Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13293
• Subject: XM_011543209.2
• Aligned Length: 1242
• Identities: 1067
• Gaps: 174

Alignment

Query    1  ATGAGTTCAGATACAAATGTAAACAAAAGTGCCTCTCCAACTGCGACTGCAGAGGAACAGCCAGTTGAACCTGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGGCCCCCTTCCTGGCTCAGACAATAACCAAGAAAAGAAAGTAAGATTATCTCCAGCCAAAATGTCAACCAAGA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATTCTACAGATCTAGTTGAATATGTTGACAAGAGTCATGCTTTTCTCCCCATCATTCCAAACACCCAGAGAGGT  222
                                 |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------ATG-----AAGAGTCATGCTTTTCTCCCCATCATTCCAAACACCCAGAGAGGT  48

Query  223  CAGCTAGAAGACAGACTGAACAACCAGGCGCGTACCATAGCTTTCCTTCTTGAACAAGCCTTCCGCATCAAGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   49  CAGCTAGAAGACAGACTGAACAACCAGGCGCGTACCATAGCTTTCCTTCTTGAACAAGCCTTCCGCATCAAGGA  122

Query  297  GGACATCTCTGCTTGCCTGCAGGGGACCCATGGCTTTCGAAAAGAGGAATCGCTCGCCAGGAAGTTACTGGAAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  123  GGACATCTCTGCTTGCCTGCAGGGGACCCATGGCTTTCGAAAAGAGGAATCGCTCGCCAGGAAGTTACTGGAAA  196

Query  371  GCCACATCCAGACCATCACCAGCATCGTCAAAAAACTCAGCCAAAATATTGAGATTTTAGAAGACCAAATAAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  197  GCCACATCCAGACCATCACCAGCATCGTCAAAAAACTCAGCCAAAATATTGAGATTTTAGAAGACCAAATAAGA  270

Query  445  GCTCGAGATCAGGCGGCCACAGGAACTAACTTTGCAGTACACGAGATAAACATCAAACACCTACAAGGAGTTGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  271  GCTCGAGATCAGGCGGCCACAGGAACTAACTTTGCAGTACACGAGATAAACATCAAACACCTACAAGGAGTTGG  344

Query  519  AGATCTTCGAGGAAGAGTAGCCAGATGTGATTCAAGCATTGTGAAGCTTTCTGGAGACATTCACTTATTCAGGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  345  AGATCTTCGAGGAAGAGTAGCCAGATGTGATTCAAGCATTGTGAAGCTTTCTGGAGACATTCACTTATTCAGGC  418

Query  593  AAGAGCACCGGCAAATTGAGAAAGCCATTCAAGAATTCGTGCCCGCCCTGGAAACTCTTTCCAAGAACTTGGAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  419  AAGAGCACCGGCAAATTGAGAAAGCCATTCAAGAATTCGTGCCCGCCCTGGAAACTCTTTCCAAGAACTTGGAC  492

Query  667  ATGAAGGTGATGCAGCTCTTAGGAAAGATTGAAACTGCCAGTTCTGAGCAAACCTCGAATTTAAAGATGGTCCA  740
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  493  ATGAAGGTGATGCAGCTCTTAGGAAAGATAGAAACTGCCAGTTCTGAGCAAACCTCGAATTTAAAGATGGTCCA  566

Query  741  GGGGGATTATCGCCACGAAATGAACCTTTTGGAATTCAAATTTCATTCACTTTCAAGTAATCTGTACGAAGAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  567  GGGGGATTATCGCCACGAAATGAACCTTTTGGAATTCAAATTTCATTCACTTTCAAGTAATCTGTACGAAGAAG  640

Query  815  TTGAGAATAATAAAAAATGGACAGAAAACCAATTTCTCAAATATAGAAAAGACCACCTGGGCCATATAAATGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  641  TTGAGAATAATAAAAAATGGACAGAAAACCAATTTCTCAAATATAGAAAAGACCACCTGGGCCATATAAATGAA  714

Query  889  TGTCTGAAGGTCCTACAGGAGAAACTGGAAAAGTCTGAAAATAAAATGGAAGAAAAACTGCTGCAGCTTTCAAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  715  TGTCTGAAGGTCCTACAGGAGAAACTGGAAAAGTCTGAAAATAAAATGGAAGAAAAACTGCTGCAGCTTTCAAG  788

Query  963  CAAAGTAGAGAATTTCATTAACACACAGAAACAGGAAACACAACTAAGTAAAGTAAAGCATATGGAAAATAAAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  789  CAAAGTAGAGAATTTCATTAACACACAGAAACAGGAAACACAACTAAGTAAAGTAAAGCATATGGAAAATAAAT  862

Query 1037  TGTCCAAAAAGATGGAACAAATGGAAAAGCAGATCTGGGGTGAATTAGAGACAATGCAGAATGAATATCAATCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  863  TGTCCAAAAAGATGGAACAAATGGAAAAGCAGATCTGGGGTGAATTAGAGACAATGCAGAATGAATATCAATCA  936

Query 1111  GGATTTAAATCAATTCATGACTCTCTCAGCTCCCTCCAACAAATACAGAAAACAAAGATGGATTTAGAGAAATA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  937  GGATTTAAATCAATTCATGACTCTCTCAGCTCCCTCCAACAAATACAGAAAACAAAGATGGATTTAGAGAAATA  1010

Query 1185  TAAAGTACAGAAAGACCTAAAGAAATTACAGCGCAAGATAGTGGAACTCCAGGAAGTA  1242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011  TAAAGTACAGAAAGACCTAAAGAAATTACAGCGCAAGATAGTGGAACTCCAGGAAGTA  1068