Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13397
• Subject: NM_001366902.1
• Aligned Length: 1555
• Identities: 1377
• Gaps: 158

Alignment

Query    1  ATGTCATACGGATCCATCGCCCGTGGAGGTGGCCTGGGGAGCCGTGGCCCTTTCGGGGGACCTTCGAGACAAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCATACGGATCCATCGCCCGTGGAGGTGGCCTGGGGAGCCGTGGCCCTTTCGGGGGACCTTCGAGACAAGG  74

Query   75  CTGTCAGCCCCTAGAGTGCGCTAGATGTTGGACCGAGTATGGAATCCGCCATTTCCCCTGCCCGTCGCCAGAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTGTCAGCCCCTAGAGTGCGCTAGATGTTGGACCGAGTATGGAATCCGCCATTTCCCCTGCCCGTCGCCAGAGA  148

Query  149  GCAAGCTGCAGAACCGCTGTGTGGGGAAGGACGGGGAAGGTGATCTGGGGCCAGCAGGCACGCCTATTGTCCCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAAGCTGCAGAACCGCTGTGTGGGGAAGGACGGGGAAGGTGATCTGGGGCCAGCAGGCACGCCTATTGTCCCA  222

Query  223  AGGGCCAGGAAGCGAGGGCCTGGGGTTGCCCCTGAAGGCAGCCGGATGCCGGAGCCCACCTCATCACCCACCAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGGGCCAGGAAGCGAGGGCCTGGGGTTGCCCCTGAAGGCAGCCGGATGCCGGAGCCCACCTCATCACCCACCAT  296

Query  297  TGGCCCGAGGAAGGACTCGGCTGCTGGGCCCCATGGCCGGATGGCGGGGCCCAGCACTACCCGGGCCAAGAAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGCCCGAGGAAGGACTCGGCTGCTGGGCCCCATGGCCGGATGGCGGGGCCCAGCACTACCCGGGCCAAGAAGA  370

Query  371  GGAAGCCCAACTTCTGCCCGCAGGAGACCGAGGTGCTGGTGTCCAAGGTGAGCAAGCACCACCAGCTGCTGTTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGAAGCCCAACTTCTGCCCGCAGGAGACCGAGGTGCTGGTGTCCAAGGTGAGCAAGCACCACCAGCTGCTGTTT  444

Query  445  GGCACGGGGCTGCTGAAGGCCGAGCCCACTCGCAGGTACCGCGTGTGGAGCCGCATCCTGCAGGCCGTGAATGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCACGGGGCTGCTGAAGGCCGAGCCCACTCGCAGGTACCGCGTGTGGAGCCGCATCCTGCAGGCCGTGAATGC  518

Query  519  GCTGGGCTACTGTCGCCGCGACGTTGTGGACCTGAAGCACAAGTGGCGGGACCTACGAGCCGTCGTGCGGCGCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGGGCTACTGTCGCCGCGACGTTGTGGACCTGAAGCACAAGTGGCGGGACCTACGAGCCGTCGTGCGGCGCA  592

Query  593  AGCTGGGCGACCTCCGGAAGGCGGCCCATGGCCCCAGCCCTGGTTCCGGCAAGCCCCAGGCCCTGGCTCTCACG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCTGGGCGACCTCCGGAAGGCGGCCCATGGCCCCAGCCCTGGTTCCGGCAAGCCCCAGGCCCTGGCTCTCACG  666

Query  667  CCCGTGGAGCAGGTGGTGGCCAAGACCTTCTCTTGCCAGGCCCTGCCCTCCGAGGGCTTCAGTCTGGAGCCGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCGTGGAGCAGGTGGTGGCCAAGACCTTCTCTTGCCAGGCCCTGCCCTCCGAGGGCTTCAGTCTGGAGCCGCC  740

Query  741  CAGAGCCACCCAGGTCGATCCGTGCAACCTCCAGGAGCTGTTCCAGGAGATGTCGGCCAACGTCTTCCGAATCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGAGCCACCCAGGTCGATCCGTGCAACCTCCAGGAGCTGTTCCAGGAGATGTCGGCCAACGTCTTCCGAATCA  814

