Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13453
- Subject:
- XM_024452780.1
- Aligned Length:
- 1176
- Identities:
- 858
- Gaps:
- 315
Alignment
Query 1 ATGGCAGGGATCTTAGCCTGGTTCTGGAACGAGAGGTTTTGGCTCCCGCACAATGTCACCTGGGCGGACCTGAA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCAGGGATCTTAGCCTGGTTCTGGAACGAGAGGTTTTGGCTCCCGCACAATGTCACCTGGGCGGACCTGAA 74
Query 75 GAACACGGAGGAGGCCACCTTCCCGCAGGCTGAGGACCTCTATCTCGCTTTTCCCCTGGCCTTCTGTATCTTCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAACACGGAGGAGGCCACCTTCCCGCAGGCTGAGGACCTCTATCTCGCTTTTCCCCTGGCCTTCTGTATCTTCA 148
Query 149 TGGTGCGGCTCATCTTCGAGAGATTTGTAGCCAAACCGTGCGCCATAGCCCTCAACATTCAGGCCAATGGACCA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGGTGCGGCTCATCTTCGAGAGATTTGTAGCCAAACCGTGCGCCATAGCCCTCAACATTCAGGCCAATGGACCA 222
Query 223 CAAATTGCTCCGCCCAATGCCATTCTGGAAAAGGTCTTCACTGCAATTACAAAGCATCCTGATGAAAAGAGATT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAAATTGCTCCGCCCAATGCCATTCTGGAAAAGGTCTTCACTGCAATTACAAAGCATCCTGATGAAAAGAGATT 296
Query 297 GGAAGGCCTCTCCAAGCAACTGGACTGGGATGTTCGAAGCATTCAGCGCTGGTTTCGACAAAGACGCAATCAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAAGGCCTCTCCAAGCAACTGGACTGGGATGTTCGAAGCATTCAGCGCTGGTTTCGACAAAGACGCAATCAGG 370
Query 371 AGAAGCCAAGCACGCTGACGAGGTTCTGTGAGAGCATGTGGAGATTTTCATTTTACCTTTATGTATTTACCTAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGAAGCCAAGCACGCTGACGAGGTTCTGTGAGAGCATGTGGAGATTTTCATTTTACCTTTATGTATTTACCTAC 444
Query 445 GGAGTCAGATTCCTGAAAAAGACCCCCTGGTTGTGGAATACGAGGCATTGCTGGTACAACTACCCCTATCAGCC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGAGTCAGATTCCTGAAAAAGACCCCCTGGTTGTGGAATACGAGGCATTGCTGGTACAACTACCCCTATCAGCC 518
Query 519 ACTCACAACTGACCTTCACTACTATTACATCCTGGAGCTGTCGTTTTATTGGTCTTTGATGTTTTCTCAGTTCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ACTCACAACTGACCTTCACTACTATTACATCCTGGAGCTGTCGTTTTATTGGTCTTTGATGTTTTCTCAGTTCA 592
Query 593 CTGATATCAAAAGAAAGGACTTTGGCATTATGTTCCTGCACCACCTTGTATCTATTTTCTTGATTACCTTTTCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTGATATCAAAAGAAAGGACTTTGGCATTATGTTCCTGCACCACCTTGTATCTATTTTCTTGATTACCTTTTCA 666
Query 667 TATGTCAACAATATGGCCCGAGTAGGAACGCTGGTCCTTTGTCTTCATGATTCAGCTGATGCTCTTCTGGAGGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TATGTCAACAATATGGCCCGAGTAGGAACGCTGGTCCTTTGTCTTCATGATTCAGCTGATGCTCTTCTGGAGGC 740
Query 741 TGCCAAAATGGCAAATTATGCCAAGTTTCAGAAAATGTGTGATCTCCTGTTTGTTATGTTTGCCGTGGTTTTTA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGCCAAAATGGCAAATTATGCCAAGTTTCAGAAAATGTGTGATCTCCTGTTTGTTATGTTTGCCGTGGTTTTTA 814
Query 815 TCACCACACGACTGGGTATATTTCCTCTCTGGGTGTTAAATACCACATTATTTGAAAGCTGGGAGATCGTTGGA 888
|||||||||||||||||||||||||||||||| |.||| || ||
Sbjct 815 TCACCACACGACTGGGTATATTTCCTCTCTGG----------CAACA-------AA----------------GA 855
Query 889 CCTTACCCTTCCTGGTGGGTTTTTAACCTACTGCTATTGCTAGTACAAGGGTTGAACTGCTTCTGGTCTTACTT 962
.||.||
Sbjct 856 GCTAAC-------------------------------------------------------------------- 861
Query 963 GATTGTGAAAATAGCTTGCAAAGCTGTTTCAAGAGGCAAGGCTGGGAAGTGGAACCCTTTACATGTGTCCAAGG 1036
Sbjct 862 -------------------------------------------------------------------------- 861
Query 1037 ATGATCGAAGTGATATTGAGTCTAGCTCAGATGAGGAGGACTCAGAACCTCCGGGAAAGAATCCCCACACTGCG 1110
Sbjct 862 -------------------------------------------------------------------------- 861
Query 1111 ACAACCACCAATGGGACCAGTGGTACCAACGGGTATCTCCTGACTGGCTCCTGCTCCATGGATGAT 1176
Sbjct 862 ------------------------------------------------------------------ 861