Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13548
- Subject:
- NM_001012506.5
- Aligned Length:
- 2742
- Identities:
- 2490
- Gaps:
- 249
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGAAATAAGGCCAAGATTGCAAAATGTCCTTTAAGAACAAAAACTGGGCACATTCTAAAATCAACACAAGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TACTTGTATTGGGAGTGAAAAACTTTTGCAAAAGAAGCCAGTTGGTTCAGAAACATCACAGGCAAAAGGTGAAA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AAAATGGAATGACTTTTTCATCCACTAAGGATTTATGTAAACAATGTATAGATAAAGACTGTCTTCATATCCAG 222
Query 1 ---------------------------ATGCAGAAGACTAGAAACACCGTAAATACATCTCTAGTAGGTAAACA 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAAGAGATTTCACCTGCAACCCCTAATATGCAGAAGACTAGAAACACCGTAAATACATCTCTAGTAGGTAAACA 296
Query 48 GAAGCCTCACAAAAAACACATCACAGCTGAAAACATGAAGAGCAGTTTGGTGTGTCTAACACAAGACCAACTAC 121
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAAGCCTCACAAAAAACACATCACAGCTGAAAACATGAAGAGCAGTTTGGTGTGTCTAACACAAGACCAACTAC 370
Query 122 AACAGATTTTGATGACTGTAAACCAAGGAAATAGATCTCTTTCCCTGACTGAGAATGGAAAGGAGGCAAAAAGT 195
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AACAGATTTTGATGACTGTAAACCAAGGAAATAGATCTCTTTCCCTGACTGAGAATGGAAAGGAGGCAAAAAGT 444
Query 196 CAATATAGTCTATATTTAAACAGTATTTCTAATCAGCCAAAGGATGAGAACATTATGGGATTATTCAAAAAAAC 269
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CAATATAGTCTATATTTAAACAGTATTTCTAATCAGCCAAAGGATGAGAACATTATGGGATTATTCAAAAAAAC 518
Query 270 TGAAATGGTTTCATCTGTCCCAGCTGAAAATAAATCTGTCTTAAATGAACATCAGGAGACATCTAAACAGTGTG 343
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGAAATGGTTTCATCTGTCCCAGCTGAAAATAAATCTGTCTTAAATGAACATCAGGAGACATCTAAACAGTGTG 592
Query 344 AGCAAAAAATTGCCATAGAGAATGAATGGAAACCAGCTGATATATTCAGTACTCTGGGGGAAAGGGAATGTGAT 417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGCAAAAAATTGCCATAGAGAATGAATGGAAACCAGCTGATATATTCAGTACTCTGGGGGAAAGGGAATGTGAT 666
Query 418 AGAAGTTCGTTGGAAGCAAAAAAAGCCCAGTGGAGGAAAGAGCTAGATGAACAGGTTGCTTTAAAGAAGAAAGA 491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGAAGTTCGTTGGAAGCAAAAAAAGCCCAGTGGAGGAAAGAGCTAGATGAACAGGTTGCTTTAAAGAAGAAAGA 740
Query 492 AAAAGAAGTTTCTGAAAAATGGAATGATCCTTGGAAAAAATCTGAAAGTGATAAAATAATATGGGAAAAACATC 565
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AAAAGAAGTTTCTGAAAAATGGAATGATCCTTGGAAAAAATCTGAAAGTGATAAAATAATATGGGAAAAACATC 814
Query 566 AAATTCTTGACCAATCTAGGGAAACAGTACTGCTGGAGCACCCTTTCAGTGCTGTGAAACAAGAACTGCAGAGA 639
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 815 AAATTCTTGACCAATCTAGGGAAACAGTACTGCTGGAGCACCCTTTCAGTGCTGTGAAACAAGAACTGCAAAGA 888
Query 640 AAATGGATTGAAGAGTTGAATAAGCAAATAGAAGATGACCGTCAAAGAAAAATAGAGGAAAAAATTATATATTC 713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAATGGATTGAAGAGTTGAATAAGCAAATAGAAGATGACCGTCAAAGAAAAATAGAGGAAAAAATTATATATTC 962
