Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13280
- Subject:
- XR_001740032.1
- Aligned Length:
- 1862
- Identities:
- 1309
- Gaps:
- 537
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 TGGCTGGAAAATCACAGCTGATGACAGGGCGAGTAGCTGGTGGGATCGAGAAGCGGGGGGTCTTGGGCAGCCCC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 ACCCCGAAAAAAGGGCTCAGCCTGCGGGTTCAGGGGGTGGGTCGCAGATATCCGGTAGGAGCTCGGCCCCAGGA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GGACAAAGTTCTGGGGCGAGCCCTCTTTCCTGGGCCCTTGGAGACAGTGTGGGTGCGTTCGCGTCCAGTCCGCA 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GAGCCATGGTTCCTGGACAGCGATTTCCGGTGCTGTCCAGAGTGCTGACAGAGCGGACCCCGGCTGGGGGTAGC 296
Query 1 ------------------------------ATGTCTCTCGGCGGAGC----CTCCGAG------CGCAGCGTCC 34
|||.|||||..|.|.|| |||.||| ||..||| ..
Sbjct 297 CATGGGGGACAGAGGTTCGATGCGGGCCCCATGCCTCTCCTCAGTGCCCGGCTCAGAGCCGACTCGAGGCG-GG 369
Query 35 CGGCCACCAAGATTGAAATT--ACCGTGTCCTGCC---------------GGAACCTGCTAGACCTTGATACCT 91
|||.|.|||.|| ||| | ||..||| |||.| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 CGGACTCCAGGA-TGA---TCCACTCTGT-CTGTCTGTTGCTTTTCTCTAGGAACCTGCTAGACCTTGATACCT 438
Query 92 TCTCCAAGTCCGACCCCATGGTGGTGCTTTACACGCAGAGCCGGGCCAGCCAGGAGTGGCGGGAGTTCGGACGG 165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439 TCTCCAAGTCCGACCCCATGGTGGTGCTTTACACGCAGAGCCGGGCCAGCCAGGAGTGGCGGGAGTTCGGACGG 512
Query 166 ACCGAGGTGATTGATAACACGCTGAACCCAGACTTCGTGCGCAAATTCGTCCTCGACTATTTCTTTGAGGAAAA 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 513 ACCGAGGTGATTGATAACACGCTGAACCCAGACTTCGTGCGCAAATTCGTCCTCGACTATTTCTTTGAGGAAAA 586
Query 240 GCAAAATCTGCGCTTCGATGTGTACAACGTGGACTCCAAAACCAACATCTCCAAACCGAAGGATTTCCTGGGAC 313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 587 GCAAAATCTGCGCTTCGATGTGTACAACGTGGACTCCAAAACCAACATCTCCAAACCGAAGGATTTCCTGGGAC 660
Query 314 AAGCGTTCCTGGCCCTGGGAGAGGTGATTGGAGGCCAGGGCAGCCGAGTAGAGCGAACCCTCACGGGTGTACCA 387
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 AAGCGTTCCTGGCCCTGGGAGAGGTGATTGGAGGCCAGGGCAGCCGAGTAGAGCGAACCCTCACGGGTGTACCA 734
Query 388 GGCAAGAAGTGTGGGACCATATTGCTGACTGCAGAAGAGCTTAGCAATTGTCGGGACATTGCCACCATGCAGCT 461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 735 GGCAAGAAGTGTGGGACCATATTGCTGACTGCAGAAGAGCTTAGCAATTGTCGGGACATTGCCACCATGCAGCT 808
Query 462 GTGTGCAAACAAGCTGGACAAGAAGGACTTCTTTGGGAAATCAGACCCCTTCCTTGTGTTCTACAGGAGCAATG 535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 809 GTGTGCAAACAAGCTGGACAAGAAGGACTTCTTTGGGAAATCAGACCCCTTCCTTGTGTTCTACAGGAGCAATG 882
Query 536 AGGATGGCACGTTCACCATCTGCCACAAGACAGAGGTTGTGAAAAACACGCTGAATCCTGTGTGGCAGCCCTTC 609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 883 AGGATGGCACGTTCACCATCTGCCACAAGACAGAGGTTGTGAAAAACACGCTGAATCCTGTGTGGCAGCCCTTC 956
