Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13563
• Subject: NM_028903.2
• Aligned Length: 1479
• Identities: 1033
• Gaps: 285

Alignment

Query    1  ATGGAGAACAAAGCTATGTACCTACACACCGTCAGCGACTGTGACACCAGCTCCATCTGTGAGGATTCCTTTGA  74
            |||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||.||||||.|.|||||||||.|||.||..|||||||
Sbjct    1  ATGGACAACAAAGCCATGTACCTGCACACCGTGAGTGACCGTGACAACGGCTCCATCTTTGAAGAACCCTTTGA  74

Query   75  TGGCAGGAGCCTGTCCAAGCTGAACCTGTGTGAGGATGGTCCATGTCACAAACGGCGGGCAAGCATCTGCTGTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|...||||||||
Sbjct   75  TGGCAGGAGCCTGTCCAAGCTGAACCTGTGTGAGGATGGTCCATGTCACAAACGGCGGGCGGGAGGCTGCTGTA  148

Query  149  CCCAGCTGGGGTCCCTGTCGGCCCTGAAGCATGCTGTCCTGGGGCTCTACCTGCTGGTCTTCCTGATTCTTGTG  222
            |.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CACAGCTGGGCTCCCTCTCAGCGCTGAAGCATGCAGTCCTGGGGCTGTATCTTCTGGTCTTCCTGATTCTTGTG  222

Query  223  GGCATCTTCATCTTAGCAGTGTCCAGGCCGCGCAGCTCCCCTGACGACCTGAAGGCCCTGACTCGCAATGTGAA  296
            ||.|||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.||.|||.|||||||.||||||||.||.||.||
Sbjct  223  GGTATCTTCATCTTAGCAGTGTCCCGGCCTCGAAGCTCCCCAGATGACTTGAAGGCGCTGACTCGGAACGTCAA  296

Query  297  CCGGCTGAATGAGAGCTTCCGGGACTTGCAGCTGCGGCTGCTGCAGGCTCCGCTGCAAGCGGACCTGACGGAGC  370
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||..||||.||.||||||||.||||
Sbjct  297  CCGGCTGAATGAGAGCCTCCGGGACATGCAGCTGCGGCTGCTGCAGGCTCCATTGCAGGCAGACCTGACAGAGC  370

Query  371  AGGTGTGGAAGGTGCAGGACGCGCTGCAGAACCAGTCAGACTCGTTGCTGGCGCTGGCGGGCGCAGTGCAGCGG  444
            |||||||||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||.||||.|||||.|||...||||||.||
Sbjct  371  AGGTGTGGAAGGTTCAGGATGCGCTGCAGAACCAGACAGACTCGTTGTTGGCCCTGGCCGGCTTGGTGCAGAGG  444

Query  445  CTGGAGGGCGCGCTATGGGGGCTGCAGGCGCAGGCGGTGCAGACCGAGCAGGCGGTGGCCCTGCTGCGGGACCG  518
            |||||||||.||||.|||||||||||.||||||||||..|||||.|||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGAGGGCACGCTGTGGGGGCTGCACGCGCAGGCGGCACAGACTGAGCAGGCGATGGCCCTGCTGCGGGACCG  518

Query  519  CACGGGCCAGCAGAGCGACACGGCGCAGCTGGAGCTCTACCAGCTGCAGGTGGAGAGCAACAGTAGCCAGCTGC  592
            .||.||.||||||||.|||.|.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||..|.||||||||.|
Sbjct  519  AACAGGACAGCAGAGTGACTCCGCACAGCTGGAACTCTACCAGCTGCAGGTGGAAAGCAATCGAAGCCAGCTAC  592

Query  593  TGCTGAGGCGCCACGCGGGCCTGCTGGACGGGCTGGCGCGCAGGGTGGGCATCCTGGGCGAGGAGCTGGCCGAC  666
            |||||..|||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||..|||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  593  TGCTGCAGCGCCACGCGGGCCTGCTGGATGGGCTAGCACGCAGGGTGGGGGTCCTGGGGGAGGAGCTGGCTGAC  666

