Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13280
- Subject:
- XM_011241277.2
- Aligned Length:
- 1666
- Identities:
- 1040
- Gaps:
- 533
Alignment
Query 1 ATGTCTCTCGGCGGAGCCTCCGAGCGCAGCGTCCCGGCCACCAAGATTGAAATTACCGTGTCCTGCCGGAACCT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GCTAGACCTTGATACCTTCTCCAAGTCCGACCCCATGGTGGTGCTTTACACGCAGAGCCGGGCCAGCCAGGAGT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GGCGGGAGTTCGGACGGACCGAGGTGATTGATAACACGCTGAACCCAGACTTCGTGCGCAAATTCGTCCTCGAC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TATTTCTTTGAGGAAAAGCAAAATCTGCGCTTCGATGTGTACAACGTGGACTCCAAAACCAACATCTCCAAACC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GAAGGATTTCCTGGGACAAGCGTTCCTGGCCCTGGGAGAGGTGATTGGAGGCCAGGGCAGCCGAGTAGAGCGAA 370
|.
Sbjct 1 ------------------------------------------------------------------------AT 2
Query 371 CCCTCACGGGTGTACCAGGCAAGAAGTGTGGGACCATATTGCTGACTGCAGAAGAGCTTAGCAATTGTCGGGAC 444
.||| |.||||||.|||||.||||||||||||||||||.|||||||.||.||.|||||.|||||.||..|||||
Sbjct 3 GCCT-AGGGGTGTGCCAGGAAAGAAGTGTGGGACCATACTGCTGACCGCCGAGGAGCTGAGCAACTGCAGGGAC 75
Query 445 ATTGCCACCATGCAGCTGTGTGCAAACAAGCTGGACAAGAAGGACTTCTTTGGGAAATCAGACCCCTTCCTTGT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 76 ATTGCCACCATGCAGCTGTGTGCAAACAAGCTGGACAAAAAGGACTTCTTTGGGAAGTCAGACCCTTTCCTTGT 149
Query 519 GTTCTACAGGAGCAATGAGGATGGCACGTTCACCATCTGCCACAAGACAGAGGTTGTGAAAAACACGCTGAATC 592
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 150 GTTCTACAGGAGCAATGAAGATGGCACGTTCACCATCTGCCACAAGACAGAGGTTGTGAAAAACACACTGAACC 223
Query 593 CTGTGTGGCAGCCCTTCAGCATCCCTGTGCGGGCTCTGTGCAATGGAGACTATGACAGAACGGTGAAGATTGAT 666
|.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct 224 CAGTATGGCAGCCCTTCAGCATCCCTGTGCGGGCACTGTGCAACGGAGACTATGACAGAACAGTGAAGATCGAC 297
Query 667 GTGTACGACTGGGACCGGGATGGAAGCCACGATTTCATTGGTGAGTTCACCACCAGCTACCGGGAGCTGAGCAA 740
||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 298 GTATATGACTGGGACCGAGATGGAAGCCACGACTTCATTGGCGAGTTCACAACCAGCTACCGGGAGCTGAGCAA 371
Query 741 GGCCCAGAACCAGTTCACAGTATATGAGGTTCTTAACCCTCGGAAGAAATGTAAGAAGAAGAAATATGTCAACT 814
|||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||..|||||
Sbjct 372 GGCCCAGAATCAGTTCACAGTGTACGAGGTACTTAACCCTCGGAAGAAATGCAAGAAGAAGAAATATACCAACT 445
Query 815 CAGGAACTGTGACGCTGCTCTCCTTCTCTGTGGACTCTGAATTCACTTTTGTTGATTACATCAAGGGAGGGACA 888
|.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 446 CGGGGACCGTGACGCTCCTTTCCTTCTCTGTGGACTCAGAATTCACTTTTGTGGATTACATCAAGGGAGGGACA 519
Query 889 CAGCTGAACTTCACAGTAGCCATTGACTTCACGGCTTCCAATGGGAATCCTCTGCAGCCTACCTCCCTGCACTA 962
||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct 520 CAGCTGAACTTCACCGTAGCTATTGACTTCACTGCTTCCAATGGGAATCCCCTGCAGCCTACGTCGCTGCACTA 593
Query 963 CATGAGTCCCTACCAGCTCAGCGCCTATGCCATGGCCCTCAAGGCAGTGGGAGAGATCATCCAGGACTATGACA 1036
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 594 CATGAGTCCCTACCAGCTCAGCGCCTATGCCATGGCCCTCAAGGCAGTGGGAGAGATCATCCAGGACTACGACA 667
Query 1037 GTGATAAGCTCTTCCCAGCTTATGGCTTTGGGGCCAAGCTGCCCCCAGAGGGACGGATCTCCCACCAGTTCCCC 1110
||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 668 GTGACAAGCTCTTCCCAGCCTATGGTTTTGGGGCCAAGCTGCCCCCAGAGGGGCGGATCTCCCACCAGTTCCCC 741
Query 1111 CTGAACAACAATGATGAGGACCCCAACTGTGCGGGCATCGAGGGTGTGCTGGAGAGCTATTTCCAGAGCCTGCG 1184
||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 742 CTGAACAATAACGATGAAGACCCCAACTGTGCAGGCATTGAGGGTGTGCTAGAGAGTTACTTCCAGAGTCTGCG 815
Query 1185 CACAGTGCAGCTCTATGGGCCCACCTACTTTGCTCCTGTCATCAACCAAGTGGCCAGGGCTGCAGCCAAGATCT 1258
||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 816 CACAGTGCAGCTCTATGGGCCCACTTACTTTGCACCTGTCATCAACCAGGTGGCCAGGGCTGCAGCCAAAATCT 889
Query 1259 CTGATGGCTCCCAGTACTATGTTCTGCTCATCATCACTGATGGGGTCATCTCTGACATGACGCAGACCAAGGAG 1332
|.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 890 CGGATGGTTCCCAGTACTACGTTCTGCTCATTATCACTGACGGCGTCATCTCCGACATGACACAGACCAAAGAG 963
Query 1333 GCCATCGTCAGCGCCTCCTCATTGCCCATGTCTATCATTATCGTCGGTGTAGGACCAGCCATGTTTGAGGCAAT 1406
|||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 964 GCCATCGTCAGTGCCTCCTCACTGCCCATGTCTATCATTATTGTCGGGGTCGGACCTGCCATGTTTGAGGCAAT 1037
Query 1407 GGAAGAGTTGGACGGTGATGATGTGCGCGTGTCCTCTAGGGGACGCTACGCAGAGCGGGACATCGTTCAG---- 1476
|||||||.||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1038 GGAAGAGCTGGATGGTGATGATGTACGTGTATCCTCCAGGGGACGCTATGCAGAGCGGGACATCGTTCAGTTTG 1111
Query 1477 ---------GA-------------------------AGGTTGCTGCAGCCTTGGCACATCCG--TGG------- 1507
|| ||| ||||| || |.|||| ||| |||
Sbjct 1112 TCCCATTCCGAGATTATGTTGACCGATCGGGGAACCAGG-TGCTG-AG-CATGGC----CCGACTGGCCAAGGA 1178
Query 1508 TG------------------------------------------------------------------------ 1509
||
Sbjct 1179 TGTACTAGCTGAGATTCCTGAACAGTTGCTCTCCTATATGCGCACCAGGGACATCCAGCCTCGACCTCCTCCCC 1252
Query 1510 -------------------------------------- 1509
Sbjct 1253 CTGCGAGCCCCAACCCAACCCCAGCCCCAGAACAGCCC 1290
