Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13293
- Subject:
- NM_152548.3
- Aligned Length:
- 1356
- Identities:
- 1241
- Gaps:
- 114
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCAATTACAATTCCTTGGTACATTGGCTTCCTCAGAAAAAAGAAAAAAATCACAGAGATTGTTTTTCAAAAA 74
Query 1 ----------------------------------------ATGAGTTCAGATACAAATGTAAACAAAAGTGCCT 34
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TATCAAATCTACAAAAAATAAAGCTGGAAAAGCAAGCATCATGAGTTCAGATACAAATGTAAACAAAAGTGCCT 148
Query 35 CTCCAACTGCGACTGCAGAGGAACAGCCAGTTGAACCTGATGGCCCCCTTCCTGGCTCAGACAATAACCAAGAA 108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTCCAACTGCGACTGCAGAGGAACAGCCAGTTGAACCTGATGGCCCCCTTCCTGGCTCAGACAATAACCAAGAA 222
Query 109 AAGAAAGTAAGATTATCTCCAGCCAAAATGTCAACCAAGAATTCTACAGATCTAGTTGAATATGTTGACAAGAG 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAGAAAGTAAGATTATCTCCAGCCAAAATGTCAACCAAGAATTCTACAGATCTAGTTGAATATGTTGACAAGAG 296
Query 183 TCATGCTTTTCTCCCCATCATTCCAAACACCCAGAGAGGTCAGCTAGAAGACAGACTGAACAACCAGGCGCGTA 256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCATGCTTTTCTCCCCATCATTCCAAACACCCAGAGAGGTCAGCTAGAAGACAGACTGAACAACCAGGCGCGTA 370
Query 257 CCATAGCTTTCCTTCTTGAACAAGCCTTCCGCATCAAGGAGGACATCTCTGCTTGCCTGCAGGGGACCCATGGC 330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCATAGCTTTCCTTCTTGAACAAGCCTTCCGCATCAAGGAGGACATCTCTGCTTGCCTGCAGGGGACCCATGGC 444
Query 331 TTTCGAAAAGAGGAATCGCTCGCCAGGAAGTTACTGGAAAGCCACATCCAGACCATCACCAGCATCGTCAAAAA 404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTCGAAAAGAGGAATCGCTCGCCAGGAAGTTACTGGAAAGCCACATCCAGACCATCACCAGCATCGTCAAAAA 518
Query 405 ACTCAGCCAAAATATTGAGATTTTAGAAGACCAAATAAGAGCTCGAGATCAGGCGGCCACAGGAACTAACTTTG 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ACTCAGCCAAAATATTGAGATTTTAGAAGACCAAATAAGAGCTCGAGATCAGGCGGCCACAGGAACTAACTTTG 592
Query 479 CAGTACACGAGATAAACATCAAACACCTACAAGGAGTTGGAGATCTTCGAGGAAGAGTAGCCAGATGTGATTCA 552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CAGTACACGAGATAAACATCAAACACCTACAAGGAGTTGGAGATCTTCGAGGAAGAGTAGCCAGATGTGATTCA 666
Query 553 AGCATTGTGAAGCTTTCTGGAGACATTCACTTATTCAGGCAAGAGCACCGGCAAATTGAGAAAGCCATTCAAGA 626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGCATTGTGAAGCTTTCTGGAGACATTCACTTATTCAGGCAAGAGCACCGGCAAATTGAGAAAGCCATTCAAGA 740
Query 627 ATTCGTGCCCGCCCTGGAAACTCTTTCCAAGAACTTGGACATGAAGGTGATGCAGCTCTTAGGAAAGATTGAAA 700
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 741 ATTCGTGCCCGCCCTGGAAACTCTTTCCAAGAACTTGGACATGAAGGTGATGCAGCTCTTAGGAAAGATAGAAA 814
Query 701 CTGCCAGTTCTGAGCAAACCTCGAATTTAAAGATGGTCCAGGGGGATTATCGCCACGAAATGAACCTTTTGGAA 774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTGCCAGTTCTGAGCAAACCTCGAATTTAAAGATGGTCCAGGGGGATTATCGCCACGAAATGAACCTTTTGGAA 888
Query 775 TTCAAATTTCATTCACTTTCAAGTAATCTGTACGAAGAAGTTGAGAATAATAAAAAATGGACAGAAAACCAATT 848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTCAAATTTCATTCACTTTCAAGTAATCTGTACGAAGAAGTTGAGAATAATAAAAAATGGACAGAAAACCAATT 962
Query 849 TCTCAAATATAGAAAAGACCACCTGGGCCATATAAATGAATGTCTGAAGGTCCTACAGGAGAAACTGGAAAAGT 922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TCTCAAATATAGAAAAGACCACCTGGGCCATATAAATGAATGTCTGAAGGTCCTACAGGAGAAACTGGAAAAGT 1036
Query 923 CTGAAAATAAAATGGAAGAAAAACTGCTGCAGCTTTCAAGCAAAGTAGAGAATTTCATTAACACACAGAAACAG 996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTGAAAATAAAATGGAAGAAAAACTGCTGCAGCTTTCAAGCAAAGTAGAGAATTTCATTAACACACAGAAACAG 1110
Query 997 GAAACACAACTAAGTAAAGTAAAGCATATGGAAAATAAATTGTCCAAAAAGATGGAACAAATGGAAAAGCAGAT 1070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAAACACAACTAAGTAAAGTAAAGCATATGGAAAATAAATTGTCCAAAAAGATGGAACAAATGGAAAAGCAGAT 1184
Query 1071 CTGGGGTGAATTAGAGACAATGCAGAATGAATATCAATCAGGATTTAAATCAATTCATGACTCTCTCAGCTCCC 1144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTGGGGTGAATTAGAGACAATGCAGAATGAATATCAATCAGGATTTAAATCAATTCATGACTCTCTCAGCTCCC 1258
Query 1145 TCCAACAAATACAGAAAACAAAGATGGATTTAGAGAAATATAAAGTACAGAAAGACCTAAAGAAATTACAGCGC 1218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCCAACAAATACAGAAAACAAAGATGGATTTAGAGAAATATAAAGTACAGAAAGACCTAAAGAAATTACAGCGC 1332
Query 1219 AAGATAGTGGAACTCCAGGAAGTA 1242
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AAGATAGTGGAACTCCAGGAAGTA 1356