Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13287
• Subject: NM_001206956.1
• Aligned Length: 2091
• Identities: 2087
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAAGAAAATGTCTTTTGGGAATGTAAAGCAAATGGAAGGCCTAAGCCTACATACAAGTGGCTAAAAAATGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAGAAAATGTCTTTTGGGAATGTAAAGCAAATGGAAGGCCTAAGCCTACATACAAGTGGCTAAAAAATGG  74

Query   75  CGAACCTCTGCTAACTCGGGATAGAATTCAAATTGAGCAAGGAACACTCAACATAACAATAGTGAACCTCTCAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGAACCTCTGCTAACTCGGGATAGAATTCAAATTGAGCAAGGAACACTCAACATAACAATAGTGAACCTCTCAG  148

Query  149  ATGCTGGCATGTATCAGTGTTTGGCAGAGAATAAACATGGAGTTATCTTTTCCAACGCAGAGCTTAGTGTTATA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGCTGGCATGTATCAGTGTTTGGCAGAGAATAAACATGGAGTTATCTTTTCCAACGCAGAGCTTAGTGTTATA  222

Query  223  GCTGTAGGTCCAGATTTTTCAAGAACACTCTTGAAAAGAGTAACTCTTGTCAAAGTGGGAGGTGAAGTTGTCAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTGTAGGTCCAGATTTTTCAAGAACACTCTTGAAAAGAGTAACTCTTGTCAAAGTGGGAGGTGAAGTTGTCAT  296

Query  297  TGAGTGTAAGCCAAAAGCGTCTCCAAAACCTGTTTACACCTGGAAGAAAGGAAGGGATATATTAAAAGAAAATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAGTGTAAGCCAAAAGCGTCTCCAAAACCTGTTTACACCTGGAAGAAAGGAAGGGATATATTAAAAGAAAATG  370

Query  371  AAAGAATTACCATTTCTGAAGATGGAAACCTCAGAATCATCAACGTTACTAAATCAGACGCTGGGAGTTATACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAAGAATTACCATTTCTGAAGATGGAAACCTCAGAATCATCAACGTTACTAAATCAGACGCTGGGAGTTATACC  444

Query  445  TGTATAGCCACTAACCATTTTGGAACTGCTAGCAGTACTGGAAACTTGGTAGTGAAAGATCCAACAAGGGTAAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGTATAGCCACTAACCATTTTGGAACTGCTAGCAGTACTGGAAACTTGGTAGTGAAAGATCCAACAAGGGTAAT  518

Query  519  GGTACCCCCTTCCAGTATGGATGTCACTGTTGGAGAGAGTATTGTTTTACCGTGCCAGGTAACGCATGATCACT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGTACCCCCTTCCAGTATGGATGTCACTGTTGGAGAGAGTATTGTTTTACCGTGCCAGGTAACGCATGATCACT  592

Query  593  CGCTAGACATCGTGTTTACTTGGTCATTTAATGGACACCTGATAGACTTTGACAGAGATGGGGACCACTTTGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CGCTAGACATCGTGTTTACTTGGTCATTTAATGGACACCTGATAGACTTTGACAGAGATGGGGACCACTTTGAA  666

Query  667  AGAGTTGGAGGGGATTCAGCTGGTGATTTGATGATCCGAAACATCCAACTGAAGCATGCTGGGAAATATGTCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGAGTTGGAGGGGATTCAGCTGGTGATTTGATGATCCGAAACATCCAACTGAAGCATGCTGGGAAATATGTCTG  740

Query  741  CATGGTCCAAACAAGTGTGGACAGGCTATCTGCTGCTGCAGACCTGATTGTAAGAGGTCCTCCAGGTCCCCCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATGGTCCAAACAAGTGTGGACAGGCTATCTGCTGCTGCAGACCTGATTGTAAGAGGTCCTCCAGGTCCCCCAG  814

Query  815  AGGCTGTGACAATAGACGAAATCACAGATACCACTGCTCAGCTCTCCTGGAGACCCGGGCCTGACAATCACAGC  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  815  AGGCTGTGACAATAGACGAAATCACAGATACCACTGCTCAGCTCTCCTGGAGACCCGGGCCTGACAACCACAGC  888

Query  889  CCCATCACCATGTATGTCATTCAAGCCAGGACTCCGTTCTCCGTGGGCTGGCAAGCAGTCAGTACAGTCCCAGA  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCCATCACCATGTATGTCATTCAAGCCAGGACTCCATTCTCCGTGGGCTGGCAAGCAGTCAGTACAGTCCCAGA  962

Query  963  ACTCATTGATGGGAAGACATTCACAGCGACCGTGGTGGGTTTGAACCCTTGGGTTGAATATGAATTCCGCACAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACTCATTGATGGGAAGACATTCACAGCGACCGTGGTGGGTTTGAACCCTTGGGTTGAATATGAATTCCGCACAG  1036

