTG--------  909
                                     |||||   ||.||||                  |.||.|||        
Sbjct  889  TGGGTTCAGATGGCTCCAACTCTATTTTCT---AAATTTATTCCAAACATTCTCCCTCCGGCGGTGGAATCTGA  959

Query  910  --------------------------------------------------------------------------  909
                                                                                      
Sbjct  960  ACTTTCTGAATATGCTGCTCAAGATCAGAAATTTCAAAGAGAACTTATACAGAATGGTTTTACAAGGGGTGACC  1033

Query  910  --------------------------------------------------------------------------  909
                                                                                      
Sbjct 1034  AGTCCCGGAAGAGAGCTGGGGATGAGTTGGCTTATAATAGCTCGTCAGCATGTGCAAGTTCCAGGGGGTACAGA  1107