Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13418
• Subject: XM_011539500.2
• Aligned Length: 1284
• Identities: 1201
• Gaps: 81

Alignment

Query    1  ATGGAGCACCTTGTTCCCACGGTGGACTATTACCCCGATAGGACGTACATCTTCACCTTTCTCCTGAGCTCCCG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGTCTTTATGCCCCCTCATGACCTGCTGGCCCGCGTGGGGCAGATCTGCGTGGAGCAGAAGCAGCAGCTGGAAG  148
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------ATGCCCCCTCATGACCTGCTGGCCCGCGTGGGGCAGATCTGCGTGGAGCAGAAGCAGCAGCTGGAAG  67

Query  149  CCGGGCCTGAAAAGGCCAAGCTGAAGTCTTTCTCAGCCAAGATCGTGCAGCTCCTGAAGGAGTGGACCGAGGCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   68  CCGGGCCTGAAAAGGCCAAGCTGAAGTCTTTCTCAGCCAAGATCGTGCAGCTCCTGAAGGAGTGGACCGAGGCC  141

Query  223  TTCCCCTATGACTTCCAGGATGAGAAGGCCATGGCCGAGCTGAAAGCCATCACACACCGTGTCACCCAGTGTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  142  TTCCCCTATGACTTCCAGGATGAGAAGGCCATGGCCGAGCTGAAAGCCATCACACACCGTGTCACCCAGTGTGA  215

Query  297  TGAGGAGAATGGCACAGTGAAGAAGGCCATTGCCCAGATGACACAGAGCCTGTTGCTGTCCTTGGCTGCCCGGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  216  TGAGGAGAATGGCACAGTGAAGAAGGCCATTGCCCAGATGACACAGAGCCTGTTGCTGTCCTTGGCTGCCCGGA  289

Query  371  GCCAGCTCCAGGAACTGCGAGAGAAGCTCCGGCCACCGGCTGTAGACAAGGGGCCCATCCTCAAGACCAAGCCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  290  GCCAGCTCCAGGAACTGCGAGAGAAGCTCCGGCCACCGGCTGTAGACAAGGGGCCCATCCTCAAGACCAAGCCA  363

Query  445  CCAGCCGCCCAGAAGGACATCCTGGGCGTGTGCTGCGACCCCCTGGTGCTGGCCCAGCAGCTGACTCACATTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  364  CCAGCCGCCCAGAAGGACATCCTGGGCGTGTGCTGCGACCCCCTGGTGCTGGCCCAGCAGCTGACTCACATTGA  437

Query  519  GCTGGACAGGGTCAGCAGCATTTACCCTGAGGACTTGATGCAGATCGTCAGCCACATGGACTCATTGGACAACC  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  438  GCTGGACAGGGTCAGCAGCATTTACCCTGAGGACTTGATGCAGATCGTCAGCCACATGGACTCCTTGGACAACC  511

Query  593  ACAGGTGCCGAGGGGACCTGACCAAGACCTACAGCCTGGAGGCCTATGACAACTGGTTCAACTGCCTGAGCATG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  512  ACAGGTGCCGAGGGGACCTGACCAAGACCTACAGCCTGGAGGCCTATGACAACTGGTTCAACTGCCTGAGCATG  585

Query  667  CTGGTGGCCACTGAGGTGTGCCGGGTGGTGAAGAAGAAACACCGGACCCGCATGTTGGAGTTCTTCATTGATGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  586  CTGGTGGCCACTGAGGTGTGCCGGGTGGTGAAGAAGAAACACCGGACCCGCATGTTGGAGTTCTTCATTGATGT  659

Query  741  GGCCCGGGAGTGCTTCAACATCGGGAACTTCAACTCCATGATGGCCATCATCTCTGGCATGAACCTCAGTCCTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660  GGCCCGGGAGTGCTTCAACATCGGGAACTTCAACTCCATGATGGCCATCATCTCTGGCATGAACCTCAGTCCTG  733

Query  815  TGGCAAGGCTGAAGAAAACTTGGTCCAAGGTCAAGACAGCCAAGTTTGATGTCTTGGAGCATCACATGGACCCG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  734  TGGCAAGGCTGAAGAAAACTTGGTCCAAGGTCAAGACAGCCAAGTTTGATGTCTTGGAGCATCACATGGACCCG  807

Query  889  TCCAGCAACTTCTGCAACTACCGTACAGCCCTGCAGGGGGCCACGCAGAGGTCCCAGATGGCCAACAGCAGCCG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  808  TCCAGCAACTTCTGCAACTACCGTACAGCCCTGCAGGGGGCCACGCAGAGGTCCCAGATGGCCAACAGCAGCCG  881

Query  963  TGAAAAGATCGTCATCCCTGTGTTCAACCTCTTCGTTAAGGACATCTACTTCCTGCACAAAATCCATACCAACC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  882  TGAAAAGATCGTCATCCCTGTGTTCAACCTCTTCGTTAAGGACATCTACTTCCTGCACAAAATCCATACCAACC  955

Query 1037  ACCTGCCCAACGGGCACATTAACTTTAAGAAATTCTGGGAGATCTCCAGACAGATCCATGAGTTCATGACATGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  956  ACCTGCCCAACGGGCACATTAACTTTAAGAAATTCTGGGAGATCTCCAGACAGATCCATGAGTTCATGACATGG  1029

Query 1111  ACACAGGTAGAGTGTCCTTTCGAGAAGGACAAGAAGATTCAGAGTTACCTGCTCACGGCGCCCATCTACAGCGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030  ACACAGGTAGAGTGTCCTTTCGAGAAGGACAAGAAGATTCAGAGTTACCTGCTCACGGCGCCCATCTACAGCGA  1103

Query 1185  GGAAGCTCTCTTCGTCGCCTCCTTTGAAAGTGAGGGTCCCGAGAACCACGTGGAAAAAGACAGCTGGAAGACCC  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104  GGAAGCTCTCTTCGTCGCCTCCTTTGAAAGTGAGGGTCCCGAGAACCACATGGAAAAAGACAGCTGGAAGACCC  1177

Query 1259  TCAGGACCACCCTTCTGAACAGAGCC  1284
            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178  TCAGGACCACCCTTCTGAACAGAGCC  1203