Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13426
- Subject:
- NM_001289020.3
- Aligned Length:
- 2442
- Identities:
- 2213
- Gaps:
- 219
Alignment
Query 1 ATGGTGAAGCAGACTATCCAGATATTCGCGAGGGTGAAGCCCCCTGTCCGGAAGCACCAACAAGGGATTTATTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTGAAGCAGACTATCCAGATATTCGCGAGGGTGAAGCCCCCTGTCCGGAAGCACCAACAAGGGATTTATTC 74
Query 75 CATAGATGAAGATGAAAAATTAATACCTAGCTTGGAAATCATCTTACCACGTGATTTGGCAGATGGGTTTGTGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATAGATGAAGATGAAAAATTAATACCTAGCTTGGAAATCATCTTACCACGTGATTTGGCAGATGGGTTTGTGA 148
Query 149 ATAATAAGCGAGAAAGCTACAAATTTAAATTTCAAAGAATTTTTGATCAGGATGCAAACCAAGAGACCGTTTTT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATAATAAGCGAGAAAGCTACAAATTTAAATTTCAAAGAATTTTTGATCAGGATGCAAACCAAGAGACCGTTTTT 222
Query 223 GAAAACATTGCCAAACCAGTTGCTGGGAGTGTCCTGGCAGGTTACAATGGTACCATCTTTGCATATGGGCAAAC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAAACATTGCCAAACCAGTTGCTGGGAGTGTCCTGGCAGGTTACAATGGTACCATCTTTGCATATGGGCAAAC 296
Query 297 AGGCAGCGGGAAGACATTCACTATCACAGGGGGTGCAGAGCGTTACAGTGACAGAGGCATTATCCCAAGGACAC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGGCAGCGGGAAGACATTCACTATCACAGGGGGTGCAGAGCGTTACAGTGACAGAGGCATTATCCCAAGGACAC 370
Query 371 TGTCATACATTTTTGAACAGTTACAAAAGGACAGCAGCAAAATATATACAACACACATTTCCTATTTGGAAATC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGTCATACATTTTTGAACAGTTACAAAAGGACAGCAGCAAAATATATACAACACACATTTCCTATTTGGAAATC 444
Query 445 TACAATGAATGTGGTTATGATCTTTTGGATCCAAGACATGAAGCCTCCAGTTTGGAAGATTTGCCGAAAGTGAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TACAATGAATGTGGTTATGATCTTTTGGATCCAAGACATGAAGCCTCCAGTTTGGAAGATTTGCCGAAAGTGAC 518
Query 519 AATACTGGAGGATCCTGATCAGAACATTCACCTGAAAAACTTGACTCTCCATCAGGCAACCACAGAGGAAGAAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AATACTGGAGGATCCTGATCAGAACATTCACCTGAAAAACTTGACTCTCCATCAGGCAACCACAGAGGAAGAAG 592
Query 593 CTCTGAATTTGCTTTTTTTAGGAGACACCAACCGAATGATTGCAGAGACTCCTATGAACCAAGCTTCAACCCGT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTCTGAATTTGCTTTTTTTAGGAGACACCAACCGAATGATTGCAGAGACTCCTATGAACCAAGCTTCAACCCGT 666
Query 667 TCCCACTGCATTTTCACCATTCATTTGTCAAGCAAGGAACCAGGATCTGCAACTGTACGACATGCCAAACTCCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCCCACTGCATTTTCACCATTCATTTGTCAAGCAAGGAACCAGGATCTGCAACTGTACGACATGCCAAACTCCA 740
Query 741 TCTGGTTGACCTGGCTGGTTCAGAGCGAGTTGCAAAGACTGGAGTAGGGGGCCATCTTCTAACAGAGGCCAAGT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCTGGTTGACCTGGCTGGTTCAGAGCGAGTTGCAAAGACTGGAGTAGGGGGCCATCTTCTAACAGAGGCCAAGT 814
