Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13440
• Subject: XM_006504706.2
• Aligned Length: 1608
• Identities: 1307
• Gaps: 84

Alignment

Query    1  ATGGGCTCCGTGGGGAGCCAGCGCCTTGAGGAGCCCAGCGTGGCAGGCACACCAGACCCGGGCGTAGTGATGAG  74
            ||||||||..|.||.|||||||||||..||||||||.|||||||||.||||.|.||||.|.|.||.||||..||
Sbjct    1  ATGGGCTCTATCGGAAGCCAGCGCCTCAAGGAGCCCTGCGTGGCAGCCACATCTGACCAGAGTGTGGTGACAAG  74

Query   75  CTTCACCTTCGACAGTCACCAGCTGGAGGAGGCGGCGGAGGCGGCTCAGG-GCCAGGGCCTTAGGGCCAGGGGC  147
            |||.|.|||.||||....||||||||||..|.|.||.||||.|||||||| .||| |||.|.||.|.||||||.
Sbjct   75  CTTTAGCTTTGACAACTTCCAGCTGGAGACGACAGCAGAGGGGGCTCAGGATCCA-GGCATCAGAGTCAGGGGT  147

Query  148  GTCCCAGCTTTCACGGATACTACATTGGACGAGCCAGTGCCCGATGACCGTTATCACGCCATCTACTTTGCGAT  221
            |||||..|||||||.||..||.|..|.||.|||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||
Sbjct  148  GTCCCCACTTTCACAGACTCTGCGGTAGAGGAGCCTGTGCCAGATGACCGCTACCATGCCATCTACTTTGCCAT  221

Query  222  GCTGCTGGCTGGCGTGGGCTTCCTGCTGCCATACAACAGCTTCATCACGGACGTGGACTACCTGCATCACAAGT  295
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct  222  GCTGCTGGCTGGCGTGGGCTTCCTACTGCCATACAACAGCTTTATCACCGATGTCGACTATCTTCACCACAAGT  295

Query  296  ACCCAGGGACCTCCATCGTGTTTGACATGAGCCTCACCTACATCTTGGTGGCACTGGCAGCTGTCCTCCTGAAC  369
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||.||||||||.||||.|||||.|||||.|||
Sbjct  296  ACCCAGGGACCTCCATCGTATTTGACATGAGCCTCACCTATATCCTGGTGGCATTGGCGGCTGTGCTCCTAAAC  369

Query  370  AACGTCCTGGTGGAGAGACTGACCCTGCACACCAGGATCACC--------------------------------  411
            |||||..||||||||||..|||.|||||||||||||||||||                                
Sbjct  370  AACGTTGTGGTGGAGAGGTTGAACCTGCACACCAGGATCACCACAGGCTACCTCCTCGCCTTGGGTCCCTTGCT  443

Query  412  -----GCAGCATCTGCGACGTGTGGCTGCAGCTCTTCTCTCGGGACCAGGCCTACGCCATCAACCTGGCCGCTG  480
                 .||||||.|||||.||||||||||||||||||||||..||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  444  CTTTATCAGCATATGCGATGTGTGGCTGCAGCTCTTCTCTCACGACCAGGCTTACGCCATCAACCTGGCCGCCG  517

Query  481  TGGGCACCGTGGCCTTCGGCTGCA-----CAGCAATCCAGCTTCTACGGGTACACGGGGATGCTGCCCAAGCGG  549
            |||||||.||||||||.||.||||     ||||||||.||||||||.||.||||||||..|.|||||||||.||
Sbjct  518  TGGGCACTGTGGCCTTTGGTTGCACAGTGCAGCAATCTAGCTTCTATGGCTACACGGGATTACTGCCCAAGAGG  591

Query  550  TACACGCAGGGGGTGATGACCGGGGAGAGCACGGCGGGCGTGATGATCTCTCTGAGCCGCATCCTCACGAAGCT  623
            |||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct  592  TACACGCAGGGTGTGATGACTGGAGAGAGCACGGCAGGGGTGATGATCTCTCTGAGTCGAATCCTCACTAAGCT  665

Query  624  GCTGCTGCCCGACGAGCGCGCCAGCACGCTCATCTTCTTCCTGGTGTCGGTGGCG--CTGGAGCTGCTGTGTTT  695
            ||||||.||.||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||  ||.||  .|||||||.|||||.||
Sbjct  666  GCTGCTCCCGGACGAGCGGGCCAGCACCATCATCTTCTTCCTGGTGTC--TGCCGGCTTGGAGCTCCTGTGCTT  737

Query  696  CCTGCTGCACCTGTTAGTGCGGCGCAGCCGCTTCGTGCTCTTCTATACCACACGGCCGCGTGACAGCCACCGGG  769
            |||||||||.|||.|.||||||||||||||.||.|||||||.|||||||||.|||||.||||||||||.||   
Sbjct  738  CCTGCTGCATCTGCTGGTGCGGCGCAGCCGTTTTGTGCTCTACTATACCACTCGGCCCCGTGACAGCCGCC---  808

