Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13426
- Subject:
- XM_017010427.1
- Aligned Length:
- 2531
- Identities:
- 1948
- Gaps:
- 571
Alignment
Query 1 ATGGTGAAGCAGACTATCCAGATATTCGCGAGGGTGAAGCCCCCTGTCCGGAAGCACCAACAAGGGATTTATTC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CATAGATGAAGATGAAAAATTAATACCTAGCTTGGAAATCATCTTACCACGTGATTTGGCAGATGGGTTTGTGA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ATAATAAGCGAGAAAGCTACAAATTTAAATTTCAAAGAATTTTTGATCAGGATGCAAACCAAGAGACCGTTTTT 222
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------------------------------ATGCAAACCAAGAGACCGTTTTT 23
Query 223 GAAAACATTGCCAAACCAGTTGCTGGGAGTGTCCTGGCAGGTTACAATGGTACCATCTTTGCATATGGGCAAAC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 24 GAAAACATTGCCAAACCAGTTGCTGGGAGTGTCCTGGCAGGTTACAATGGTACCATCTTTGCATATGGGCAAAC 97
Query 297 AGGCAGCGGGAAGACATTCACTATCACAGGGGGTGCAGAGCGTTACAGTGACAGAGGCATTATCCCAAGGACAC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 98 AGGCAGCGGGAAGACATTCACTATCACAGGGGGTGCAGAGCGTTACAGTGACAGAGGCATTATCCCAAGGACAC 171
Query 371 TGTCATACATTTTTGAACAGTTACAAAAGGACAGCAGCAAAATATATACAACACACATTTCCTATTTGGAAATC 444
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 172 TGTCATACATTTTTGAACAGTTACAAAAG--------------------------------------------- 200
Query 445 TACAATGAATGTGGTTATGATCTTTTGGATCCAAGACATGAAGCCTCCAGTTTGGAAGATTTGCCGAAAGTGAC 518
|||||||||
Sbjct 201 -----------------------------------------------------------------GAAAGTGAC 209
Query 519 AATACTGGAGGATCCTGATCAGAACATTCACCTGAAAAACTTGACTCTCCATCAGGCAACCACAGAGGAAGAAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 210 AATACTGGAGGATCCTGATCAGAACATTCACCTGAAAAACTTGACTCTCCATCAGGCAACCACAGAGGAAGAAG 283
Query 593 CTCTGAATTTGCTTTTTTTAGGAGACACCAACCGAATGATTGCAGAGACTCCTATGAACCAAGCTTCAACCCGT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 284 CTCTGAATTTGCTTTTTTTAGGAGACACCAACCGAATGATTGCAGAGACTCCTATGAACCAAGCTTCAACCCGT 357
Query 667 TCCCACTGCATTTTCACCATTCATTTGTCAAGCAAGGAACCAGGATCTGCAACTGTACGACATGCCAAACTCCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 358 TCCCACTGCATTTTCACCATTCATTTGTCAAGCAAGGAACCAGGATCTGCAACTGTACGACATGCCAAACTCCA 431
Query 741 TCTGGTTGACCTGGCTGGTTCAGAGCGAGTTGCAAAGACTGGAGTAGGGGGCCATCTTCTAACAGAGGCCAAGT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 432 TCTGGTTGACCTGGCTGGTTCAGAGCGAGTTGCAAAGACTGGAGTAGGGGGCCATCTTCTAACAGAGGCCAAGT 505
Query 815 ATATCAACTTGTCACTACATTACTTAGAACAGGTTATCATTGCCCTTTCAGAAAAGCACCGTTCGCACATTCCT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 506 ATATCAACTTGTCACTACATTACTTAGAACAGGTTATCATTGCCCTTTCAGAAAAGCACCGTTCGCACATTCCT 579