Query 815 ATATCAACTTGTCACTACATTACTTAGAACAGGTTATCATTGCCCTTTCAGAAAAGCACCGTTCGCACATTCCT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATATCAACTTGTCACTACATTACTTAGAACAGGTTATCATTGCCCTTTCAGAAAAGCACCGTTCGCACATTCCT 888
Query 889 TATAGAAACTCCATGATGACCAGTGTCCTAAGAGACAGTTTGGGAGGGAACTGCATGACAACTATGATTGCAAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TATAGAAACTCCATGATGACCAGTGTCCTAAGAGACAGTTTGGGAGGGAACTGCATGACAACTATGATTGCAAC 962
Query 963 ACTCTCCTTGGAGAAAAGGAATCTTGATGAGTCTATATCAACCTGCAGATTTGCACAGCGAGTGGCACTCATAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACTCTCCTTGGAGAAAAGGAATCTTGATGAGTCTATATCAACCTGCAGATTTGCACAGCGAGTGGCACTCATAA 1036
Query 1037 AGAATGAAGCTGTTCTTAATGAAGAAATTAACCCCAGATTAGTGATTAAACGCCTACAAAAGGAAATCCAGGAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGAATGAAGCTGTTCTTAATGAAGAAATTAACCCCAGATTAGTGATTAAACGCCTACAAAAGGAAATCCAGGAA 1110
Query 1111 CTGAAGGATGAACTGGCCATGGTCACTGGGGAGCAGAGGACAGAGGCACTCACAGAAGCAGAGCTCCTTCAGCT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTGAAGGATGAACTGGCCATGGTCACTGGGGAGCAGAGGACAGAGGCACTCACAGAAGCAGAGCTCCTTCAGCT 1184
Query 1185 GGAAAAACTAATAACATCCTTTTTGGAAGACCAGGATTCAGACAGTAGATTAGAGGTTGGCGCGGATATGCGTA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGAAAAACTAATAACATCCTTTTTGGAAGACCAGGATTCAGACAGTAGATTAGAGGTTGGCGCGGATATGCGTA 1258
Query 1259 AAGTTCATCACTGTTTTCATCATTTAAAGAAACTATTGAATGACAAGAAGATCCTTGAAAACAATACAGTCTCC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAGTTCATCACTGTTTTCATCATTTAAAGAAACTATTGAATGACAAGAAGATCCTTGAAAACAATACAGTCTCC 1332
Query 1333 TCTGAAAGCAAAGACCAAGATTGTCAAGAACCATTAAAAGAAGAAGAATATAGAAAGCTACGAGATATTCTGAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TCTGAAAGCAAAGACCAAGATTGTCAAGAACCATTAAAAGAAGAAGAATATAGAAAGCTACGAGATATTCTGAA 1406
Query 1407 ACAGAGAGATAACGAAATCAGTATCCT-TTC----TG-------AAGTGATGAAGAAA---------------- 1452
||||||||||||||||||||.|||||| .|| || |||..|.|||||||
Sbjct 1407 ACAGAGAGATAACGAAATCAATATCCTGGTCAACATGTTAAAAAAAGAAAAGAAGAAAGCTCAGGAGGCTCTCC 1480
Query 1453 -------------------------------------------------CTTCC-------------------- 1457
|||||
Sbjct 1481 ACTTGGCTGGCATGGATAGACGTGAATTCAGACAGTCCCAGAGCCCACCCTTCCGCCTAGGAAACCCAGAAGAA 1554
Query 1458 --------------TCTATCCT-----------------------------------------------GGTTT 1470
.||||||| .||||
Sbjct 1555 GGTCAAAGAATGCGACTATCCTCAGCTCCCTCACAGGCCCAGGACTTCAGCATTTTGGGGAAAAGATCCAGTTT 1628
Query 1471 G----------AAAGGGGAATGAGAGAGGAAATGTCATTAGGATGCCAGGAGGCTTTTGAAATCTTCAAGAGGG 1534
