Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13280
• Subject: NM_153635.3
• Aligned Length: 1661
• Identities: 1501
• Gaps: 154

Alignment

Query    1  ATGTCTCTCGGCGGAGCCTCCGAGCGCAGCGTCCCGGCCACCAAGATTGAAATTACCGTGTCCTGCCGGAACCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTCTCGGCGGAGCCTCCGAGCGCAGCGTCCCGGCCACCAAGATTGAAATTACCGTGTCCTGCCGGAACCT  74

Query   75  GCTAGACCTTGATACCTTCTCCAAGTCCGACCCCATGGTGGTGCTTTACACGCAGAGCCGGGCCAGCCAGGAGT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCTAGACCTTGATACCTTCTCCAAGTCCGACCCCATGGTGGTGCTTTACACGCAGAGCCGGGCCAGCCAGGAGT  148

Query  149  GGCGGGAGTTCGGACGGACCGAGGTGATTGATAACACGCTGAACCCAGACTTCGTGCGCAAATTCGTCCTCGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCGGGAGTTCGGACGGACCGAGGTGATTGATAACACGCTGAACCCAGACTTCGTGCGCAAATTCGTCCTCGAC  222

Query  223  TATTTCTTTGAGGAAAAGCAAAATCTGCGCTTCGATGTGTACAACGTGGACTCCAAAACCAACATCTCCAAACC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TATTTCTTTGAGGAAAAGCAAAATCTGCGCTTCGATGTGTACAACGTGGACTCCAAAACCAACATCTCCAAACC  296

Query  297  GAAGGATTTCCTGGGACAAGCGTTCCTGGCCCTGGGAGAGGTGATTGGAGGCCAGGGCAGCCGAGTAGAGCGAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAGGATTTCCTGGGACAAGCGTTCCTGGCCCTGGGAGAGGTGATTGGAGGCCAGGGCAGCCGAGTAGAGCGAA  370

Query  371  CCCTCACGGGTGTACCAGGCAAGAAGTGTGGGACCATATTGCTGACTGCAGAAGAGCTTAGCAATTGTCGGGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCTCACGGGTGTACCAGGCAAGAAGTGTGGGACCATATTGCTGACTGCAGAAGAGCTTAGCAATTGTCGGGAC  444

Query  445  ATTGCCACCATGCAGCTGTGTGCAAACAAGCTGGACAAGAAGGACTTCTTTGGGAAATCAGACCCCTTCCTTGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTGCCACCATGCAGCTGTGTGCAAACAAGCTGGACAAGAAGGACTTCTTTGGGAAATCAGACCCCTTCCTTGT  518

Query  519  GTTCTACAGGAGCAATGAGGATGGCACGTTCACCATCTGCCACAAGACAGAGGTTGTGAAAAACACGCTGAATC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTTCTACAGGAGCAATGAGGATGGCACGTTCACCATCTGCCACAAGACAGAGGTTGTGAAAAACACGCTGAATC  592

Query  593  CTGTGTGGCAGCCCTTCAGCATCCCTGTGCGGGCTCTGTGCAATGGAGACTATGACAGAACGGTGAAGATTGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGTGTGGCAGCCCTTCAGCATCCCTGTGCGGGCTCTGTGCAATGGAGACTATGACAGAACGGTGAAGATTGAT  666

Query  667  GTGTACGACTGGGACCGGGATGGAAGCCACGATTTCATTGGTGAGTTCACCACCAGCTACCGGGAGCTGAGCAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGTACGACTGGGACCGGGATGGAAGCCACGATTTCATTGGTGAGTTCACCACCAGCTACCGGGAGCTGAGCAA  740

Query  741  GGCCCAGAACCAGTTCACAGTATATGAGGTTCTTAACCCTCGGAAGAAATGTAAGAAGAAGAAATATGTCAACT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCCCAGAACCAGTTCACAGTATATGAGGTTCTTAACCCTCGGAAGAAATGTAAGAAGAAGAAATATGTCAACT  814

