Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13280
• Subject: XM_011533386.2
• Aligned Length: 1994
• Identities: 1479
• Gaps: 493

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGACAGGGCGAGTAGCTGGTGGGATCGAGAAGCGGGGGGTCTTGGGCAGCCCCACCCCGAAAAAAGGGCTCAG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCTGCGGGTTCAGGGGGTGGGTCGCAGATATCCGGTAGGAGCTCGGCCCCAGGAGGACAAAGTTCTGGGGCGAG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CCCTCTTTCCTGGGCCCTTGGAGACAGTGTGGGTGCGTTCGCGTCCAGTCCGCAGAGCCATGGTTCCTGGACAG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CGATTTCCGGTGCTGTCCAGAGTGCTGACAGAGCGGACCCCGGCTGGGGGTAGCCATGGGGGACAGAGGTTCGA  296

Query    1  ----------ATGTCTCTCGGCGGAGC----CTCCGAG------CGCAGCGTCCCGGCCACCAAGATTGAAATT  54
                      |||.|||||..|.|.||    |||.|||      ||..||| ..|||.|.|||.|| |||   |
Sbjct  297  TGCGGGCCCCATGCCTCTCCTCAGTGCCCGGCTCAGAGCCGACTCGAGGCG-GGCGGACTCCAGGA-TGA---T  365

Query   55  --ACCGTGTCCTGCC---------------GGAACCTGCTAGACCTTGATACCTTCTCCAAGTCCGACCCCATG  111
              ||..||| |||.|               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  366  CCACTCTGT-CTGTCTGTTGCTTTTCTCTAGGAACCTGCTAGACCTTGATACCTTCTCCAAGTCCGACCCCATG  438

Query  112  GTGGTGCTTTACACGCAGAGCCGGGCCAGCCAGGAGTGGCGGGAGTTCGGACGGACCGAGGTGATTGATAACAC  185
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  439  GTGGTGCTTTACACGCAGAGCCGGGCCAGCCAGGAGTGGCGGGAGTTCGGACGGACCGAGGTGATTGATAACAC  512

Query  186  GCTGAACCCAGACTTCGTGCGCAAATTCGTCCTCGACTATTTCTTTGAGGAAAAGCAAAATCTGCGCTTCGATG  259
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  513  GCTGAACCCAGACTTCGTGCGCAAATTCGTCCTCGACTATTTCTTTGAGGAAAAGCAAAATCTGCGCTTCGATG  586

Query  260  TGTACAACGTGGACTCCAAAACCAACATCTCCAAACCGAAGGATTTCCTGGGACAAGCGTTCCTGGCCCTGGGA  333
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  587  TGTACAACGTGGACTCCAAAACCAACATCTCCAAACCGAAGGATTTCCTGGGACAAGCGTTCCTGGCCCTGGGA  660

Query  334  GAGGTGATTGGAGGCCAGGGCAGCCGAGTAGAGCGAACCCTCACGGGTGTACCAGGCAAGAAGTGTGGGACCAT  407
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  GAGGTGATTGGAGGCCAGGGCAGCCGAGTAGAGCGAACCCTCACGGGTGTACCAGGCAAGAAGTGTGGGACCAT  734

Query  408  ATTGCTGACTGCAGAAGAGCTTAGCAATTGTCGGGACATTGCCACCATGCAGCTGTGTGCAAACAAGCTGGACA  481
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  735  ATTGCTGACTGCAGAAGAGCTTAGCAATTGTCGGGACATTGCCACCATGCAGCTGTGTGCAAACAAGCTGGACA  808

Query  482  AGAAGGACTTCTTTGGGAAATCAGACCCCTTCCTTGTGTTCTACAGGAGCAATGAGGATGGCACGTTCACCATC  555
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  809  AGAAGGACTTCTTTGGGAAATCAGACCCCTTCCTTGTGTTCTACAGGAGCAATGAGGATGGCACGTTCACCATC  882

Query  556  TGCCACAAGACAGAGGTTGTGAAAAACACGCTGAATCCTGTGTGGCAGCCCTTCAGCATCCCTGTGCGGGCTCT  629
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  TGCCACAAGACAGAGGTTGTGAAAAACACGCTGAATCCTGTGTGGCAGCCCTTCAGCATCCCTGTGCGGGCTCT  956

Query  630  GTGCAATGGAGACTATGACAGAACGGTGAAGATTGATGTGTACGACTGGGACCGGGATGGAAGCCACGATTTCA  703
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  GTGCAATGGAGACTATGACAGAACGGTGAAGATTGATGTGTACGACTGGGACCGGGATGGAAGCCACGATTTCA  1030

