Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13397
• Subject: XM_017013176.1
• Aligned Length: 2007
• Identities: 1542
• Gaps: 465

Alignment

Query    1  ATGTCATACGGATCCATCGCCCGTGGAGGTGGCCTGGGGAGCCGTGGCCCTTTCGGGGGACCTTCGAGACAAGG  74
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Sbjct    1  ATGTCATACGGATCCATCGCCCGTGGAGGTGGCCTGGGGAGCCGTGGCCCTTTCGGGGGACCTTCGAGACAAGG  74

Query   75  CTGTCAGCCCCTAGAGTGCGCTAGATGTTGGACCGAGTATGGAATCCGCCATTTCCCCTGCCCGTCGCCAGAGA  148
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Sbjct   75  CTGTCAGCCCCTAGAGTGCGCTAGATGTTGGACCGAGTATGGAATCCGCCATTTCCCCTGCCCGTCGCCAGAGA  148

Query  149  GCAAGCTGCAGAACCGCTGTGTGGGGAAGGACGGGGAAGGTGATCTGGGGCCAGCAGGCACGCCTATTGTCCCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAAGCTGCAGAACCGCTGTGTGGGGAAGGACGGGGAAGGTGATCTGGGGCCAGCAGGCACGCCTATTGTCCCA  222

Query  223  AGGGCCAGGAAGCGAGGGCCTGGGGTTGCCCCTGAAGGCAGCCGGATGCCGGAGCCCACCTCATCACCCACCAT  296
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Sbjct  223  AGGGCCAGGAAGCGAGGGCCTGGGGTTGCCCCTGAAGGCAGCCGGATGCCGGAGCCCACCTCATCACCCACCAT  296

Query  297  TGGCCCGAGGAAGGACTCGGCTGCTGGGCCCCATGGCCGGATGGCGGGGCCCAGCACTACCCGGGCCAAGAAGA  370
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Sbjct  297  TGGCCCGAGGAAGGACTCGGCTGCTGGGCCCCATGGCCGGATGGCGGGGCCCAGCACTACCCGGGCCAAGAAGA  370

Query  371  GGAAGCCCAACTTCTGCCCGCAGGAGACCGAGGTGCTGGTGTCCAAGGTGAGCAAGCACCACCAGCTGCTGTTT  444
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Sbjct  371  GGAAGCCCAACTTCTGCCCGCAGGAGACCGAGGTGCTGGTGTCCAAGGTGAGCAAGCACCACCAGCTGCTGTTT  444

Query  445  GGCACGGGGCTGCTGAAGGCCGAGCCCACTCGCAGGTACCGCGTGTGGAGCCGCATCCTGCAGGCCGTGAATGC  518
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Sbjct  445  GGCACGGGGCTGCTGAAGGCCGAGCCCACTCGCAGGTACCGCGTGTGGAGCCGCATCCTGCAGGCCGTGAATGC  518

Query  519  GCTGGGCTACTGTCGCCGCGACGTTGTGGACCTGAAGCACAAGTGGCGGGACCTACGAGCCGTCGTGCGGCGCA  592
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Sbjct  519  GCTGGGCTACTGTCGCCGCGACGTTGTGGACCTGAAGCACAAGTGGCGGGACCTACGAGCCGTCGTGCGGCGCA  592

Query  593  AGCTGGGCGACCTCCGGAAGGCGGCCCATGGCCCCAGCCCTGGTTCCGGCAAGCCCCAGGCCCTGGCTCTCACG  666
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Sbjct  593  AGCTGGGCGACCTCCGGAAGGCGGCCCATGGCCCCAGCCCTGGTTCCGGCAAGCCCCAGGCCCTGGCTCTCACG  666

Query  667  CCCGTGGAGCAGGTGGTGGCCAAGACCTTCTCTTGCCAGGCCCTGCCCTCCGAGGGCTTCAGTCTGGAGCCGCC  740
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Sbjct  667  CCCGTGGAGCAGGTGGTGGCCAAGACCTTCTCTTGCCAGGCCCTGCCCTCCGAGGGCTTCAGTCTGGAGCCGCC  740

Query  741  CAGAGCCACCCAGGTCGATCCGTGCAACCTCCAGGAGCTGTTCCAGGAGATGTCGGCCAACGTCTTCCGAATCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGAGCCACCCAGGTCGATCCGTGCAACCTCCAGGAGCTGTTCCAGGAGATGTCGGCCAACGTCTTCCGAATCA  814

Query  815  ACTCCAGTGTGACCTCCTTGGAGCGGAGCCTTCAGTCCTTAGGGACACCGAGTGACACGCAGGAGCTTCGGGAC  888
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Sbjct  815  ACTCCAGTGTGACCTCCTTGGAGCGGAGCCTTCAGTCCTTAGGGACACCGAGTGACACGCAGGAGCTTCGGGAC  888

Query  889  AGCCTGCACACGGCACAGCAGGAGACCAACAAGACCATTGCAGCCAGCGCCAGCTCCGTGAAGCAGATGGCCGA  962
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Sbjct  889  AGCCTGCACACGGCACAGCAGGAGACCAACAAGACCATTGCAGCCAGCGCCAGCTCCGTGAAGCAGATGGCCGA  962

