Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13274
- Subject:
- NM_001097644.1
- Aligned Length:
- 873
- Identities:
- 673
- Gaps:
- 159
Alignment
Query 1 ATGCCCGAAGATTTAGCTTTGGAGTCAAACCCTTCTGACCATCCAAGGGCAAGCACAATTTTCCTGAGCAAATC 74
||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCCGAAGATCTAGCTTTGGAATCAAACCCTTCCGACCACCCGAGGGCAAGCACAATTTTCCTGAGCAAATC 74
Query 75 TCAAACGGATGTGCGAGAAAAGAGGAAGAGCAACCATTTGAACCAT---------------------------- 120
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 75 TCAAACGGATGTGCGTGAAAAGAGGAAGAGCAACCATTTAAACCATGTATCTCCAGGGCAGCTTACTAAAAAGT 148
Query 121 -------------------------------------------------------------------------T 121
|
Sbjct 149 ATAGCTCATGCTCAACAATATTTCTAGATGACAGCACAGTCAGCCAGCCTAACCTTAGAACCACAATAAAATGT 222
Query 122 GTGACCTTAGCAATATATTACCACATAAAGAACAG--------------------------------------- 156
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTGACCTTAGCAATATATTACCACATAAAGAACAGAGATGCAAATAGATCCCTGGACATTTTTGATGAGCGGTC 296
Query 157 -------------CGAGAAAAAGTTCCAGAGGAATACTTTAAGCATGATCCTGAGCACAAATTTATTTACAGAT 217
.||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297 ACATCCTCTCACAAGAGAGAAAGTTCCAGAGGAGTACTTTAAGCATGACCCTGAACACAAATTTATTTACAGAT 370
Query 218 TTGTTCGTACTCTTTTTAGTGCTGCACAGCTAACAGCTGAATGTGCAATAGTAACTTTGGTTTACTTAGAAAGG 291
||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 371 TTGTTCGTACACTTTTTAGTGCTGCACAGCTGACAGCGGAATGTGCAATAGTGACGTTGGTTTACTTAGAGAGG 444
Query 292 CTTTTAACTTATGCTGAAATCGACATTTGTCCCACCAACTGGAAAAGGATTGTTCTGGGAGCCATTCTTCTTGC 365
||..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTCCTAACTTATGCTGAGATCGACATTTGTCCCACCAACTGGAAAAGAATTGTTCTGGGAGCCATTCTTCTTGC 518
Query 366 CTCCAAGGTTTGGGACGATCAGGCTGTATGGAATGTGGACTACTGCCAGATCCTCAAGGACATTACAGTTGAGG 439
|||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519 CTCCAAGGTTTGGGATGACCAGGCTGTATGGAATGTAGACTACTGCCAGATCCTCAAGGACATTACGGTTGAGG 592
Query 440 ACATGAATGAAATGGAAAGGCATTTTCTGGAGCTTCTTCAGTTTAATATTAATGTTCCTGCCAGTGTTTATGCC 513
||||||||||.||||||||||||||..|||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACATGAATGAGATGGAAAGGCATTTCTTGGAGCTACTCCAGTTTAATATTAATGTTCCTGCCAGTGTTTATGCC 666
Query 514 AAATACTACTTTGACCTTCGCTCCTTAGCAGATGACAACAACCTGAATTTTCTATTTGCTCCTCTTAGCAAAGA 587
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 667 AAATACTACTTTGACCTTCGCTCCTTAGCAGATGACAACAACCTGAATTTTCTGTTTGCTCCTCTCAGCAAAGA 740
Query 588 AAGAGCACAGAACCTAGAGGCTATTTCTAGATTGTGTGAAG------ACAAAGACTTGTGTAGAGCCGCTATGA 655
|||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||| |||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 741 AAGAGCACAGAACCTAGAGGCCATTTCAAGATTGTGTGAAGACAAATACAAAGACTTGTGTAGAGCTGCTATGA 814
Query 656 GAAGGTCTTTCAGTGCTGATAACTTCATTGGTATTCAGCGCTCTAAAGCCATCCTCTCT 714
||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 815 GAAGATCTTTAAGCGCTGATAATTTCATTGGTATTCAGCGCTCTAATGCCATCCTCTCT 873