Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13440
• Subject: NM_001040661.2
• Aligned Length: 1590
• Identities: 1547
• Gaps: 42

Alignment

Query    1  ATGGGCTCCGTGGGGAGCCAGCGCCTTGAGGAGCCCAGCGTGGCAGGCACACCAGACCCGGGCGTAGTGATGAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCTCCGTGGGGAGCCAGCGCCTTGAGGAGCCCAGCGTGGCAGGCACACCAGACCCGGGCGTAGTGATGAG  74

Query   75  CTTCACCTTCGACAGTCACCAGCTGGAGGAGGCGGCGGAGGCGGCTCAGGGCCAGGGCCTTAGGGCCAGGGGCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTCACCTTCGACAGTCACCAGCTGGAGGAGGCGGCGGAGGCGGCTCAGGGCCAGGGCCTTAGGGCCAGGGGCG  148

Query  149  TCCCAGCTTTCACGGATACTACATTGGACGAGCCAGTGCCCGATGACCGTTATCACGCCATCTACTTTGCGATG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCCCAGCTTTCACGGATACTACATTGGACGAGCCAGTGCCCGATGACCGTTATCACGCCATCTACTTTGCGATG  222

Query  223  CTGCTGGCTGGCGTGGGCTTCCTGCTGCCATACAACAGCTTCATCACGGACGTGGACTACCTGCATCACAAGTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGCTGGCTGGCGTGGGCTTCCTGCTGCCATACAACAGCTTCATCACGGACGTGGACTACCTGCATCACAAGTA  296

Query  297  CCCAGGGACCTCCATCGTGTTTGACATGAGCCTCACCTACATCTTGGTGGCACTGGCAGCTGTCCTCCTGAACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCAGGGACCTCCATCGTGTTTGACATGAGCCTCACCTACATCTTGGTGGCACTGGCAGCTGTCCTCCTGAACA  370

Query  371  ACGTCCTGGTGGAGAGACTGACCCTGCACACCAGGATCACCG--------------------------------  412
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                
Sbjct  371  ACGTCCTGGTGGAGAGACTGACCCTGCACACCAGGATCACCGCAGGCTACCTCTTAGCCTTGGGCCCTCTCCTT  444

Query  413  -----CAGCATCTGCGACGTGTGGCTGCAGCTCTTCTCTCGGGACCAGGCCTACGCCATCAACCTGGCCGCTGT  481
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTATCAGCATCTGCGACGTGTGGCTGCAGCTCTTCTCTCGGGACCAGGCCTACGCCATCAACCTGGCCGCTGT  518

Query  482  GGGCACCGTGGCCTTCGGCTGCA-----CAGCAATCCAGCTTCTACGGGTACACGGGGATGCTGCCCAAGCGGT  550
            |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGGCACCGTGGCCTTCGGCTGCACAGTGCAGCAATCCAGCTTCTACGGGTACACGGGGATGCTGCCCAAGCGGT  592

Query  551  ACACGCAGGGGGTGATGACCGGGGAGAGCACGGCGGGCGTGATGATCTCTCTGAGCCGCATCCTCACGAAGCTG  624
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACACGCAGGGGGTGATGACCGGGGAGAGCACGGCGGGCGTGATGATCTCTCTGAGCCGCATCCTCACGAAGCTG  666

Query  625  CTGCTGCCCGACGAGCGCGCCAGCACGCTCATCTTCTTCCTGGTGTCGGTGGCGCTGGAGCTGCTGTGTTTCCT  698
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGCTGCCCGACGAGCGCGCCAGCACGCTCATCTTCTTCCTGGTGTCGGTGGCGCTGGAGCTGCTGTGTTTCCT  740

Query  699  GCTGCACCTGTTAGTGCGGCGCAGCCGCTTCGTGCTCTTCTATACCACACGGCCGCGTGACAGCCACCGGGGCA  772
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTGCACCTGTTAGTGCGGCGCAGCCGCTTCGTGCTCTTCTATACCACACGGCCGCGTGACAGCCACCGGGGCA  814