Query  963  GCTGCTGCGCAGCTCCTGCCCGCAGGAGCGTCTGCAGCAGGAGCGTCCTCAGCTGGACCGGCTGAAAACCCAGC  1036
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Sbjct  963  GCTGCTGCGCAGCTCCTGCCCGCAGGAGCGTCTGCAGCAGGAGCGTCCTCAGCTGGACCGGCTGAAAACCCAGC  1036

Query 1037  TCTCAGATGCCATTCAGTGCTATGGAGTGGTGCAGAAGAAAATTGCAGAAAAGTCCAGAGCGCTGCTTCCCATG  1110
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Sbjct 1037  TCTCAGATGCCATTCAGTGCTATGGAGTGGTGCAGAAGAAAATTGCAGAAAAGTCCAGAGCGCTGCTTCCCATG  1110

Query 1111  GCGCAGAGGGGCAGTAAACAGCAGAGTCCCCAGGCCCCGTTTGCCGAGCTGGCTGATGATGAGAAGGTCTTTAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCGCAGAGGGGCAGTAAACAGCAGAGTCCCCAGGCCCCGTTTGCCGAGCTGGCTGATGATGAGAAGGTCTTTAA  1184

Query 1185  CGGGAGTGACAACATGTGGCAGGGCCAGGAGCAGGCGCTGCTCCCGGACATCACTGAAGAGGACCTGGAGGCCA  1258
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Sbjct 1185  CGGGAGTGACAACATGTGGCAGGGCCAGGAGCAGGCGCTGCTCCCGGACATCACTGAAGAGGACCTGGAGGCCA  1258

Query 1259  TCCGGCTGCGGGAGGAGGCCATCCTGCAGATGGAGAGCAACTTGCTGGATGTGAATCAGATCATCAAGGACTTG  1332
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Sbjct 1259  TCCGGCTGCGGGAGGAGGCCATCCTGCAGATGGAGAGCAACTTGCTGGATGTGAATCAGATCATCAAGGACTTG  1332

Query 1333  GCCTCCATGGTGTCAGAGCAAGGAGAAGCTGTTG----------------------------------------  1366
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Sbjct 1333  GCCTCCATGGTGTCAGAGCAAGGAGAAGCTGTTGGGTCCAGCAGCAGCAAAGCCATCTGCCAGCAGAGCTGCAG  1406

Query 1367  --------------------------------------------------------------------------  1366
                                                                                      
Sbjct 1407  CCCCGAGCCGGCCGCGGCAGCCCTGCTGCTGGGTGCCGGGCCGGGCTCCACACCCCTGCGGCCGGGCCCCCACT  1480

Query 1367  --------------------------------------------------------------------------  1366
                                                                                      
Sbjct 1481  CCCGCACCAAGACACGCAAGCCCAACTTCAGCCCCCAGGAGACGGAGGTGCTGGTGCAGAGGGTGCGGCGCCAC  1554

Query 1367  --------------------------------------------------------------------------  1366
                                                                                      
Sbjct 1555  TACCCGCTGCTGTTCGGGGCGCTGCGGGGCACACCTGCCCGAAAGCACCGCGTGTGGAGCCGCATCCTGCAGGC  1628

Query 1367  --------------------------------------------------------------------------  1366
                                                                                      
Sbjct 1629  AGTGAACGCGCTGGGCTACTGCCGCCGCGACCTGGGGGACCTCAAGCACAAGTGGCGGGACCTGCGAGGTGCTG  1702

Query 1367  --------------------------------------------------------------------------  1366
                                                                                      
Sbjct 1703  TGCGCAAGAAGCTGGCGGAGGGCGGCCCCGCCCCCGGCCTCCTCCTCACACCTGTGGAGCGCATGGTGGCAGAG  1776

Query 1367  -------------------------------------------------------ATAGTATTGAAGCCAGCCT  1385
                                                                   |||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ACCTTTTCTGCCCACGGTCCCCAAGGCGAGGGCCAGACCACGGAGCCCCTGCCAAATAGTATTGAAGCCAGCCT  1850

Query 1386  TGAGGCTGCGTCCTCGCATGCGGAGGCAGCCCGCCAGCTCCTGGCTGGAGCCAGCCGGCACCAACTCCAGAGAC  1459
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Sbjct 1851  TGAGGCTGCGTCCTCGCATGCGGAGGCAGCCCGCCAGCTCCTGGCTGGAGCCAGCCGGCACCAACTCCAGAGAC  1924

Query 1460  ACAAGATCAAGTGCTGCTTCCTATCAGCTGGAGTCACTGCCCTGCTTGTCATCATCATCATCATCGCCACCTCT  1533
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Sbjct 1925  ACAAGATCAAGTGCTGCTTCCTATCAGCTGGAGTCACTGCCCTGCTTGTCATCATCATCATCATCGCCACCTCT  1998

Query 1534  GTCCGAAAG  1542
            |||||||||
Sbjct 1999  GTCCGAAAG  2007