Query 889 TATAGAAACTCCATGATGACCAGTGTCCTAAGAGACAGTTTGGGAGGGAACTGCATGACAACTATGATTGCAAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 580 TATAGAAACTCCATGATGACCAGTGTCCTAAGAGACAGTTTGGGAGGGAACTGCATGACAACTATGATTGCAAC 653
Query 963 ACTCTCCTTGGAGAAAAGGAATCTTGATGAGTCTATATCAACCTGCAGATTTGCACAGCGAGTGGCACTCATAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 654 ACTCTCCTTGGAGAAAAGGAATCTTGATGAGTCTATATCAACCTGCAGATTTGCACAGCGAGTGGCACTCATAA 727
Query 1037 AGAATGAAGCTGTTCTTAATGAAGAAATTAACCCCAGATTAGTGATTAAACGCCTACAAAAGGAAATCCAGGAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 728 AGAATGAAGCTGTTCTTAATGAAGAAATTAACCCCAGATTAGTGATTAAACGCCTACAAAAGGAAATCCAGGAA 801
Query 1111 CTGAAGGATGAACTGGCCATGGTCACTGGGGAGCAGAGGACAGAGGCACTCACAGAAGCAGAGCTCCTTCAGCT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 802 CTGAAGGATGAACTGGCCATGGTCACTGGGGAGCAGAGGACAGAGGCACTCACAGAAGCAGAGCTCCTTCAGCT 875
Query 1185 GGAAAAACTAATAACATCCTTTTTGGAAGACCAGGATTCAGACAGTAGATTAGAGGTTGGCGCGGATATGCGTA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 876 GGAAAAACTAATAACATCCTTTTTGGAAGACCAGGATTCAGACAGTAGATTAGAGGTTGGCGCGGATATGCGTA 949
Query 1259 AAGTTCATCACTGTTTTCATCATTTAAAGAAACTATTGAATGACAAGAAGATCCTTGAAAACAATACAGTCTCC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 950 AAGTTCATCACTGTTTTCATCATTTAAAGAAACTATTGAATGACAAGAAGATCCTTGAAAACAATACAGTCTCC 1023
Query 1333 TCTGAAAGCAAAGACCAAGATTGTCAAGAACCATTAAAAGAAGAAGAATATAGAAAGCTACGAGATATTCTGAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1024 TCTGAAAGCAAAGACCAAGATTGTCAAGAACCATTAAAAGAAGAAGAATATAGAAAGCTACGAGATATTCTGAA 1097
Query 1407 ACAGAGAGATAACGAAATCAGTATCCT-TTC----TG-------AAGTGATGAAGAAA---------------- 1452
||||||||||||||||||||.|||||| .|| || |||..|.|||||||
Sbjct 1098 ACAGAGAGATAACGAAATCAATATCCTGGTCAACATGTTAAAAAAAGAAAAGAAGAAAGCTCAGGAGGCTCTCC 1171
Query 1453 -------------------------------------------------CTTCC-------------------- 1457
|||||
Sbjct 1172 ACTTGGCTGGCATGGATAGACGTGAATTCAGACAGTCCCAGAGCCCACCCTTCCGCCTAGGAAACCCAGAAGAA 1245
Query 1458 --------------TCTATCCT-----------------------------------------------GGTTT 1470
.||||||| .||||
Sbjct 1246 GGTCAAAGAATGCGACTATCCTCAGCTCCCTCACAGGCCCAGGACTTCAGCATTTTGGGGAAAAGATCCAGTTT 1319
Query 1471 G----------AAAGGGGAATGAGAGAGGAAATGTCATTAGGATGCCAGGAGGCTTTTGAAATCTTCAAGAGGG 1534
| |||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 GCTCCACAAGAAAATAGGAATGAGAGAGGAAATGTCATTAGGATGCCAGGAGGCTTTTGAAATCTTCAAGAGGG 1393