Query 1037  TTGCAGCCAACGTGATTGGGATTGGGGAGCCCAGCCGCCCCTCAGAGAAACGGAGAACAGAAGAAGCTCTCCCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGCAGCCAACGTGATTGGGATTGGGGAGCCCAGCCGCCCCTCAGAGAAACGGAGAACAGAAGAAGCTCTCCCC  1110

Query 1111  GAAGTCACACCAGCGAATGTCAGTGGTGGCGGAGGCAGCAAATCTGAACTGGTTATAACCTGGGAGACGGTCCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAAGTCACACCAGCGAATGTCAGTGGTGGCGGAGGCAGCAAATCTGAACTGGTTATAACCTGGGAGACGGTCCC  1184

Query 1185  TGAGGAATTACAGAATGGTCGTGGCTTTGGTTATGTGGTGGCCTTCCGGCCCTACGGTAAAATGATCTGGATGC  1258
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGAGGAATTACAGAATGGTCGAGGCTTTGGTTATGTGGTGGCCTTCCGGCCCTACGGTAAAATGATCTGGATGC  1258

Query 1259  TGACAGTGCTGGCCTCAGCTGACGCCTCTAGATACGTGTTCAGGAATGAGAGCGTGCACCCCTTCTCTCCCTTT  1332
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGACAGTGCTGGCCTCAGCTGATGCCTCTAGATACGTGTTCAGGAATGAGAGCGTGCACCCCTTCTCTCCCTTT  1332

Query 1333  GAGGTTAAAGTAGGTGTCTTCAACAACAAAGGAGAAGGCCCTTTCAGTCCCACCACGGTGGTGTATTCTGCAGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGGTTAAAGTAGGTGTCTTCAACAACAAAGGAGAAGGCCCTTTCAGTCCCACCACGGTGGTGTATTCTGCAGA  1406

Query 1407  AGAAGAACCCACCAAACCACCAGCCAGTATCTTTGCCAGAAGTCTTTCTGCCACAGATATTGAAGTTTTCTGGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGAAGAACCCACCAAACCACCAGCCAGTATCTTTGCCAGAAGTCTTTCTGCCACAGATATTGAAGTTTTCTGGG  1480

Query 1481  CCTCCCCACTGGAGAAGAATAGAGGACGAATACAAGGTTATGAGGTTAAATATTGGAGACATGAAGACAAAGAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCTCCCCACTGGAGAAGAATAGAGGACGAATACAAGGTTATGAGGTTAAATATTGGAGACATGAAGACAAAGAA  1554

Query 1555  GAAAATGCTAGAAAAATACGAACAGTTGGAAATCAGACATCAACAAAAATCACGAACTTAAAAGGCAGTGTGCT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAAAATGCTAGAAAAATACGAACAGTTGGAAATCAGACATCAACAAAAATCACGAACTTAAAAGGCAGTGTGCT  1628

Query 1629  GTATCACTTAGCTGTCAAGGCATATAATTCTGCTGGGACAGGCCCCTCTAGTGCAACAGTCAATGTGACAACCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GTATCACTTAGCTGTCAAGGCATATAATTCTGCTGGGACAGGCCCCTCTAGTGCAACAGTCAATGTGACAACCC  1702

Query 1703  GAAAGCCACCACCAAGTCAACCCCCCGGAAACATCATATGGAATTCATCAGACTCCAAAATTATCCTGAATTGG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GAAAGCCACCACCAAGTCAACCCCCCGGAAACATCATATGGAATTCATCAGACTCCAAAATTATCCTGAATTGG  1776

Query 1777  GATCAAGTGAAGGCCCTGGATAATGAGTCGGAAGTAAAAGGATACAAAGTCTTGTACAGATGGAACAGACAAAG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GATCAAGTGAAGGCCCTGGATAATGAGTCGGAAGTAAAAGGATACAAAGTCTTGTACAGATGGAACAGACAAAG  1850

Query 1851  CAGCACATCTGTCATTGAAACAAATAAAACATCGGTGGAGCTTTCTTTGCCTTTCGATGAAGATTATATAATAG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CAGCACATCTGTCATTGAAACAAATAAAACATCGGTGGAGCTTTCTTTGCCTTTCGATGAAGATTATATAATAG  1924

Query 1925  AAATTAAGCCATTCAGCGACGGAGGAGATGGCAGCAGCAGTGAACAAATTCGAATTCCAAAGATATCAAATGCC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AAATTAAGCCATTCAGCGACGGAGGAGATGGCAGCAGCAGTGAACAAATTCGAATTCCAAAGATATCAAATGCC  1998

Query 1999  TACGCGAGAGGATCTGGGGCTTCCACTTCGAATGCATGTACGCTGTCAGCCATCAGTACAATAATGATTTCCCT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TACGCGAGAGGATCTGGGGCTTCCACTTCGAATGCATGTACGCTGTCAGCCATCAGTACAATAATGATTTCCCT  2072

Query 2073  CACAGCTAGGTCCAGTTTA  2091
            |||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CACAGCTAGGTCCAGTTTA  2091