Query  815  CAGGAACTGTGACGCTGCTCTCCTTCTCTGTGGACTCTGAATTCACTTTTGTTGATTACATCAAGGGAGGGACA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGGAACTGTGACGCTGCTCTCCTTCTCTGTGGACTCTGAATTCACTTTTGTTGATTACATCAAGGGAGGGACA  888

Query  889  CAGCTGAACTTCACAGTAGCCATTGACTTCACGGCTTCCAATGGGAATCCTCTGCAGCCTACCTCCCTGCACTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGCTGAACTTCACAGTAGCCATTGACTTCACGGCTTCCAATGGGAATCCTCTGCAGCCTACCTCCCTGCACTA  962

Query  963  CATGAGTCCCTACCAGCTCAGCGCCTATGCCATGGCCCTCAAGGCAGTGGGAGAGATCATCCAGGACTATGACA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATGAGTCCCTACCAGCTCAGCGCCTATGCCATGGCCCTCAAGGCAGTGGGAGAGATCATCCAGGACTATGACA  1036

Query 1037  GTGATAAGCTCTTCCCAGCTTATGGCTTTGGGGCCAAGCTGCCCCCAGAGGGACGGATCTCCCACCAGTTCCCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTGATAAGCTCTTCCCAGCTTATGGCTTTGGGGCCAAGCTGCCCCCAGAGGGACGGATCTCCCACCAGTTCCCC  1110

Query 1111  CTGAACAACAATGATGAGGACCCCAACTGTGCGGGCATCGAGGGTGTGCTGGAGAGCTATTTCCAGAGCCTGCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGAACAACAATGATGAGGACCCCAACTGTGCGGGCATCGAGGGTGTGCTGGAGAGCTATTTCCAGAGCCTGCG  1184

Query 1185  CACAGTGCAGCTCTATGGGCCCACCTACTTTGCTCCTGTCATCAACCAAGTGGCCAGGGCTGCAGCCAAGATCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CACAGTGCAGCTCTATGGGCCCACCTACTTTGCTCCTGTCATCAACCAAGTGGCCAGGGCTGCAGCCAAGATCT  1258

Query 1259  CTGATGGCTCCCAGTACTATGTTCTGCTCATCATCACTGATGGGGTCATCTCTGACATGACGCAGACCAAGGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGATGGCTCCCAGTACTATGTTCTGCTCATCATCACTGATGGGGTCATCTCTGACATGACGCAGACCAAGGAG  1332

Query 1333  GCCATCGTCAGCGCCTCCTCATTGCCCATGTCTATCATTATCGTCGGTGTAGGACCAGCCATGTTTGAGGCAAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCCATCGTCAGCGCCTCCTCATTGCCCATGTCTATCATTATCGTCGGTGTAGGACCAGCCATGTTTGAGGCAAT  1406

Query 1407  GGAAGAGTTGGACGGTGATGATGTGCGCGTGTCCTCTAGGGGACGCTACGCAGAGCGGGACATCGTTCAG----  1476
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct 1407  GGAAGAGTTGGACGGTGATGATGTGCGCGTGTCCTCTAGGGGACGCTACGCAGAGCGGGACATCGTTCAGTTCG  1480

Query 1477  ---------GA----AGGTTG-CTG----------CAG-------CCTTGGCAC------------ATCCGTGG  1507
                     ||    |.|||| |.|          |||       .|.||||.|            ||  |||.
Sbjct 1481  TCCCATTCCGAGACTATGTTGACCGGTCGGGGAACCAGGTGTTGAGCATGGCCCGACTGGCCAAGGAT--GTGC  1552

Query 1508  TG------------------------------------------------------------------------  1509
            ||                                                                        
Sbjct 1553  TGGCCGAGATCCCGGAGCAGCTGCTGTCCTATATGCGCACCAGAGACATCCAGCCTCGGCCCCCACCCCCTGCC  1626

Query 1510  ---------------------------------  1509
                                             
Sbjct 1627  AACCCCAGCCCGATCCCAGCTCCAGAGCAGCCC  1659