Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_13548
Subject:
NM_001353155.1
Aligned Length:
948
Identities:
780
Gaps:
167

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MNLGDGLKLETELLDGKTKLILSPYEHKSKISVKMGNKAKIAKCPLRTKTGHILKSTQDTCIGSEKLLQKKPVG  74

Query   1  -------------------------------------------MQKTRNTVNTSLVGKQKPHKKHITAENMKSS  31
                                                      |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  SETSQAKGEKNGMTFSSTKDLCKQCIDKDCLHIQKEISPATPNMQKTRNTVNTSLVGKQKPHKKHITAENMKSS  148

Query  32  LVCLTQDQLQQILMTVNQGNRSLSLTENGKEAKSQYSLYLNSISNQPKDENIMGLFKKTEMVSSVPAENKSVLN  105
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  LVCLTQDQLQQILMTVNQGNRSLSLTENGKEAKSQYSLYLNSISNQPKDENIMGLFKKTEMVSSVPAENKSVLN  222

Query 106  EHQETSKQCEQKIAIENEWKPADIFSTLGERECDRSSLEAKKAQWRKELDEQVALKKKEKEVSEKWNDPWKKSE  179
           ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  EHQETSKQ-------ENEWKPADIFSTLGERECDRSSLEAKKAQWRKELDEQVALKKKEKEVSEKWNDPWKKSE  289

Query 180  SDKIIWEKHQILDQSRETVLLEHPFSAVKQELQRKWIEELNKQIEDDRQRKIEEKIIYSKGEEHDRWAMHFDSL  253
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
Sbjct 290  SDKIIWEKHQILDQSRETVLLEHPFSAVKQELQRKWIEELNKQIEDDRQRKIEEKIIYSK--------------  349

Query 254  KSYPGSQSQLFSRSTHKQPEYFCVSPDTQELADVSSVCTPTTGSQVEPSEEEHIAKPIKDVVMANSKKTNFLRS  327
                                        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 350  -----------------------------ELADVSSVCTPTTGSQVEPSEEEHIAKPIKDVVMANSKKTNFLRS  394

Query 328  MTALLDPAQIEERDRQRQKQLEHQKAITAQVEEKRRKKQLEEEQRKKEEQEEELRLAQEREEMQKQYEEDILKQ  401
           |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 395  MTALLDPAQIEERDRRRQKQLEHQKAITAQVEEKRRKKQLEEEQRKKEEQEEELRLAQEREEMQKQYEEDILKQ  468

Query 402  KQKEEIMTLKTNELFQTMQRAQELAQRLKQEQRIRELAQKGHDTSRLIKNLGVDTIQMEYNASNISNSRHDSDE  475
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 469  KQKEEIMTLKTNELFQTMQRAQELAQRLKQEQRIRELAQKGHDTSRLIKNLGVDTIQMEYNASNISNSRHDSDE  542

Query 476  ISGKMNTYMNSTTSKKDTGVQTDDLNIGIFTNAESHCGSLMERDITNCSSPEISAELIGQFSTKKNKQELTQDK  549
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 543  ISGKMNTYMNSTTSKKDTGVQTDDLNIGIFTNAESHCGSLMERDITNCSSPEISAELIGQFSTKKNKQELTQDK  616

Query 550  GASLEKENNRCNDQCNQFTRIEKQTKHMKKYPKRPDWNINKPPKRYIPASEKYPKQLQKQREEKKVRRQMELLH  623
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 617  GASLEKENNRCNDQCNQFTRIEKQTKHMKKYPKRPDWNINKPPKRYIPASEKYPKQLQKQREEKKVRRQMELLH  690

Query 624  LVEKNNPGHLSQNRGISPEIFHSSHQETESKLRWHLVKKEEEPLNIHSFSKERSPSSPVPVVKNRTQQTQNTLH  697
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 691  LVEKNNPGHLSQNRGISPEIFHSSHQETESKLRWHLVKKEEEPLNIHSFSKERSPSSPVPVVKNRTQQTQNTLH  764

Query 698  LPLKNSSYERENLISGSNQTELSSGISESSHFIPYVRTNEIYYLDPDAPLSGPSTQDPQYQNSQDCGQKRQLFD  771
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 765  LPLKNSSYERENLISGSNQTELSSGISESSHFIPYVRTNEIYYLDPDAPLSGPSTQDPQYQNSQDCGQKRQLFD  838

Query 772  SDCVRDPLLNPNMVKNRDRQQAILKGLSELRQGLLQKQKELESSLLPLAENQEESFGSSF  831
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839  SDCVRDPLLNPNMVKNRDRQQAILKGLSELRQGLLQKQKELESSLLPLAENQEESFGSSF  898