Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_13226
Subject:
NM_001286534.2
Aligned Length:
813
Identities:
774
Gaps:
36

Alignment

Query   1  ATGATTCAACCAAGATTGCTTGCTGATGCCATTGTTCTTTTTACATCAAGTCAAGAGGAAGTTACTCTTGCTGT  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGATTCAACCAAGATTGCTTGCTGATGCCATTGTTCTTTTTACATCAAGTCAAGAGGAAGTTACTCTTGCTGT  74

Query  75  TACTCCACTGAATTTTTGCCTCAAGAGTTCTAATGAGGAATCAATGGATTTGAGCAATGCTGTACACAGTGAGA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TACTCCACTGAATTTTTGCCTCAAGAGTTCTAATGAGGAATCAATGGATTTGAGCAATGCTGTACACAGTGAGA  148

Query 149  TGTTTGTTGGCTCAGATGAGTTTGACTTCTTTCAAATTGGAATGGACACTGAGATAACATTTTGTTTCAAAGAA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TGTTTGTTGGCTCAGATGAGTTTGACTTCTTTCAAATTGGAATGGACACTGAGATAACATTTTGTTTCAAAGAA  222

Query 223  TTGAAGGGAATACTGACATTTTCAGAAGCTACACATGCTCCTATATCCATTTATTTTGATTTCCCTGGGAAACC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  TTGAAGGGAATACTGACATTTTCAGAAGCTACACATGCTCCTATATCCATTTATTTTGATTTCCCTGGGAAACC  296

Query 297  TCTGGCTTTGAGTATTGATGATATGTTAGTGGAAGCTAACTTTATTTTGGCCACATTAGCTGATGAACAAAGTA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  TCTGGCTTTGAGTATTGATGATATGTTAGTGGAAGCTAACTTTATTTTGGCCACATTAGCTGATGAACAAAGTA  370

Query 371  GAGCATCTTCACCACAGTCACTGTGTCTTTCACAGAAACGAAAAAGGTCAGATCTGATTGAAAAAAAGGCTGGC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  GAGCATCTTCACCACAGTCACTGTGTCTTTCACAGAAACGAAAAAGGTCAGATCTGATTGAAAAAAAGGCTGGC  444

Query 445  AAAAATGTAACTGGCCAGGCCCTGGAATGTATTTCAAAAAAAGCAGCACCAAGAAGGCTTTATCCTAAGGAGAC  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  AAAAATGTAACTGGCCAGGCCCTGGAATGTATTTCAAAAAAAGCAGCACCAAGAAGGCTTTATCCTAAGGAGAC  518

Query 519  TCTCACAAACATATCTGCATTGGAAAACTGTGGCAGCCCTGCAATGAAAAGAGTGGATGGAGATGTCAGTGAAG  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  TCTCACAAACATATCTGCATTGGAAAACTGTGGCAGCCCTGCAATGAAAAGAGTGGATGGAGATGTCAGTGAAG  592

Query 593  TATCAGAAAGCAGTGTCAGCAACACAGAGGAAGTGCCAGGGTCTCTGTGTCTCAGAAAGTTTTCTTGCATGTTC  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  TATCAGAAAGCAGTGTCAGCAACACAGAGGAAGTGCCAGGGTCTCTGTGTCTCAGAAAGTTTTCTTGCATGTTC  666

Query 667  TTTGGAGCAGTTTCTTCTGACCAGCAAGAACACTTCAACCACCCTTTCGACAGTCTGGCAAGAGCAAGTGACAG  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  TTTGGAGCAGTTTCTTCTGACCAGCAAGAACACTTCAACCACCCTTTCGACAGTCTGGCAAGAGCAAGTGACAG  740

Query 741  TGAAGAGGACATGAATAATGTGTGCTGCAGGAAAGAATTTAATGGAAGTGATGCCAAATATTTCTGTATTATC  813
           ||||||||||||||||||||      ||||                              |||||.|||..||
Sbjct 741  TGAAGAGGACATGAATAATG------GCAG------------------------------TTTCTCTATATTC  777