Query  815  ACTCCAGTGTGACCTCCTTGGAGCGGAGCCTTCAGTCCTTAGGGACACCGAGTGACACGCAGGAGCTTCGGGAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACTCCAGTGTGACCTCCTTGGAGCGGAGCCTTCAGTCCTTAGGGACACCGAGTGACACGCAGGAGCTTCGGGAC  888

Query  889  AGCCTGCACACGGCACAGCAGGAGACCAACAAGACCATTGCAGCCAGCGCCAGCTCCGTGAAGCAGATGGCCGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCCTGCACACGGCACAGCAGGAGACCAACAAGACCATTGCAGCCAGCGCCAGCTCCGTGAAGCAGATGGCCGA  962

Query  963  GCTGCTGCGCAGCTCCTGCCCGCAGGAGCGTCTGCAGCAGGAGCGTCCTCAGCTGGACCGGCTGAAAACCCAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTGCTGCGCAGCTCCTGCCCGCAGGAGCGTCTGCAGCAGGAGCGTCCTCAGCTGGACCGGCTGAAAACCCAGC  1036

Query 1037  TCTCAGATGCCATTCAGTGCTATGGAGTGGTGCAGAAGAAAATTGCAGAAAAGTCCAGAGCGCTGCTTCCCATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCTCAGATGCCATTCAGTGCTATGGAGTGGTGCAGAAGAAAATTGCAGAAAAGTCCAGAGCGCTGCTTCCCATG  1110

Query 1111  GCGCAGAGGGGCAGTAAACAGCAGAGTCCCCAGGCCCCGTTTGCCGAGCTGGCTGATGATGAGAAGGTCTTTAA  1184
            ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCGCAGAGGGGCAGTAAA---CAGAGTCCCCAGGCCCCGTTTGCCGAGCTGGCTGATGATGAGAAGGTCTTTAA  1181

Query 1185  CGGGAGTGACAACATGTGGCAGGGCCAGGAGCAGGCGCTGCTCCCGGACATCACTGAAGAGGACCTGGAGGCCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  CGGGAGTGACAACATGTGGCAGGGCCAGGAGCAGGCGCTGCTCCCGGACATCACTGAAGAGGACCTGGAGGCCA  1255

Query 1259  TCCGGCTGCGGGAGGAGGCCATCCTGCAGATGGAGAGCAACTTGCTGGATGTGAATCAGATCATCAAGGACTTG  1332
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||                   |
Sbjct 1256  TCCGGCTGCGGGAGGAGGCCATCCTGCAGATGGAG---------------GTGA-------------------G  1295

Query 1333  GCCTCCATGGTGTCAGAGCAAG-GAG---AAGCTGTTGATAGTATTGAAGCCAGCCTTGAGGCTGCGTCCTCGC  1402
            ||     |||.||  |.||||| |.|   |  ||.|..|.|.|       |||  |.||||||||       |.
Sbjct 1296  GC-----TGGCGT--GGGCAAGCGTGCTCA--CTCTCCACACT-------CCA--CATGAGGCTG-------GG  1344

Query 1403  ATGCGGAGGCAGCCC----GCCAGCTCCTGGCTGGAGCCAGCCGGCACCAACTCCAGAGACACAAGATCAAGTG  1472
            |..|.|||| |||||    |||||  ||||            |.||||||                        
Sbjct 1345  AACCAGAGG-AGCCCAGGTGCCAG--CCTG------------CTGCACCA------------------------  1379

Query 1473  CTGCTT--CCTATCAGCTGGAGTCACTG---CCCTGCTTGTCATCATCATCATCATCGCCACCTCTGTCCGAAA  1541
            .|||||  ||| |.|.||||||...|||   |                                          
Sbjct 1380  TTGCTTGCCCT-TGACCTGGAGGGGCTGGAAC------------------------------------------  1410

Query 1542  G  1542
             
Sbjct 1411  -  1410