Query  704  TTGGTGAGTTCACCACCAGCTACCGGGAGCTGAGCAAGGCCCAGAACCAGTTCACAGTATATGAGGTTCTTAAC  777
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031  TTGGTGAGTTCACCACCAGCTACCGGGAGCTGAGCAAGGCCCAGAACCAGTTCACAGTATATGAGGTTCTTAAC  1104

Query  778  CCTCGGAAGAAATGTAAGAAGAAGAAATATGTCAACTCAGGAACTGTGACGCTGCTCTCCTTCTCTGTGGACTC  851
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105  CCTCGGAAGAAATGTAAGAAGAAGAAATATGTCAACTCAGGAACTGTGACGCTGCTCTCCTTCTCTGTGGACTC  1178

Query  852  TGAATTCACTTTTGTTGATTACATCAAGGGAGGGACACAGCTGAACTTCACAGTAGCCATTGACTTCACGGCTT  925
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179  TGAATTCACTTTTGTTGATTACATCAAGGGAGGGACACAGCTGAACTTCACAGTAGCCATTGACTTCACGGCTT  1252

Query  926  CCAATGGGAATCCTCTGCAGCCTACCTCCCTGCACTACATGAGTCCCTACCAGCTCAGCGCCTATGCCATGGCC  999
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253  CCAATGGGAATCCTCTGCAGCCTACCTCCCTGCACTACATGAGTCCCTACCAGCTCAGCGCCTATGCCATGGCC  1326

Query 1000  CTCAAGGCAGTGGGAGAGATCATCCAGGACTATGACAGTGATAAGCTCTTCCCAGCTTATGGCTTTGGGGCCAA  1073
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327  CTCAAGGCAGTGGGAGAGATCATCCAGGACTATGACAGTGATAAGCTCTTCCCAGCTTATGGCTTTGGGGCCAA  1400

Query 1074  GCTGCCCCCAGAGGGACGGATCTCCCACCAGTTCCCCCTGAACAACAATGATGAGGACCCCAACTGTGCGGGCA  1147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401  GCTGCCCCCAGAGGGACGGATCTCCCACCAGTTCCCCCTGAACAACAATGATGAGGACCCCAACTGTGCGGGCA  1474

Query 1148  TCGAGGGTGTGCTGGAGAGCTATTTCCAGAGCCTGCGCACAGTGCAGCTCTATGGGCCCACCTACTTTGCTCCT  1221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1475  TCGAGGGTGTGCTGGAGAGCTATTTCCAGAGCCTGCGCACAGTGCAGCTCTATGGGCCCACCTACTTTGCTCCT  1548

Query 1222  GTCATCAACCAAGTGGCCAGGGCTGCAGCCAAGATCTCTGATGGCTCCCAGTACTATGTTCTGCTCATCATCAC  1295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1549  GTCATCAACCAAGTGGCCAGGGCTGCAGCCAAGATCTCTGATGGCTCCCAGTACTATGTTCTGCTCATCATCAC  1622

Query 1296  TGATGGGGTCATCTCTGACATGACGCAGACCAAGGAGGCCATCGTCAGCGCCTCCTCATTGCCCATGTCTATCA  1369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1623  TGATGGGGTCATCTCTGACATGACGCAGACCAAGGAGGCCATCGTCAGCGCCTCCTCATTGCCCATGTCTATCA  1696

Query 1370  TTATCGTCGGTGTAGGACCAGCCATGTTTGAGGCAATGGAAGAGTTGGACGGTGATGATGTGCGCGTGTCCTCT  1443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1697  TTATCGTCGGTGTAGGACCAGCCATGTTTGAGGCAATGGAAGAGTTGGACGGTGATGATGTGCGCGTGTCCTCT  1770

Query 1444  AGGGGACGCTACGCAGAGCGGGACATCGTTCAG-------------GA----AGGTTG-CTG----------CA  1489
            |||||||||||||||||||||||||||||||||             ||    |.|||| |.|          ||
Sbjct 1771  AGGGGACGCTACGCAGAGCGGGACATCGTTCAGTTCGTCCCATTCCGAGACTATGTTGACCGGTCGGGGAACCA  1844

Query 1490  G-------CCTTGGCAC------------ATCCGTGGTG-----------------------------------  1509
            |       .|.||||.|            ||  |||.||                                   
Sbjct 1845  GGTGTTGAGCATGGCCCGACTGGCCAAGGAT--GTGCTGGCCGAGATCCCGGAGCAGCTGCTGTCCTATATGCG  1916

Query 1510  ----------------------------------------------------------------------  1509
                                                                                  
Sbjct 1917  CACCAGAGACATCCAGCCTCGGCCCCCACCCCCTGCCAACCCCAGCCCGATCCCAGCTCCAGAGCAGCCC  1986