Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13279
• Subject: NM_001317912.2
• Aligned Length: 699
• Identities: 543
• Gaps: 156

Alignment

Query   1  ATGCCTGCTTTTTCAACAACTGCAGCTGAATATGTAAAATCTCGACTCCCAGAGGCCCTTAAACAGCATCTTCA  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  GGACTACGAGAAAGACAAAGAAAATAGTGTATTATCTTACCAGACCATCCTTGAACAGCAGATTTTGTCAATTG  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  ACCGAGAAATGCTAGAAAAATTGACTGTATCCTATGATGAAGCAGGCACAACGTGTTTGATTGCTCTGCTATCA  222
                   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  --------ATGCTAGAAAAATTGACTGTATCCTATGATGAAGCAGGCACAACGTGTTTGATTGCTCTGCTATCA  66

Query 223  GATAAAGACCTCACTGTGGCCAACGTGGGTGACTCGCGCGGGGTCCTGTGTGACAAAGATGGGAACGCTATTCC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  67  GATAAAGACCTCACTGTGGCCAACGTGGGTGACTCGCGCGGGGTCCTGTGTGACAAAGATGGGAACGCTATTCC  140

Query 297  TTTGTCTCATGATCACAAGCCTTACCAGTTGAAGGAAAGAAAGAGGATAAAGAGAGCAGGTGGTTTCATCAGTT  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 141  TTTGTCTCATGATCACAAGCCTTACCAGTTGAAGGAAAGAAAGAGGATAAAGAGAGCAGGTGGTTTCATCAGTT  214

Query 371  TCAATGGCTCCTGGAGGGTCCAGGGAATCCTGGCCATGTCTCGGTCCCTGGGGGATTATCCGCTGAAAAATCTC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 215  TCAATGGCTCCTGGAGGGTCCAGGGAATCCTGGCCATGTCTCGGTCCCTGGGGGATTATCCGCTGAAAAATCTC  288

Query 445  AACGTGGTCATCCCAGACCCAGACATCCTGACCTTTGACCTGGACAAGCTTCAGCCTGAGTTCATGATCTTGGC  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 289  AACGTGGTCATCCCAGACCCAGACATCCTGACCTTTGACCTGGACAAGCTTCAGCCTGAGTTCATGATCTTGGC  362

Query 519  ATCAGATGGTCTCTGGGATGCTTTCAGCAATGAAGAAGCAGTTCGATTCATCAAGGAGCGCTTGGATGAACCTC  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 363  ATCAGATGGTCTCTGGGATGCTTTCAGCAATGAAGAAGCAGTTCGATTCATCAAGGAGCGCTTGGATGAACCTC  436

Query 593  ACTTTGGGGCCAAGAGCATAGTTTTACAGTCATTTTACAGAGGCTGCCCTGACAATATAACAGTCATGGTGGTG  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 437  ACTTTGGGGCCAAGAGCATAGTTTTACAGTCATTTTACAGAGGCTGCCCTGACAATATAACAGTCATGGTGGTG  510

Query 667  AAGTTCAGAAATAGCAGCAAAACAGAAGAGCAG  699
           |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 511  AAGTTCAGAAATAGCAGCAAAACAGAAGAGCAG  543