Query  770  GCAGGCCAGGCCTGGGCAGGGGCTATGGCTACCGCGTGCACCACGACGTTGTCG---CCGGGGACGTCCACTTC  840
             |.|.||||||              .||||||||.|||||||||||   |||||   ||||.|||.|||||||.
Sbjct  809  -CCGTCCAGGC--------------AGGCTACCGAGTGCACCACGA---TGTCGCATCCGGAGACATCCACTTT  864

Query  841  GAGCACCCAGCCCCGGCCCTGGCCCCCAACGAGTCCCCAAAGGACAGCCCAGCCCACGAGGTGAC---CGGCAG  911
            |||||||.|.|.||.|||||..||..||.|..||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||   |.|||.
Sbjct  865  GAGCACCAAACTCCAGCCCTATCCAGCAGCAGGTCCCCGAAGGAGAGCCCGGCCCATGAGGTGACGCACAGCAA  938

Query  912  CGGCGGGGCCTACATGCGCTTTGACGTGCCGCGGCCAAGGGTCCAGCGCAGCTGGCCCACCTTCAGAGCCCTGT  985
            |.|.||||.|||||||||.|||||.|||||.||||||.|.|||.|.||.||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  939  CAGTGGGGTCTACATGCGTTTTGATGTGCCCCGGCCACGAGTCAAACGAAGCTGGCCCACCTTCAGAGCCCTGC  1012

Query  986  TACTGCACCGCTACGTGGTGGCGCGGGTGATCTGGGCCGACATGCTCTCCATCGCCGTGACCTACTTCATCACG  1059
            |..|||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.
Sbjct 1013  TGTTGCACCGATACGTCGTGGCGCGGGTCATCTGGGCCGACATGCTGTCCATTGCGGTAACCTACTTCATTACA  1086

Query 1060  CTGTGCCTGTTCCCCGGCCTCGAGTCTGAGATCCGCCACTGCATCCTGGGCGAGTGGCTGCCCATCCTCATCAT  1133
            |||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||.|.|||||.|||||||||||||||||..|.||
Sbjct 1087  CTGTGCCTGTTTCCGGGCCTGGAGTCCGAGATCCGCCACTGCGTGCTGGGGGAGTGGCTGCCCATCCTGGTGAT  1160

Query 1134  GGCTGTGTTCAACCTGTCAGACTTCGTGGGCAAGATCCTGGCAGCCCTGCCCGTGGACTGGCGGGGCACCCACC  1207
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1161  GGCCGTGTTCAACCTGTCAGACTTTGTGGGCAAGATCCTGGCAGCCCTGCCCGTGGAGTGGCGGGGCACTCACC  1234

Query 1208  TGCTGGCCTGCTCCTGCCTGCGTGTGGTCTTCATCCCCCTCTTCATCCTGTGCGTCTACCCCAGCGGCATGCCC  1281
            ||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.
Sbjct 1235  TGCTCGCCTGCTCTTGCCTGCGTGTGGTCTTCATCCCCCTCTTCATCCTGTGTGTGTACCCCAGTGGCATGCCT  1308

Query 1282  GCCCTCCGTCACCCCGCCTGGCCCTGCATCTTCTCACTGCTCATGGGCATCAGCAACGGCTACTTCGGCAGCGT  1355
            ||||||||.|||||.|||||||||||..|||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1309  GCCCTCCGCCACCCTGCCTGGCCCTGTGTCTTCTCGCTGCTAATGGGCATCAGCAATGGCTACTTTGGCAGTGT  1382

Query 1356  GCCCATGATCCTGGCGGCAGGCAAAGTGAGCCCCAAGCAGCGGGAGCTGGCAGGGAACACCATGACCGTGTCCT  1429
            |||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1383  GCCCATGATCCTGGCAGCTGGAAAAGTGAGCCCCAAGCAGCGGGAACTGGCAGGAAACACCATGACTGTGTCCT  1456

Query 1430  ACATGTCAGGGCTGACGCTGGGGTCCGCCGTGGCCTACTGCACCTACAGCCTCACCCGCGACGCTCACGGCAGC  1503
            |||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 1457  ACATGTCGGGGCTGACCCTGGGCTCTGCTGTGGCCTACTGCACCTACAGCCTCACCCGAGATGCCCACGGCAGC  1530

Query 1504  TGCCTGCA---------CGCCTCCACCGCCAATGGTTCCATCCTCGCAGGCCTC  1548
            |||.|.||         ||||.||.|||||||.|..|||||||..|..||.|.|
Sbjct 1531  TGCTTTCAAACAGCCACCGCCGCCGCCGCCAACGACTCCATCCCTGTCGGTCCC  1584