Query 610 AGCATCCCTGTGCGGGCTCTGTGCAATGGAGACTATGACAGAACGGTGAAGATTGATGTGTACGACTGGGACCG 683
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 957 AGCATCCCTGTGCGGGCTCTGTGCAATGGAGACTATGACAGAACGGTGAAGATTGATGTGTACGACTGGGACCG 1030
Query 684 GGATGGAAGCCACGATTTCATTGGTGAGTTCACCACCAGCTACCGGGAGCTGAGCAAGGCCCAGAACCAGTTCA 757
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031 GGATGGAAGCCACGATTTCATTGGTGAGTTCACCACCAGCTACCGGGAGCTGAGCAAGGCCCAGAACCAGTTCA 1104
Query 758 CAGTATATGAGGTTCTTAACCCTCGGAAGAAATGTAAGAAGAAGAAATATGTCAACTCAGGAACTGTGACGCTG 831
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105 CAGTATATGAGGTTCTTAACCCTCGGAAGAAATGTAAGAAGAAGAAATATGTCAACTCAGGAACT--------- 1169
Query 832 CTCTCCTTCTCTGTGGACTCTGAATTCACTTTTGTTGATTACATCAAGGGAGGGACACAGCTGAACTTCACAGT 905
|||||||||||||||||||||
Sbjct 1170 -----------------------------------------------------GACACAGCTGAACTTCACAGT 1190
Query 906 AGCCATTGACTTCACGGCTTCCAATGGGAATCCTCTGCAGCCTACCTCCCTGCACTACATGAGTCCCTACCAGC 979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1191 AGCCATTGACTTCACGGCTTCCAATGGGAATCCTCTGCAGCCTACCTCCCTGCACTACATGAGTCCCTACCAGC 1264
Query 980 TCAGCGCCTATGCCATGGCCCTCAAGGCAGTGGGAGAGATCATCCAGGACTATGACAGTGATAAGCTCTTCCCA 1053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1265 TCAGCGCCTATGCCATGGCCCTCAAGGCAGTGGGAGAGATCATCCAGGACTATGACAGTGATAAGCTCTTCCCA 1338
Query 1054 GCTTATGGCTTTGGGGCCAAGCTGCCCCCAGAGGGACGGATCTCCCACCAGTTCCCCCTGAACAACAATGATGA 1127
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1339 GCTTATGGCTTTGGGGCCAAGCTGCCCCCAGAGGGACGGATCTCCCACCAGTTCCCCCTGAACAACAATGATGA 1412
Query 1128 GGACCCCAACTGTGCGGGCATCGAGGGTGTGCTGGAGAGCTATTTCCAGAGCCTGCGCACAGTGCAGCTCTATG 1201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1413 GGACCCCAACTGTGCGGGCATCGAGGGTGTGCTGGAGAGCTATTTCCAGAGCCTGCGCACAGTGCAGCTCTATG 1486
Query 1202 GGCCCACCTACTTTGCTCCTGTCATCAACCAAGTGGCCAGGGCTGCAGCCAAGATCTCTGATGGCTCCCAGTAC 1275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1487 GGCCCACCTACTTTGCTCCTGTCATCAACCAAGTGGCCAGGGCTGCAGCCAAGATCTCTGATGGCTCCCAGTAC 1560
Query 1276 TATGTTCTGCTCATCATCACTGATGGGGTCATCTCTGACATGACGCAGACCAAGGAGGCCATCGTCAGCGCCTC 1349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 TATGTTCTGCTCATCATCACTGATGGGGTCATCTCTGACATGACGCAGACCAAGGAGGCCATCGTCAGCGCCTC 1634
Query 1350 CTCATTGCCCATGTCTATCATTATCGTCGGTGTAGGACCAGCCATGTTTGAGGCAATGGAAGAGTTGGACGGTG 1423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1635 CTCATTGCCCATGTCTATCATTATCGTCGGTGTAGGACCAGCCA------------------------------ 1678
Query 1424 ATGATGTGCGCGTGTCCTCTAGGGGACGCTACGCAGAGCGGGACATCGTTCAGGAAGGTTGCTGCAGCCTTGGC 1497
Sbjct 1679 -------------------------------------------------------------------------- 1678
Query 1498 ACATCCGTGGTG 1509
Sbjct 1679 ------------ 1678
