Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13280
• Subject: NM_170673.3
• Aligned Length: 1666
• Identities: 1386
• Gaps: 164

Alignment

Query    1  ATGTCTCTCGGCGGAGCCTCCGAGCGCAGCGTCCCGGCCACCAAGATTGAAATTACCGTGTCCTGCCGGAACCT  74
            |||||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct    1  ATGTCTCTCAGCGGAGCCTCGGAGCGTAGCGTCCCGGCCACCAAGATTGAAATTACTGTGTCGTGCCGGAATCT  74

Query   75  GCTAGACCTTGATACCTTCTCCAAGTCCGACCCCATGGTGGTGCTTTACACGCAGAGCCGGGCCAGCCAGGAGT  148
            |||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCTAGACCTGGATACATTCTCCAAGTCGGACCCCATGGTGGTGCTTCACACGCAGAGCCGGGCCAGCCAGGAGT  148

Query  149  GGCGGGAGTTCGGACGGACCGAGGTGATTGATAACACGCTGAACCCAGACTTCGTGCGCAAATTCGTCCTCGAC  222
            ||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  GGCGGGAGTTCGGACGAACCGAGGTGATTGACAACACACTGAATCCAGACTTCGTGCGCAAATTCGTTCTCGAC  222

Query  223  TATTTCTTTGAGGAAAAGCAAAATCTGCGCTTCGATGTGTACAACGTGGACTCCAAAACCAACATCTCCAAACC  296
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||.||||.|||||||||||
Sbjct  223  TATTTCTTTGAGGAAAAGCAAAATCTCCGCTTCGATGTGTACAACGTCGACTCTAAAGCCAATATCTCCAAACC  296

Query  297  GAAGGATTTCCTGGGACAAGCGTTCCTGGCCCTGGGAGAGGTGATTGGAGGCCAGGGCAGCCGAGTAGAGCGAA  370
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.
Sbjct  297  GAAGGATTTCCTGGGACAAGCATTCCTGGCCCTGGGAGAGGTGATTGGAGGCCAGGGCAGCCGTGTGGAGCGAC  370

Query  371  CCCTCACGGGTGTACCAGGCAAGAAGTGTGGGACCATATTGCTGACTGCAGAAGAGCTTAGCAATTGTCGGGAC  444
            |.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||.|||||||.||.||.|||||.|||||.||..|||||
Sbjct  371  CTCTTACGGGTGTGCCAGGAAAGAAGTGTGGGACCATACTGCTGACCGCCGAGGAGCTGAGCAACTGCAGGGAC  444

Query  445  ATTGCCACCATGCAGCTGTGTGCAAACAAGCTGGACAAGAAGGACTTCTTTGGGAAATCAGACCCCTTCCTTGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  445  ATTGCCACCATGCAGCTGTGTGCAAACAAGCTGGACAAAAAGGACTTCTTTGGGAAGTCAGACCCTTTCCTTGT  518

Query  519  GTTCTACAGGAGCAATGAGGATGGCACGTTCACCATCTGCCACAAGACAGAGGTTGTGAAAAACACGCTGAATC  592
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  519  GTTCTACAGGAGCAATGAAGATGGCACGTTCACCATCTGCCACAAGACAGAGGTTGTGAAAAACACACTGAACC  592

Query  593  CTGTGTGGCAGCCCTTCAGCATCCCTGTGCGGGCTCTGTGCAATGGAGACTATGACAGAACGGTGAAGATTGAT  666
            |.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct  593  CAGTATGGCAGCCCTTCAGCATCCCTGTGCGGGCACTGTGCAACGGAGACTATGACAGAACAGTGAAGATCGAC  666

Query  667  GTGTACGACTGGGACCGGGATGGAAGCCACGATTTCATTGGTGAGTTCACCACCAGCTACCGGGAGCTGAGCAA  740
            ||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTATATGACTGGGACCGAGATGGAAGCCACGACTTCATTGGCGAGTTCACAACCAGCTACCGGGAGCTGAGCAA  740

Query  741  GGCCCAGAACCAGTTCACAGTATATGAGGTTCTTAACCCTCGGAAGAAATGTAAGAAGAAGAAATATGTCAACT  814
            |||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||..|||||
Sbjct  741  GGCCCAGAATCAGTTCACAGTGTACGAGGTACTTAACCCTCGGAAGAAATGCAAGAAGAAGAAATATACCAACT  814