| |||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GCTCCACAAGAAAATAGGAATGAGAGAGGAAATGTCATTAGGATGCCAGGAGGCTTTTGAAATCTTCAAGAGGG 1702
Query 1535 ACCACGCTGACAGCGTTACCATCGATGACAACAAACAGATTCTGAAACAGAGATTTTCTGAAGCCAAGGCCCTG 1608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ACCACGCTGACAGCGTTACCATCGATGACAACAAACAGATTCTGAAACAGAGATTTTCTGAAGCCAAGGCCCTG 1776
Query 1609 GGAGAAAGTATAAATGAAGCAAGAAGTAAAATTGGTCACCTGAAGGAAGAAATCACCCAGCGGCATATACAGCA 1682
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GGAGAAAGTATAAATGAAGCAAGAAGTAAAATT----------------------------------------- 1809
Query 1683 AGTAGCCCTAGGAATCTCGGAAAACATGGCCGTGCCTCTGATGCCAGACCAGCAGGAGGAGAAGCTGCGATCAC 1756
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1810 ----------GGAATCTCGGAAAACATGGCCGTGCCTCTGATGCCAGACCAGCAGGAGGAGAAGCTGCGATCAC 1873
Query 1757 AACTGGAGGAAGAAAAGAGAAGGTATAAAACAATGTTCACTCGCCTGAAAGCCCTGAAGGTGGAGATCGAGCAC 1830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1874 AACTGGAGGAAGAAAAGAGAAGGTATAAAACAATGTTCACTCGCCTGAAAGCCCTGAAGGTGGAGATCGAGCAC 1947
Query 1831 TTGCAGCTGCTCATGGACAAAGCCAAGGTGAAGCTACAGAAAGAGTTTGAAGTCTGGTGGGCAGAGGAGGCCAC 1904
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1948 TTGCAGCTGCTCATGGACAAAGCCAAGGTGAAGCTACAGAAAGAGTTTGAAGTCTGGTGGGCAGAGGAGGCCAC 2021
Query 1905 CAACCTGCAGGTAAATTCTCCAGCAGTGAATTCACTCGATCACACGAAGCCATTTCTCCAGACATCTGACTCCC 1978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2022 CAACCTGCAGGTAAATTCTCCAGCAGTGAATTCACTCGATCACACGAAGCCATTTCTCCAGACATCTGACTCCC 2095
Query 1979 AGCATGAACGGTCCCAACTCCTCTCTAACAAAAGTTCTGGAGGCTGGGAAGTCCAAGATCAAGGCACTGGCAGA 2052
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2096 AGCATGAATGGTCCCAACTCCTCTCTAACAAAAGTTCTGGAGGCTGGGAAGTCCAAGATCAAGGCACTGGCAGA 2169
Query 2053 TTCGATGTCTGTGATGTGAATGCCAGGAAAATCCTGCCCTCGCCTTGCCCCAGTCCACACAGCCAGAAACAGAG 2126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2170 TTCGATGTCTGTGATGTGAATGCCAGGAAAATCCTGCCCTCGCCTTGCCCCAGTCCACACAGCCAGAAACAGAG 2243
Query 2127 CAGCACCAGCACCCCACTGGAAGACAGCATCCCCAAGAGGCCAGTGTCGTCCATCCCTCTCACCGGAGACAGCC 2200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2244 CAGCACCAGCACCCCACTGGAAGACAGCATCCCCAAGAGGCCAGTGTCGTCCATCCCTCTCACCGGAGACAGCC 2317
Query 2201 AGACGGACTCGGACATCATCGCCTTCATCAAGGCCAGACAGAGCATTCTGCAGAAGCAATGTTTGGGAAGCAAT 2274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2318 AGACGGACTCGGACATCATCGCCTTCATCAAGGCCAGACAGAGCATTCTGCAGAAGCAATGTTTGGGAAGCAAT 2391