Query  667  GTGGGCGGCGTGCTGCGCGGCCTCAACCACAGCCTGTCCTACGACGTGGCCCTCCACCGCACGCGGCTGCAGGA  740
            ||||||||.|.|||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|||||.||||.|||||
Sbjct  667  GTGGGCGGTGCGCTCCGTGGTCTCAACCACAGCCTGTCCTATGACGTGGCCCTGCACAGCACGTGGCTACAGGA  740

Query  741  CCTGCGGGTGCTGGTGAGCAACGCCAGCGAGGACACGCGCCGCCTGCGCCTGGCGCACGTAGGCATGGAGCTGC  814
            |||||.|||||||||||||||.|||||||..|||||.|||||..||||.||||.||||.|.|.|||||||.|||
Sbjct  741  CCTGCAGGTGCTGGTGAGCAATGCCAGCGCAGACACTCGCCGTATGCGGCTGGTGCACATGGACATGGAGATGC  814

Query  815  AGCTGAAGCAGGAGCTGGCCATGCTCAACGCGGTCACCGAGGACCTGCGCCTCAAGGACTGGGAGCACTCCATC  888
            ||||.||||||||||||||||..|||||||.|||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  815  AGCTCAAGCAGGAGCTGGCCACACTCAACGTGGTGACCGAGGACCTGCGTCTGAAGGACTGGGAACACTCCATC  888

Query  889  GCACTGCGGAACATCTCCCTCGCGAAAGGGCCACCGGGACCCAAAGGTGATCAGGGGGATGAAGGAAAGGAAGG  962
            ||..||.||||||||.||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||..|||||||.|||||.||
Sbjct  889  GCCTTGAGGAACATCACCCTTGCCAAAGGGCCACCGGGACCCAAAGGTGACCAAGGAAATGAAGGGAAGGAGGG  962

Query  963  CAGGCCTGGCATCCCTGGATTGCCTGGACTTCGAGGTCTGCCCGGGGAGAGAGGTACCCCAGGATTGCCCGGGC  1036
            .|.|||.||.|.|||||||.|.||||||..||||||||||||.||.|||||||||..|||||||.||||.||.|
Sbjct  963  AAAGCCAGGTAGCCCTGGACTTCCTGGATCTCGAGGTCTGCCAGGAGAGAGAGGTGACCCAGGACTGCCTGGTC  1036

Query 1037  CCAAGGGCGATGATGGGAAGCTGGGGGCCACAGGACCAATGGGCATGCGTGGGTTCAAAGGTGACCGAGGCCCA  1110
            |||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037  CCAAGGGTGATGATGGGAAGCTAGGGGCTACGGGCCCCATGGGCATGCGCGGATTCAAAGGTGATCGAGGCCCA  1110

Query 1111  AAAGGAGAGAAAGGAGAGAAAGGAGACAGAGCTGG------GGATGCCAGTAAGGACATTCTGCTG--------  1170
            |||||||||||||||||||.||||||.||||||||      ||||..||..|.|   ||||..|||        
Sbjct 1111  AAAGGAGAGAAAGGAGAGAGAGGAGAGAGAGCTGGTGACATGGATTTCACAATG---ATTCGCCTGGTGAATGG  1181

Query 1171  ---------------GGGCCGTG-GGATATGGTGTT----------------GGCACAG-----------GGC-  1200
                           ||||||.| |||   ||||||                |||||||           ||| 
Sbjct 1182  CTCCGGCCCACACCAGGGCCGGGTGGA---GGTGTTCCATGATCGTCGTTGGGGCACAGTGTGTGACGACGGCT  1252

Query 1201  --------------------------------------------------------------------------  1200
                                                                                      
Sbjct 1253  GGGACAAGAAGGACGGGGACGTGGTGTGCCGCATGCTGGGCTTCCACGGGGTTGAGGAGGTGTACCGGACAGCT  1326

Query 1201  --------------------------------------------------------------------------  1200
                                                                                      
Sbjct 1327  CGTTTTGGGCAAGGCACAGGGAGGATTTGGATGGACGATGTGAACTGCAAGGGAACCGAGAGCTCCATCTTCCA  1400

Query 1201  -------------------------------------------------------------------------  1200
                                                                                     
Sbjct 1401  CTGCCAGTTCTCCAAATGGGGGGTGACAAACTGTGGGCATGCTGAGGATGCTGGGGTGACTTGTACTGTCCCC  1473