Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13563
• Subject: NM_173833.6
• Aligned Length: 1490
• Identities: 1186
• Gaps: 295

Alignment

Query    1  ATGGAGAACAAAGCTATGTACCTACACACCGTCAGCGACTGTGACACCAGCTCCATCTGTGAGGATTCCTTTGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAACAAAGCTATGTACCTACACACCGTCAGCGACTGTGACACCAGCTCCATCTGTGAGGATTCCTTTGA  74

Query   75  TGGCAGGAGCCTGTCCAAGCTGAACCTGTGTGAGGATGGTCCATGTCACAAACGGCGGGCAAGCATCTGCTGTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGCAGGAGCCTGTCCAAGCTGAACCTGTGTGAGGATGGTCCATGTCACAAACGGCGGGCAAGCATCTGCTGTA  148

Query  149  CCCAGCTGGGGTCCCTGTCGGCCCTGAAGCATGCTGTCCTGGGGCTCTACCTGCTGGTCTTCCTGATTCTTGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCAGCTGGGGTCCCTGTCGGCCCTGAAGCATGCTGTCCTGGGGCTCTACCTGCTGGTCTTCCTGATTCTTGTG  222

Query  223  GGCATCTTCATCTTAGCAGTGTCCAGGCCGCGCAGCTCCCCTGACGACCTGAAGGCCCTGACTCGCAATGTGAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGCATCTTCATCTTAGCAGTGTCCAGGCCGCGCAGCTCCCCTGACGACCTGAAGGCCCTGACTCGCAATGTGAA  296

Query  297  CCGGCTGAATGAGAGCTTCCGGGACTTGCAGCTGCGGCTGCTGCAGGCTCCGCTGCAAGCGGACCTGACGGAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGGCTGAATGAGAGCTTCCGGGACTTGCAGCTGCGGCTGCTGCAGGCTCCGCTGCAAGCGGACCTGACGGAGC  370

Query  371  AGGTGTGGAAGGTGCAGGACGCGCTGCAGAACCAGTCAGACTCGTTGCTGGCGCTGGCGGGCGCAGTGCAGCGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGTGTGGAAGGTGCAGGACGCGCTGCAGAACCAGTCAGACTCGTTGCTGGCGCTGGCGGGCGCAGTGCAGCGG  444

Query  445  CTGGAGGGCGCGCTATGGGGGCTGCAGGCGCAGGCGGTGCAGACCGAGCAGGCGGTGGCCCTGCTGCGGGACCG  518
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGAGGGCGCGCTGTGGGGGCTGCAGGCGCAGGCGGTGCAGACCGAGCAGGCGGTGGCCCTGCTGCGGGACCG  518

Query  519  CACGGGCCAGCAGAGCGACACGGCGCAGCTGGAGCTCTACCAGCTGCAGGTGGAGAGCAACAGTAGCCAGCTGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACGGGCCAGCAGAGCGACACGGCGCAGCTGGAGCTCTACCAGCTGCAGGTGGAGAGCAACAGTAGCCAGCTGC  592

Query  593  TGCTGAGGCGCCACGCGGGCCTGCTGGACGGGCTGGCGCGCAGGGTGGGCATCCTGGGCGAGGAGCTGGCCGAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCTGAGGCGCCACGCGGGCCTGCTGGACGGGCTGGCGCGCAGGGTGGGCATCCTGGGCGAGGAGCTGGCCGAC  666

Query  667  GTGGGCGGCGTGCTGCGCGGCCTCAACCACAGCCTGTCCTACGACGTGGCCCTCCACCGCACGCGGCTGCAGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGGGCGGCGTGCTGCGCGGCCTCAACCACAGCCTGTCCTACGACGTGGCCCTCCACCGCACGCGGCTGCAGGA  740

Query  741  CCTGCGGGTGCTGGTGAGCAACGCCAGCGAGGACACGCGCCGCCTGCGCCTGGCGCACGTAGGCATGGAGCTGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTGCGGGTGCTGGTGAGCAACGCCAGCGAGGACACGCGCCGCCTGCGCCTGGCGCACGTAGGCATGGAGCTGC  814

Query  815  AGCTGAAGCAGGAGCTGGCCATGCTCAACGCGGTCACCGAGGACCTGCGCCTCAAGGACTGGGAGCACTCCATC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGCTGAAGCAGGAGCTGGCCATGCTCAACGCGGTCACCGAGGACCTGCGCCTCAAGGACTGGGAGCACTCCATC  888

Query  889  GCACTGCGGAACATCTCCCTCGCGAAAGGGCCACCGGGACCCAAAGGTGATCAGGGGGATGAAGGAAAGGAAGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCACTGCGGAACATCTCCCTCGCGAAAGGGCCACCGGGACCCAAAGGTGATCAGGGGGATGAAGGAAAGGAAGG  962

Query  963  CAGGCCTGGCATCCCTGGATTGCCTGGACTTCGAGGTCTGCCCGGGGAGAGAGGTACCCCAGGATTGCCCGGGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGGCCTGGCATCCCTGGATTGCCTGGACTTCGAGGTCTGCCCGGGGAGAGAGGTACCCCAGGATTGCCCGGGC  1036

Query 1037  CCAAGGGCGATGATGGGAAGCTGGGGGCCACAGGACCAATGGGCATGCGTGGGTTCAAAGGTGACCGAGGCCCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCAAGGGCGATGATGGGAAGCTGGGGGCCACAGGACCAATGGGCATGCGTGGGTTCAAAGGTGACCGAGGCCCA  1110

Query 1111  AAAGGAGAGAAAGGAGAGAAAGGAGACAGAGCTGGGGATGCCAGT------AAGGAC---ATTCTGCTGGGGCC  1175
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      .|||.|   ||..||.|    ||
Sbjct 1111  AAAGGAGAGAAAGGAGAGAAAGGAGACAGAGCTGGGGATGCCAGTGGCGTGGAGGCCCCGATGATGAT----CC  1180

Query 1176  G--TGG-GATATGG----TGTTGGCAC-AGGGC-----------------------------------------  1200
            |  ||| || ||||    .||..|||| |||||                                         
Sbjct 1181  GCCTGGTGA-ATGGCTCAGGTCCGCACGAGGGCCGCGTGGAAGTGTACCACGACCGGCGTTGGGGCACCGTGTG  1253

Query 1201  --------------------------------------------------------------------------  1200
                                                                                      
Sbjct 1254  TGACGACGGCTGGGACAAGAAGGACGGAGACGTGGTGTGCCGCATGCTCGGCTTCCGCGGTGTGGAGGAGGTGT  1327

Query 1201  --------------------------------------------------------------------------  1200
                                                                                      
Sbjct 1328  ACCGCACAGCTCGATTCGGGCAAGGCACTGGGAGGATCTGGATGGATGACGTTGCCTGCAAGGGCACAGAGGAA  1401

Query 1201  --------------------------------------------------------------------------  1200
                                                                                      
Sbjct 1402  ACCATCTTCCGCTGCAGCTTCTCCAAATGGGGGGTGACAAACTGTGGACATGCCGAAGATGCCAGCGTGACATG  1475

Query 1201  ----------  1200
                      
Sbjct 1476  CAACAGACAC  1485