Query  773  GGCCAGGCCTGGGCAGGGGCTATGGCTACCGCGTGCACCACGACGTTGTCGCCGGGGACGTCCACTTCGAGCAC  846
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGCCAGGCCTGGGCAGGGGCTATGGCTACCGCGTGCACCACGACGTTGTCGCCGGGGACGTCCACTTCGAGCAC  888

Query  847  CCAGCCCCGGCCCTGGCCCCCAACGAGTCCCCAAAGGACAGCCCAGCCCACGAGGTGACCGGCAGCGGCGGGGC  920
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCAGCCCCGGCCCTGGCCCCCAACGAGTCCCCAAAGGACAGCCCAGCCCACGAGGTGACCGGCAGCGGCGGGGC  962

Query  921  CTACATGCGCTTTGACGTGCCGCGGCCAAGGGTCCAGCGCAGCTGGCCCACCTTCAGAGCCCTGTTACTGCACC  994
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTACATGCGCTTTGATGTGCCGCGGCCAAGGGTCCAGCGCAGCTGGCCCACCTTCAGAGCCCTGTTACTGCACC  1036

Query  995  GCTACGTGGTGGCGCGGGTGATCTGGGCCGACATGCTCTCCATCGCCGTGACCTACTTCATCACGCTGTGCCTG  1068
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCTACGTGGTGGCGCGGGTGATCTGGGCCGACATGCTCTCCATCGCCGTGACCTACTTCATCACGCTGTGCCTG  1110

Query 1069  TTCCCCGGCCTCGAGTCTGAGATCCGCCACTGCATCCTGGGCGAGTGGCTGCCCATCCTCATCATGGCTGTGTT  1142
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTCCCCGGCCTCGAGTCTGAGATCCGCCACTGCATCCTGGGCGAGTGGCTGCCCATCCTCATCATGGCTGTGTT  1184

Query 1143  CAACCTGTCAGACTTCGTGGGCAAGATCCTGGCAGCCCTGCCCGTGGACTGGCGGGGCACCCACCTGCTGGCCT  1216
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAACCTGTCAGACTTCGTGGGCAAGATCCTGGCAGCCCTGCCCGTGGACTGGCGGGGCACCCACCTGCTGGCCT  1258

Query 1217  GCTCCTGCCTGCGTGTGGTCTTCATCCCCCTCTTCATCCTGTGCGTCTACCCCAGCGGCATGCCCGCCCTCCGT  1290
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCTCCTGCCTGCGTGTGGTCTTCATCCCCCTCTTCATCCTGTGCGTCTACCCCAGCGGCATGCCCGCCCTCCGT  1332

Query 1291  CACCCCGCCTGGCCCTGCATCTTCTCACTGCTCATGGGCATCAGCAACGGCTACTTCGGCAGCGTGCCCATGAT  1364
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CACCCCGCCTGGCCCTGCATCTTCTCACTGCTCATGGGCATCAGCAACGGCTACTTCGGCAGCGTGCCCATGAT  1406

Query 1365  CCTGGCGGCAGGCAAAGTGAGCCCCAAGCAGCGGGAGCTGGCAGGGAACACCATGACCGTGTCCTACATGTCAG  1438
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCTGGCGGCAGGCAAAGTGAGCCCCAAGCAGCGGGAGCTGGCAGGGAACACCATGACCGTGTCCTACATGTCAG  1480

Query 1439  GGCTGACGCTGGGGTCCGCCGTGGCCTACTGCACCTACAGCCTCACCCGCGACGCTCACGGCAGCTGCCTGCAC  1512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGCTGACGCTGGGGTCCGCCGTGGCCTACTGCACCTACAGCCTCACCCGCGACGCTCACGGCAGCTGCCTGCAC  1554

Query 1513  GCCTCCACCGCCAATGGTTCCATCCTCGCAGGCCTC  1548
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Sbjct 1555  GCCTCCACCGCCAATGGTTCCATCCTCGCAGGCCTC  1590