Query 714 AAAGGGTGAGGAACATGACAGATGGGCAATGCACTTTGATTCATTAAAGAGTTATCCTGGTTCTCAATCTCAGC 787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AAAGGGTGAGGAACATGACAGATGGGCAATGCACTTTGATTCATTAAAGAGTTATCCTGGTTCTCAATCTCAGC 1036
Query 788 TGTTCTCTCGGTCAACACACAAACAACCTGAGTACTTCTGTGTCTCTCCTGACACTCAGGAGCTGGCTGATGTC 861
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGTTCTCTCAGTCAACACACAAACAACCTGAGTACTTCTGTGTCTCTCCTGACACTCAGGAGCTGGCTGATGTC 1110
Query 862 AGCAGTGTTTGTACACCTACAACCGGAAGCCAGGTTGAACCTTCAGAGGAGGAGCATATAGCAAAACCTATTAA 935
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGCAGTGTTTGTACACCTACAACCGGAAGCCAGGTTGAACCTTCAGAGGAGGAGCATATAGCAAAACCTATTAA 1184
Query 936 GGATGTGGTTATGGCAAACAGTAAGAAAACAAACTTTCTCCGTTCTATGACTGCTCTCTTGGACCCAGCTCAGA 1009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGATGTGGTTATGGCAAACAGTAAGAAAACAAACTTTCTCCGTTCTATGACTGCTCTCTTGGACCCAGCTCAGA 1258
Query 1010 TTGAGGAACGAGACAGACAACGACAAAAACAATTAGAGCATCAGAAAGCCATCACTGCCCAGGTAGAAGAGAAG 1083
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TTGAGGAACGAGACAGACGACGACAAAAACAATTAGAGCATCAGAAAGCCATCACTGCCCAGGTAGAAGAGAAG 1332
Query 1084 CGCAGGAAGAAACAACTGGAGGAAGAGCAAAGAAAGAAGGAAGAACAAGAAGAGGAGCTTCGCTTAGCACAGGA 1157
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CGCAGGAAGAAACAACTGGAGGAAGAGCAAAGAAAGAAGGAAGAACAAGAAGAGGAGCTTCGCTTAGCACAGGA 1406
Query 1158 ACGTGAAGAGATGCAGAAACAGTATGAAGAAGACATACTTAAGCAAAAACAAAAGGAAGAAATCATGACTCTCA 1231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ACGTGAAGAGATGCAGAAACAGTATGAAGAAGACATACTTAAGCAAAAACAAAAGGAAGAAATCATGACTCTCA 1480
Query 1232 AGACAAATGAGCTATTCCAGACAATGCAGCGAGCACAGGAACTGGCACAGAGACTAAAACAAGAACAAAGAATC 1305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGACAAATGAGCTATTCCAGACAATGCAGCGAGCACAGGAACTGGCACAGAGACTAAAACAAGAACAAAGAATC 1554
Query 1306 CGAGAATTGGCGCAAAAGGGACATGACACTTCTAGACTGATTAAAAATCTTGGTGTTGATACAATACAAATGGA 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CGAGAATTGGCGCAAAAGGGACATGACACTTCTAGACTGATTAAAAATCTTGGTGTTGATACAATACAAATGGA 1628
Query 1380 ATATAATGCATCTAACATTTCAAATTCAAGACATGATTCTGATGAAATCAGTGGTAAAATGAATACATATATGA 1453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ATATAATGCATCTAACATTTCAAATTCAAGACATGATTCTGATGAAATCAGTGGTAAAATGAATACATATATGA 1702
Query 1454 ATTCTACGACTTCTAAGAAGGATACTGGTGTGCAAACAGATGACTTAAATATAGGAATATTCACCAATGCAGAA 1527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ATTCTACGACTTCTAAGAAGGATACTGGTGTGCAAACAGATGACTTAAATATAGGAATATTCACCAATGCAGAA 1776
Query 1528 TCACATTGTGGATCATTAATGGAGAGGGACATCACAAATTGTTCATCTCCTGAGATTTCGGCAGAACTTATTGG 1601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TCACATTGTGGATCATTAATGGAGAGGGACATCACAAATTGTTCATCTCCTGAGATTTCGGCAGAACTTATTGG 1850