Query  815  CAGGAACTGTGACGCTGCTCTCCTTCTCTGTGGACTCTGAATTCACTTTTGTTGATTACATCAAGGGAGGGACA  888
            |.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CGGGGACCGTGACGCTCCTTTCCTTCTCTGTGGACTCAGAATTCACTTTTGTGGATTACATCAAGGGAGGGACA  888

Query  889  CAGCTGAACTTCACAGTAGCCATTGACTTCACGGCTTCCAATGGGAATCCTCTGCAGCCTACCTCCCTGCACTA  962
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct  889  CAGCTGAACTTCACCGTAGCTATTGACTTCACTGCTTCCAATGGGAATCCCCTGCAGCCTACGTCGCTGCACTA  962

Query  963  CATGAGTCCCTACCAGCTCAGCGCCTATGCCATGGCCCTCAAGGCAGTGGGAGAGATCATCCAGGACTATGACA  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  963  CATGAGTCCCTACCAGCTCAGCGCCTATGCCATGGCCCTCAAGGCAGTGGGAGAGATCATCCAGGACTACGACA  1036

Query 1037  GTGATAAGCTCTTCCCAGCTTATGGCTTTGGGGCCAAGCTGCCCCCAGAGGGACGGATCTCCCACCAGTTCCCC  1110
            ||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTGACAAGCTCTTCCCAGCCTATGGTTTTGGGGCCAAGCTGCCCCCAGAGGGGCGGATCTCCCACCAGTTCCCC  1110

Query 1111  CTGAACAACAATGATGAGGACCCCAACTGTGCGGGCATCGAGGGTGTGCTGGAGAGCTATTTCCAGAGCCTGCG  1184
            ||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 1111  CTGAACAATAACGATGAAGACCCCAACTGTGCAGGCATTGAGGGTGTGCTAGAGAGTTACTTCCAGAGTCTGCG  1184

Query 1185  CACAGTGCAGCTCTATGGGCCCACCTACTTTGCTCCTGTCATCAACCAAGTGGCCAGGGCTGCAGCCAAGATCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1185  CACAGTGCAGCTCTATGGGCCCACTTACTTTGCACCTGTCATCAACCAGGTGGCCAGGGCTGCAGCCAAAATCT  1258

Query 1259  CTGATGGCTCCCAGTACTATGTTCTGCTCATCATCACTGATGGGGTCATCTCTGACATGACGCAGACCAAGGAG  1332
            |.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1259  CGGATGGTTCCCAGTACTACGTTCTGCTCATTATCACTGACGGCGTCATCTCCGACATGACACAGACCAAAGAG  1332

Query 1333  GCCATCGTCAGCGCCTCCTCATTGCCCATGTCTATCATTATCGTCGGTGTAGGACCAGCCATGTTTGAGGCAAT  1406
            |||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCCATCGTCAGTGCCTCCTCACTGCCCATGTCTATCATTATTGTCGGGGTCGGACCTGCCATGTTTGAGGCAAT  1406

Query 1407  GGAAGAGTTGGACGGTGATGATGTGCGCGTGTCCTCTAGGGGACGCTACGCAGAGCGGGACATCGTTCAG----  1476
            |||||||.||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||    
Sbjct 1407  GGAAGAGCTGGATGGTGATGATGTACGTGTATCCTCCAGGGGACGCTATGCAGAGCGGGACATCGTTCAGTTTG  1480

Query 1477  ---------GA-------------------------AGGTTGCTGCAGCCTTGGCACATCCG--TGG-------  1507
                     ||                         ||| ||||| || |.||||    |||  |||       
Sbjct 1481  TCCCATTCCGAGATTATGTTGACCGATCGGGGAACCAGG-TGCTG-AG-CATGGC----CCGACTGGCCAAGGA  1547

Query 1508  TG------------------------------------------------------------------------  1509
            ||                                                                        
Sbjct 1548  TGTACTAGCTGAGATTCCTGAACAGTTGCTCTCCTATATGCGCACCAGGGACATCCAGCCTCGACCTCCTCCCC  1621

Query 1510  --------------------------------------  1509
                                                  
Sbjct 1622  CTGCGAGCCCCAACCCAACCCCAGCCCCAGAACAGCCC  1659