Query 1535 ACCACGCTGACAGCGTTACCATCGATGACAACAAACAGATTCTGAAACAGAGATTTTCTGAAGCCAAGGCCCTG 1608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1394 ACCACGCTGACAGCGTTACCATCGATGACAACAAACAGATTCTGAAACAGAGATTTTCTGAAGCCAAGGCCCTG 1467
Query 1609 GGAGAAAGTATAAATGAAGCAAGAAGTAAAATTGGTCACCTGAAGGAAGAAATCACCCAGCGGCATATACAGCA 1682
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1468 GGAGAAAGTATAAATGAAGCAAGAAGTAAAATTGGTCACCTGAAGGAAGAAATCACCCAGCGGCATATACAGCA 1541
Query 1683 AGTAGCCCTAGGAATCTCGGAAAACATGGCCGTGCCTCTGATGCCAGACCAGCAGGAGGAGAAGCTGCGATCAC 1756
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1542 AGTAGCCCTAGGAATCTCGGAAAACATGGCCGTGCCTCTGATGCCAGACCAGCAGGAGGAGAAGCTGCGATCAC 1615
Query 1757 AACTGGAGGAAGAAAAGAGAAGGTATAAAACAATGTTCACTCGCCTGAAAGCCCTGAAGGTGGAGATCGAGCAC 1830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1616 AACTGGAGGAAGAAAAGAGAAGGTATAAAACAATGTTCACTCGCCTGAAAGCCCTGAAGGTGGAGATCGAGCAC 1689
Query 1831 TTGCAGCTGCTCATGGACAAAGCCAAGGTGAAGCTACAGAAAGAGTTTGAAGTCTGGTGGGCAGAGGAGGCCAC 1904
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1690 TTGCAGCTGCTCATGGACAAAGCCAAGGTGAAGCTACAGAAAGAGTTTGAAGTCTGGTGGGCAGAGGAGGCCAC 1763
Query 1905 CAACCTGCAGGTAAATTCTCCAGCAGTGAATTCACTCGATCACACGAAGCCATTTCTCCAGACATCTGACTCCC 1978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1764 CAACCTGCAGGTAAATTCTCCAGCAGTGAATTCACTCGATCACACGAAGCCATTTCTCCAGACATCTGACTCCC 1837
Query 1979 AGCATGAACGGTCCCAACTCCTCTCTAACAAAAGTTCTGGAGGCTGGGAAGTCCAAGATCAAGGCACTGGCAGA 2052
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1838 AGCATGAATGGTCCCAACTCCTCTCTAACAAAAGTTCTGGAGGCTGGGAAGTCCAAGATCAAGGCACTGGCAGA 1911
Query 2053 TTCGATGTCTGTGATGTGAATGCCAGGAAAATCCTGCCCTCGCCTTGCCCCAGTCCACACAGCCAGAAACAGAG 2126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1912 TTCGATGTCTGTGATGTGAATGCCAGGAAAATCCTGCCCTCGCCTTGCCCCAGTCCACACAGCCAGAAACAGAG 1985
Query 2127 CAGCACCAGCACCCCACTGGAAGACAGCATCCCCAAGAGGCCAGTGTCGTCCATCCCTCTCACCGGAGACAGCC 2200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1986 CAGCACCAGCACCCCACTGGAAGACAGCATCCCCAAGAGGCCAGTGTCGTCCATCCCTCTCACCGGAGACAGCC 2059
Query 2201 AGACGGACTCGGACATCATCGCCTTCATCAAGGCCAGACAGAGCATTCTGCAGAAGCAATGT-TTGGGAAGCAA 2273
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.| || .|||
Sbjct 2060 AGACGGACTCGGACATCATCGCCTTCATCAAGGCCAGACAGAGCATTCTGCAGAAGCAATATCTT---CAGC-- 2128
Query 2274 T------------------------------------------------------------------------- 2274
|
Sbjct 2129 TCCTTTGTTCTCTGTTCCCAAAGTCAGCTGTCTCCTCTGCTCAGGCTTCTACAAACAGGAAGGGGCTGAGTGAT 2202
Query 2275 --------------- 2274
Sbjct 2203 GTTTTGGTAACTCGT 2217