Query 1602 ACAGTTTAGCACCAAGAAAAACAAGCAAGAACTAACTCAGGATAAAGGAGCCAGCTTAGAAAAAGAAAACAATC 1675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ACAGTTTAGCACCAAGAAAAACAAGCAAGAACTAACTCAGGATAAAGGAGCCAGCTTAGAAAAAGAAAACAATC 1924
Query 1676 GGTGTAATGACCAGTGTAATCAGTTCACAAGAATAGAGAAACAAACAAAACACATGAAGAAATATCCTAAAAGG 1749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GGTGTAATGACCAGTGTAATCAGTTCACAAGAATAGAGAAACAAACAAAACACATGAAGAAATATCCTAAAAGG 1998
Query 1750 CCTGATTGGAATATAAATAAGCCACCTAAAAGGTATATTCCAGCATCAGAAAAGTACCCTAAACAGCTTCAAAA 1823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CCTGATTGGAATATAAATAAGCCACCTAAAAGGTATATTCCAGCATCAGAAAAGTACCCTAAACAGCTTCAAAA 2072
Query 1824 GCAGAGAGAAGAAAAAAAAGTAAGGAGGCAGATGGAATTGCTTCATTTGGTAGAAAAAAATAATCCTGGGCACC 1897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GCAGAGAGAAGAAAAAAAAGTAAGGAGGCAGATGGAATTGCTTCATTTGGTAGAAAAAAATAATCCTGGGCACC 2146
Query 1898 TCTCTCAAAACAGAGGCATTTCACCAGAAATTTTTCATTCATCTCATCAAGAAACGGAGTCAAAGTTGAGGTGG 1971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TCTCTCAAAACAGAGGCATTTCACCAGAAATTTTTCATTCATCTCATCAAGAAACGGAGTCAAAGTTGAGGTGG 2220
Query 1972 CATCTAGTCAAAAAGGAAGAAGAGCCTCTGAATATTCATTCATTCAGCAAGGAAAGGTCTCCATCATCACCAGT 2045
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CATCTAGTCAAAAAGGAAGAAGAGCCTCTGAATATTCATTCATTCAGCAAGGAAAGGTCTCCATCATCACCAGT 2294
Query 2046 TCCAGTAGTGAAAAACAGAACCCAACAAACTCAAAATACATTACATTTACCACTAAAAAACAGTAGCTATGAGA 2119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TCCAGTAGTGAAAAACAGAACCCAACAAACTCAAAATACATTACATTTACCACTAAAAAACAGTAGCTATGAGA 2368
Query 2120 GAGAGAATTTGATCTCAGGAAGTAATCAAACAGAATTATCATCTGGGATTTCTGAATCATCCCATTTTATTCCG 2193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 GAGAGAATTTGATCTCAGGAAGTAATCAAACAGAATTATCATCTGGGATTTCTGAATCATCCCATTTTATTCCG 2442
Query 2194 TATGTTCGAACAAATGAGATCTATTACCTTGATCCCGATGCACCATTGTCTGGGCCTTCAACCCAGGACCCTCA 2267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 TATGTTCGAACAAATGAGATCTATTACCTTGATCCCGATGCACCATTGTCTGGGCCTTCAACCCAGGACCCTCA 2516
Query 2268 GTACCAAAATTCACAAGACTGTGGCCAAAAACGACAGCTATTTGATTCTGACTGTGTCAGGGATCCACTTCTTA 2341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GTACCAAAATTCACAAGACTGTGGCCAAAAACGACAGCTATTTGATTCTGACTGTGTCAGGGATCCACTTCTTA 2590
Query 2342 ATCCTAACATGGTGAAAAATAGGGATCGACAGCAAGCAATCCTTAAGGGACTTTCAGAACTGAGACAGGGCCTT 2415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 ATCCTAACATGGTGAAAAATAGGGATCGACAGCAAGCAATCCTTAAGGGACTTTCAGAACTGAGACAGGGCCTT 2664
Query 2416 CTCCAGAAGCAAAAGGAGTTGGAAAGTAGTCTCCTGCCTTTAGCTGAAAATCAAGAAGAGAGTTTTGGTTCTTC 2489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CTCCAGAAGCAAAAGGAGTTGGAAAGTAGTCTCCTGCCTTTAGCTGAAAATCAAGAAGAGAGTTTTGGTTCTTC 2738
Query 2490 ATTT 2493
||||
Sbjct 2739 ATTT 2742