Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_13453
Subject:
XM_024452780.1
Aligned Length:
1176
Identities:
858
Gaps:
315

Alignment

Query    1  ATGGCAGGGATCTTAGCCTGGTTCTGGAACGAGAGGTTTTGGCTCCCGCACAATGTCACCTGGGCGGACCTGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGGGATCTTAGCCTGGTTCTGGAACGAGAGGTTTTGGCTCCCGCACAATGTCACCTGGGCGGACCTGAA  74

Query   75  GAACACGGAGGAGGCCACCTTCCCGCAGGCTGAGGACCTCTATCTCGCTTTTCCCCTGGCCTTCTGTATCTTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAACACGGAGGAGGCCACCTTCCCGCAGGCTGAGGACCTCTATCTCGCTTTTCCCCTGGCCTTCTGTATCTTCA  148

Query  149  TGGTGCGGCTCATCTTCGAGAGATTTGTAGCCAAACCGTGCGCCATAGCCCTCAACATTCAGGCCAATGGACCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGTGCGGCTCATCTTCGAGAGATTTGTAGCCAAACCGTGCGCCATAGCCCTCAACATTCAGGCCAATGGACCA  222

Query  223  CAAATTGCTCCGCCCAATGCCATTCTGGAAAAGGTCTTCACTGCAATTACAAAGCATCCTGATGAAAAGAGATT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAAATTGCTCCGCCCAATGCCATTCTGGAAAAGGTCTTCACTGCAATTACAAAGCATCCTGATGAAAAGAGATT  296

Query  297  GGAAGGCCTCTCCAAGCAACTGGACTGGGATGTTCGAAGCATTCAGCGCTGGTTTCGACAAAGACGCAATCAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAAGGCCTCTCCAAGCAACTGGACTGGGATGTTCGAAGCATTCAGCGCTGGTTTCGACAAAGACGCAATCAGG  370

Query  371  AGAAGCCAAGCACGCTGACGAGGTTCTGTGAGAGCATGTGGAGATTTTCATTTTACCTTTATGTATTTACCTAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAAGCCAAGCACGCTGACGAGGTTCTGTGAGAGCATGTGGAGATTTTCATTTTACCTTTATGTATTTACCTAC  444

Query  445  GGAGTCAGATTCCTGAAAAAGACCCCCTGGTTGTGGAATACGAGGCATTGCTGGTACAACTACCCCTATCAGCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGAGTCAGATTCCTGAAAAAGACCCCCTGGTTGTGGAATACGAGGCATTGCTGGTACAACTACCCCTATCAGCC  518

Query  519  ACTCACAACTGACCTTCACTACTATTACATCCTGGAGCTGTCGTTTTATTGGTCTTTGATGTTTTCTCAGTTCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACTCACAACTGACCTTCACTACTATTACATCCTGGAGCTGTCGTTTTATTGGTCTTTGATGTTTTCTCAGTTCA  592

Query  593  CTGATATCAAAAGAAAGGACTTTGGCATTATGTTCCTGCACCACCTTGTATCTATTTTCTTGATTACCTTTTCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGATATCAAAAGAAAGGACTTTGGCATTATGTTCCTGCACCACCTTGTATCTATTTTCTTGATTACCTTTTCA  666

Query  667  TATGTCAACAATATGGCCCGAGTAGGAACGCTGGTCCTTTGTCTTCATGATTCAGCTGATGCTCTTCTGGAGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TATGTCAACAATATGGCCCGAGTAGGAACGCTGGTCCTTTGTCTTCATGATTCAGCTGATGCTCTTCTGGAGGC  740

Query  741  TGCCAAAATGGCAAATTATGCCAAGTTTCAGAAAATGTGTGATCTCCTGTTTGTTATGTTTGCCGTGGTTTTTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCCAAAATGGCAAATTATGCCAAGTTTCAGAAAATGTGTGATCTCCTGTTTGTTATGTTTGCCGTGGTTTTTA  814

Query  815  TCACCACACGACTGGGTATATTTCCTCTCTGGGTGTTAAATACCACATTATTTGAAAGCTGGGAGATCGTTGGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||          |.|||       ||                ||
Sbjct  815  TCACCACACGACTGGGTATATTTCCTCTCTGG----------CAACA-------AA----------------GA  855

Query  889  CCTTACCCTTCCTGGTGGGTTTTTAACCTACTGCTATTGCTAGTACAAGGGTTGAACTGCTTCTGGTCTTACTT  962
            .||.||                                                                    
Sbjct  856  GCTAAC--------------------------------------------------------------------  861

Query  963  GATTGTGAAAATAGCTTGCAAAGCTGTTTCAAGAGGCAAGGCTGGGAAGTGGAACCCTTTACATGTGTCCAAGG  1036
                                                                                      
Sbjct  862  --------------------------------------------------------------------------  861

Query 1037  ATGATCGAAGTGATATTGAGTCTAGCTCAGATGAGGAGGACTCAGAACCTCCGGGAAAGAATCCCCACACTGCG  1110
                                                                                      
Sbjct  862  --------------------------------------------------------------------------  861

Query 1111  ACAACCACCAATGGGACCAGTGGTACCAACGGGTATCTCCTGACTGGCTCCTGCTCCATGGATGAT  1176
                                                                              
Sbjct  862  ------------------------------------------------------------------  861