Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13283
• Subject: NM_152531.5
• Aligned Length: 1179
• Identities: 1140
• Gaps: 39

Alignment

Query    1  ---------------------------------------ATGGCGCGCCTGGGCGCTGTGCGCTCCCACTACTG  35
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCCTCCTCCGAGGCGGGCTCCCATGCGCTCGGGCCATGGCGCGCCTGGGCGCTGTGCGCTCCCACTACTG  74

Query   36  CGCCCTGCTGCTGGCCGCGGCGCTGGCCGTCTGCGCCTTCTACTACCTCGGCTCAGGCCGGGAGACCTTCTCCA  109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGCCCTGCTGCTGGCCGCGGCGCTGGCCGTCTGCGCCTTCTACTACCTCGGCTCAGGCCGGGAGACCTTCTCCA  148

Query  110  GCGCCACCAAGAGGCTGAAGGAGGCCCGCGCCGGGGCTCCCGCCGCGCCCTCGCCGCCCGCGCTGGAGCTAGCG  183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCGCCACCAAGAGGCTGAAGGAGGCCCGCGCCGGGGCTCCCGCCGCGCCCTCGCCGCCCGCGCTGGAGCTAGCG  222

Query  184  CGGGGCTCCGTGGCGCCAGCCCCCGGCGCGAAGGCCAAGAGCTTGGAGGGCGGCGGTGCCGGGCCGGTGGACTA  257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGGGCTCCGTGGCGCCAGCCCCCGGCGCGAAGGCCAAGAGCTTGGAGGGCGGCGGTGCCGGGCCGGTGGACTA  296

Query  258  CCACCTGCTGATGATGTTCACCAAGGCGGAGCACAATGCCGCGCTGCAGGCCAAGGCCCGCGTCGCGCTGCGCT  331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCACCTGCTGATGATGTTCACCAAGGCGGAGCACAATGCCGCGCTGCAGGCCAAGGCCCGCGTCGCGCTGCGCT  370

Query  332  CACTGCTGCGCCTCGCCAAGTTCGAGGCGCACGAGGTGCTTAACCTTCACTTCGTGAGCGAGGAGGCCAGCCGC  405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CACTGCTGCGCCTCGCCAAGTTCGAGGCGCACGAGGTGCTTAACCTTCACTTCGTGAGCGAGGAGGCCAGCCGC  444

Query  406  GAGGTGGCCAAGGGCCTGCTGCGGGAGCTCCTGCCGCCCGCCGCTGGCTTCAAGTGCAAGGTCATCTTCCACGA  479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGGTGGCCAAGGGCCTGCTGCGGGAGCTCCTGCCGCCCGCCGCTGGCTTCAAGTGCAAGGTCATCTTCCACGA  518

Query  480  TGTTGCTGTGCTGACGGATAAGCTCTTCCCCATCGTGGAGGCCATGCAGAAGCACTTCAGTGCTGGCTTGGGAA  553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTTGCTGTGCTGACGGATAAGCTCTTCCCCATCGTGGAGGCCATGCAGAAGCACTTCAGTGCTGGCTTGGGAA  592

Query  554  CCTACTACAGTGACTCCATCTTCTTCCTCTCGGTCGCCATGCATCAGATCATGCCCAAAGAGATCCTGCAGATC  627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCTACTACAGTGACTCCATCTTCTTCCTCTCGGTCGCCATGCATCAGATCATGCCCAAAGAGATCCTGCAGATC  666

Query  628  ATTCAGCTGGACCTAGACCTGAAGTTTAAGACCAACATCCGGGAGTTGTTTGAGGAATTTGACAGTTTCCTGCC  701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTCAGCTGGACCTAGACCTGAAGTTTAAGACCAACATCCGGGAGTTGTTTGAGGAATTTGACAGTTTCCTGCC  740

Query  702  AGGCGCCATCATCGGCATAGCCCGGGAGATGCAGCCAGTTTACAGGCACACATTCTGGCAGTTCCGCCATGAGA  775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGCGCCATCATCGGCATAGCCCGGGAGATGCAGCCAGTTTACAGGCACACATTCTGGCAGTTCCGCCATGAGA  814

Query  776  ACCCCCAGACCCGGGTTGGGGGCCCGCCCCCCGAGGGGCTGCCGGGCTTCAACAGCGGGGTGATGTTGCTGAAC  849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCCCCAGACCCGGGTTGGGGGCCCGCCCCCCGAGGGGCTGCCGGGCTTCAACAGCGGGGTGATGTTGCTGAAC  888

Query  850  CTGGAGGCCATGCGCCAGTCCCCGCTCTACAGCCGCCTGCTGGAGCCGGCGCAGGTGCAGCAGCTGGCCGACAA  923
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGGAGGCCATGCGCCAGTCCCCGCTCTACAGCCGCCTGCTGGAGCCGGCGCAGGTGCAGCAGCTGGCCGACAA  962

Query  924  GTACCACTTCCGCGGCCACCTCGGGGACCAGGACTTCTTCACCATGATCGGCATGGAGCACCCCAAGCTCTTCC  997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTACCACTTCCGCGGCCACCTCGGGGACCAGGACTTCTTCACCATGATCGGCATGGAGCACCCCAAGCTCTTCC  1036

Query  998  ATGTGCTGGACTGTACCTGGAACCGGCAGCTGTGCACCTGGTGGAGGGACCATGGCTACAGTGACGTCTTCGAG  1071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGTGCTGGACTGTACCTGGAACCGGCAGCTGTGCACCTGGTGGAGGGACCATGGCTACAGTGACGTCTTCGAG  1110

Query 1072  GCCTATTTCAGGTGTGAGGGCCACGTCAAGATCTACCACGGGAACTGCAACACTCCCATCCCGGAGGAC  1140
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCTATTTCAGGTGTGAGGGCCACGTCAAGATCTACCACGGGAACTGCAACACTCCCATCCCGGAGGAC  1179